最普遍的保护法是新建一个文件夹或文件，并将之重新命名为AUTORUN.INF。这个方法会让恶意软件在使用者未执行动作的状况下自动执行系统。如果在感染前就已先制作这样一个档案，原则上会让破坏程序无法以此方式自动执行。
不过这个方法并不完善，破坏程序会侦测并删除现存的AUTORUN.INF，并以恶意版本的文件取代，这就让使用者自己进行的防护失去效益。但是如果使用文件权限方式来限制变动，那么就可以更加有效地保护AUTORUN.INF文件。
注意：务必确认你的外接硬盘为NTFS格式化，因为这个程序使用的是特殊的NTFS功能。如果你的移动硬盘是以FAT或FAT32来格式化的，就需要先将硬盘上所有的数据先行备份，再重新以NTFS来格式化。这些操作将需要配合Windows Vista或Windows 7。
在移动硬盘的根目录上新建一个文件夹，把它命名为“AUTORUN.INF”。在同一个位置上新建另外四个文件夹，分别命名为“recycle”、“recycler”、“recycled”和“setup”。
注意：recycle、recycler、recycled和setup这四个文件夹的新建并非必要，但建议使用者建立，因为这些文件也经常被恶意软件所使用。
开启一个命令执行字符（command prompt，cmd.exe），进入移动硬盘的根目录中。使用以下的DOS指令将文件夹归类：
[pre]attrib autorun.inf /s /d –a +s +r [/pre]
使用以下的DOS指令来设定文件夹的特权等级（privilege leve）：
[pre]cacls autorun.inf /c /d administrators [/pre]
在出现“Are you sure(Y/N)”（确定，是/否）时，选择‘Y’然后点击Enter键。
要测试时，可以尝试删除、修改、重新命名、复制或开启文件夹。如果无法执行以上任何一种功能，就表示此程序成功了。
除了上述的程序外，使用者也可选择使用硬件的防护方式。某些移动硬盘配备有外部开关，可预防装置被覆写。这可防止恶意软件对硬盘进行任何设定的修改，包括AUTORUN.INF文件。不过因为这类的开关会造成不便，使用上述的程序仍是比较好的选择。
只要保护好你的移动硬盘，就可以避免让各类威胁继续繁衍。