先看Nginx中的配置
server { listen 443; ssl on; ssl_certificate /usr/local/nginx/conf/任意证书名.crt; ssl_certificate_key /usr/local/nginx/conf/任意私钥名(可带密码，可不带密码).key; }
重要事项:
在生成CSR文件时同时生成您的私钥，如果您丢了私钥或忘了私钥密码，则颁发证书给您后不能安装成功！您必须重新生成私钥和CSR文件，免费重新颁发新的证书。为了避免此情况的发生，请在生成CSR后一定要备份私钥文件和记住私钥密码，最好是在收到证书之前不要再动服务器。 “openssl”用于生成私钥和CSR，OpenSSL一般安装在/user/bin下，如果您的系统安装在其他目录，请指定正确的目录路径。以下所有命令假设您已经成功安装OpenSSL，将产生2048位的密钥，加密算法采用3DES，您必须使用您要申请SSL证书的域名来命名密钥文件。生成key和csr等都可以在任意计算机上生成，只要生成好拷贝到服务器即可。
步骤:
第一种，分步生成私钥和证书请求文件(CSR)
1.生成私钥，此命令将生成2048位的RSA私钥，使用DES3算法，私钥文件名可任意命名，在Nginx配置中指定文件路径即可，会提示设定私钥密码，请设置密码，并牢记！！
openssl genrsa -des3 -out aaaa.key 2048
此时生成的key是有密码的，可以使用如下命令去除密码，此步骤非必要，且需在第2步之后，即必须使用带密码的key来生成csr！
openssl rsa -in aaaa.key -out aaaa_nopwd.key
2.配合已生成的私钥生成证书请求文件(CSR)
openssl req -new -key aaaa.key -out aaaa.csr
PS:第2步命令将提示您输入X.509证书所要求的字段信息，包括国家(中国添CN)、省份、所在城市、单位名称、单位部门名称(可以不填直接回车)。请注意： 除国家缩写必须填CN外，其余都可以是英文或中文。请输入您要申请SSL证书的域名，如果您需要为www.domain.com申请SSL证书就不能只输入domain.com。SSL证书是严格绑定域名的。 请不要输入Email、口令(challenge password)和可选的公司名称(如果输入口令，每次启动服务器都会要求输入密码)，直接打回车即可。 您现在已经成功生成了密钥对，私钥文件：www.yilexun.com.key 保存在您的服务器中， 请把CSR文件：www.yilexun.com.csr 发给证书服务公司(比如StartSSL)即可，各个含义如下:
Country Name (2 letter code): 使用国际标准组织(ISO)国码格式，填写2个字母的国家代号。中国请填写CN。
State or Province Name (full name): 省份，比如填写Shanghai
Locality Name (eg, city): 城市，比如填写Shanghai
Organization Name (eg, company): 组织单位，比如填写公司名称的拼音
Organizational Unit Name (eg, section): 比如填写IT Dept
Common Name (eg, your websites domain name): 行使 SSL 加密的网站地址。请注意这里并不是单指您的域名，而是直接使用 SSL 的网站名称 例如:pay.abc.com。 一个网站这里定义是： abc.com 是一个网站； www.abc.com 是另外一个网站； pay.abc.com 又是另外一个网站。
Email Address: 邮件地址，可以不填
A challenge password: 可以不填
An optional company name: 可以不填
第二种，同时生成私钥和证书请求文件
openssl req -newkey rsa:2048 -keyout aaaa.key -out aaaa.csr
CSR文件必须要有CA的签名才能形成证书，可以将此CSR发给StartSSL(可免费)、verisign(一大笔钱)等地方由他来验证。也可以自己做CA，自己给自己颁发证书。
首先生成CA证书和私钥
openssl req -new -x509 -keyout ca.key -out ca.crt -config openssl.cnf
在继续下面操作前，将openssl.cnf(可以使用locate命令查找)文件打开，查看其dir路径将其修改为dir = /home/openssl/bin/demoCA/，否则下面的步骤会提示路径无法找到。
mkdir -p /home/openssl/bin/demoCA/newcerts touch /home/openssl/bin/demoCA/index.txt echo "01" >> /home/openssl/bin/demoCA/serial
用生成的CA的证书为刚才生成的csr文件签名:
openssl ca -in aaaa.csr -out aaaa.crt -cert ca.crt -keyfile ca.key -config openssl.cnf
这样生成的证书的序列号是01，如果用同一个CA证书重复以上步骤生成不同的server证书，这些证书都会拥有相同的序列号01。
这在Firefox浏览器下会出现SEC_ERROR_REUSED_ISSUER_AND_SERIAL错误。改进办法：
删除demoCA/serial文件，openssl ca后面增加一个参数-create_serial，这样就会生成一个随机的128bits的序列号，基本上能避免上述错误。
aaaa.key、aaaa.csr、aaaa.crt；其中key和crt都是放在服务器上的。