医院的主要信息子系统，包括医院信息管理系统HIMS，放射科信息系统RIS，图像存档与传输系统PACS，检验信息系统LIS，医学信息传输标准与系统集成，以及临床路径和电子病历等。
医院信息系统一般划分为以下五个部分：临床医疗，药品管理，经济管理，综合管理与统计分析，外部接口。
临床医疗以病人信息为核心，将整个病人诊疗过程作为主线，医院中多有科室将沿此主线展开工作。
药品管理分两部分，一部分是基本部分，包括药库药房及发药管理；另一部分是临床部分，包括合理用药的各种审核及用药咨询与服务。
经济管理主要是与医院中所有发生的费用的那部分有关，包括门急诊挂号，门急诊划价收费，住院病人入，出，转，住院收费，物资，设备，财务与经济核算。
外部接口：与医疗保险系统，社区医疗系统，远程医疗咨询系统等接口。
电子病历的结构：首页，医嘱，病程记录，各种检查检验结果，手术记录，护理信息等等。完整的保存医生的诊断描述，医嘱是自由的，不收价表的约束。
临床应用深入：
临床监护信息系统
手术麻醉信息系统
护理信息系统
电子病历的发展