（转载）Ubuntu 安装GNU Scientific library（GSL）

 

背景：

Blei的hlda的C语言实现需要使用C语言的科学计算包GSL，因此决定安装。由于在windows下安装极其繁琐，先在Linux上安装之。

系统环境：

Linux version 2.6.35-22-generic (buildd@allspice) 

(gcc version 4.4.5 (Ubuntu/Linaro 4.4.4-14ubuntu4) ) 

#33-Ubuntu SMP Sun Sep 19 20:32:27 UTC 2010

gsl安装过程

1, 下载 gsl-2.0.tar.gz

http://ftp.club.cc.cmu.edu/pub/gnu/gsl/

2, 安装

tar -zxvf gsl-2.0.tar.gz 

cd gsl-2.0

sudo ./configure

sudo make

sudo make install

执行最后一个命令之后会有很多现实，其中有：

Libraries have been installed in:
   /usr/local/lib

If you ever happen to want to link against installed libraries
in a given directory, LIBDIR, you must either use libtool, and
specify the full pathname of the library, or use the `-LLIBDIR'
flag during linking and do at least one of the following:
   - add LIBDIR to the `LD_LIBRARY_PATH' environment variable
     during execution
   - add LIBDIR to the `LD_RUN_PATH' environment variable
     during linking
   - use the `-Wl,--rpath -Wl,LIBDIR' linker flag
   - have your system administrator add LIBDIR to `/etc/ld.so.conf'

See any operating system documentation about shared libraries for
more information, such as the ld(1) and ld.so(8) manual pages.

 

一个是libgslcblas.so，libgsl.so的位置很重要，编译后的文件被扔到了这里，比如 /usr/local/lib；另一个重要的位置是

gsl_rng.h 这样的头文件所在的文件夹目录，比如/usr/local/include/gsl。如果想要查找他们，可以使用find / -name gsl_rng.h这样的命令。

3，使用gsl

用gsl写一个例子文件gsl_test.c，这个文件来源于http://www.mas.ncl.ac.uk/~ndjw1/teaching/sim/gsl.html

#include <stdio.h>
#include <gsl_rng.h>
#include <gsl_randist.h>


int main (int argc, char *argv[])
{
  /* set up GSL RNG */
  gsl_rng *r = gsl_rng_alloc(gsl_rng_mt19937);
  /* end of GSL setup */


  int i,n;
  double gauss,gamma;


  n=atoi(argv[1]);
  for (i=0;i<n;i++)
    {
      gauss=gsl_ran_gaussian(r,2.0);
      gamma=gsl_ran_gamma(r,2.0,3.0);
      printf("%2.4f %2.4f
", gauss,gamma);
    }
  return(0);
}

（1）第一反应是直接 gcc gsl_test.c

显示错误是：gsl_test.c:2: fatal error: gsl_rng.h: 没有那个文件或目录

（2）这个错误是说没有找到头文件，然后加上头文件的位置，gcc -I/usr/local/include/gsl gsl_test.c

显示错误是：gsl_test.c:(.text+0x12): undefined reference to `gsl_rng_mt19937' ...

（3）这个错误是说没有找到gsl_rng_mt19937的定义，查看了http://www.daniweb.com/software-development/cpp/threads/289812/cant-link-gsl-properly，这里说需要加上-lgsl，即链接到gsl，找到 libgsl.so.

使用命令：gcc -I/usr/local/include/gsl -lgsl gsl_test.c

（4）显示错误是：//usr/local/lib/libgsl.so: undefined reference to `cblas_ctrmv'

查看了http://sourceware.org/ml/gsl-discuss/2003-q2/msg00123.html，是说错误是由于没有链接libgslcblas.so引起的，再加上-lgslcblas可以解决问题。

使用命令：gcc -I/usr/local/include/gsl -lgsl -lgslcblas gsl_test.c。

或者命令：gcc -I/usr/local/include/gsl -L/usr/local/lib -lgsl -lgslcblas gsl_test.c

（5）实测需要以下命令： gcc -I/usr/local/include/gsl gsl_test.c -lgsl -lgslcblas

这个时候出现了产出物a.out。

（5）运行a.out 

./a.out 出现错误“段错误”

(6)查看源文件，发现还需要输入参数

./a.out 10

结果是：
0.2678 6.9645
3.3488 1.6894
1.9950 2.1575
-4.7934 6.1648
-0.0782 4.0292
1.7871 11.6031
-2.5931 7.7629
0.3634 1.3344
-1.0965 11.1658
0.0142 3.5412

彻底搞定，done#

转自：http://blog.csdn.net/Waleking/article/details/8265008

由于论文数据处理的需要，需要使用libeemd这个包，需要安装gsl科学库，windows下没有办法，只能转战ubuntu进行科学计算。

GSL(GNU Scientific Library)作为三大科学计算库之一，除了涵盖基本的线性代数，微分方程，积分，随机数，组合数，方程求根，多项式求根，排序等，还有模拟退火，快速傅里叶变换，小波，插值，基本样条，最小二乘拟合，特殊函数等

当然最希望通过命令来安装GSL科学库。

方法一：

GSL源码包提供了以下二进制包：

• gsl-bin：GNU Scientific Library (GSL) -- binary package
• libgsl0-dbg: GNU Scientific Library (GSL) -- debug symbols package
• libgsl0-dev: GNU Scientific Library (GSL) -- development package
• libgsl0ldbl: GNU Scientific Library (GSL) -- library package

终端键入以下命令即可安装：

sudo apt-get install libgsl0ldbl

说明：根据不同的需要选择安装不同的版本，使用 gsl-bin 将会安装所有的内容（gsl - bin 依赖 libgsl0ldbl）

方法二：

ubuntu自己编译源码（使用gsl1.6，windows上太麻烦折腾），解压后进入目录，执行：

./configure
make
make install

这个过程需要几分钟。这里还有一点需要注意的是，执行 make install 时，会自动将动态库和头文件分别拷贝到/usr/local/lib和 /usr/local/include 下面，但如果这两个目录没有写权限，就无法创建此二目录，导致安装失败，此时改用 sudo make install或者手动去赋予权限，便能解决此问题。

说明：折腾一圈还是使用前者成功的。

sudo apt-get install libgsl0-dev

参考

• http://www.lancezhange.com/2014/10/24/gsl-in-practice/
• http://www.cnblogs.com/nju2014/p/5334928.html