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  • C# 实现寻峰算法的简单优化(包含边峰,最小峰值,峰距)

    核心寻峰算法的原理参考Ronny,链接:投影曲线的波峰查找

    C#翻译原理代码参考sowhat4999,链接:C#翻译Matlab中findpeaks方法 

    前人种树,后人乘凉。感谢原作者详细的解释说明。

     

    这里先把翻译代码贴一下(略微的修改了sowhat4999代码中的几个参数)

    //调用方法
    List<double> data = new List<double>{25, 8, 15, 5, 6, 10, 10, 3, 1, 20, 7};
    List<int> index = getPeaksIndex(trendSign(oneDiff(data)));

    //第一次寻峰(基本峰距为1)算法
    private double[] oneDiff(List<double> data)
    {
         double[] result = new double[data.Count - 1];
         for (int i = 0; i < result.Length; i++)
         {
              result[i] = data[i + 1] - data[i];
         }
         return result;
    }
    
    private int[] trendSign(double[] data)
    {
         int[] sign = new int[data.Length];
         for (int i = 0; i < sign.Length; i++)
         {
              if (data[i] > 0) sign[i] = 1;
              else if (data[i] == 0) sign[i] = 0;
              else sign[i] = -1;
         }
    
         for (int i = sign.Length - 1; i >= 0; i--)
         {
              if (sign[i] == 0 && i == sign.Length - 1)
              {
                   sign[i] = 1;
              }
              else if (sign[i] == 0)
              {
                   if (sign[i + 1] >= 0)
                   {
                        sign[i] = 1;
                   }
                   else
                   {
                        sign[i] = -1;
                   }
              }
          }
          return sign;
    }
    
    private List<int> getPeaksIndex(int[] diff)
    {
         List<int> data = new List<int>();
         for (int i = 0; i != diff.Length - 1; i++)
         {
              if (diff[i + 1] - diff[i] == -2)
              {
                  data.Add(i + 1);
              }
         }
         return data;//相当于原数组的下标
    }

    以上方法并没有将峰距、边锋、峰值情况考虑在内,但已经给与我们后人一个完整的思路。

    峰距情况分析:

    我们可以将上述方法理解为峰距1的寻峰算法,当我们需要完成峰距为2的寻峰情况时我们需要判断

    data[i]是否大于data[i+1],data[i+2],data[i-1],data[i-2]

    同理按照此方法完成点数为100000,峰距为1000的寻峰,则需要进行100000的1000次方次运算,这显然需要花费大量的时间进行运算。

    优化过程中,我们并不能改变峰距(即幂指数1000),但我们可以改变点数(即底数100000)的大小。从而实现运算量的降低。

     以上峰距为1的寻峰方法此时已经完成判断

    data[i]是否大于data[i+1],data[i-1]

    并返还峰值对应的索引列

    峰距为2时,我们只需要再次对索引列中内容进行判断即可(只有在峰距为1的判断中胜出的点,才有可能在峰距为2的判断中胜出)

    data[i]是否大于data[i+2],data[i-2]

    此时你会发现我们需要遍历的底数已经并不是原点数100000,而是上次返还的寻峰序列个数

                // 调用方法
                List<double> Xaxis = new List<double> { 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 };
                List<double> Yaxis = new List<double> { 25, 8, 15, 5, 6, 10, 10, 3, 1, 20, 7 };
                // 峰距
                int DisPeak = 3;
                // 峰距为3时得到的脚标
                List<int> index = getPeaksIndex(trendSign(oneDiff(Yaxis)));
                // 已进行的判断
                int level = 1;
                // 扩大峰距范围范围算法
                while (DisPeak > level)
                {
                    level++;
                    List<int> result = DoPeakInstance(Yaxis, index, level);
                    index = null;
                    index = result;
                }
    
                // 获取两侧满足条件的边峰序列
                index = GetBothSidePeakIndex(Xaxis, Yaxis, 1, index);
    
                double minFZ = 10.0;
                // 根据最小峰值序列进行筛选
                index = FindMinPeakValue(minFZ, Yaxis, index);
            //扩大寻峰范围算法
            private List<int> DoPeakInstance(List<double> data, List<int> index, int level)
            {
                //相当于原数组的下标
                List<int> result = new List<int>();
                for (int i = 0; i < index.Count; i++)
                {
                    //判断是否超出下界和上界
                    if (index[i] - level >= 0 && index[i] + level < data.Count)
                    {
                        if (data[index[i] + level] <= data[index[i]] && data[index[i] - level] <= data[index[i]])
                        {
                            result.Add(index[i]);
                        }
                    }
                }
                return result;
            }

    边锋情况分析:

    仔细阅读上述两算法,你会发现该算法存在一个无法避免的问题 如:

    峰距是3,此时峰首部点序(点0,点1,点2)因无法向前比较,导致并没有参与到峰值计算中。 尾部点则因无法向后比较没有参与到峰值计算中。

    此情况我们首先要清楚,因上述情况未参与比较的点序中,首部最多仅有一个峰值,尾部最多仅有一个峰值。

    那我们把它加上就好了,美滋滋。

            //获取两侧满足条件的边峰序列
            private static List<int> GetBothSidePeakIndex(List<double> Xaxis, List<double> Yaxis, int FJ, List<int> index)
            {
                //获取数据首尾两侧最大峰值(0,FJ)点序和(Date.CountFJ-FJ,Data.Count)点序
                int TopIndex = 0;
                int BottomIndex = Yaxis.Count - 1;
                for (int i = 0; i < FJ; i++)
                {
                    if (Yaxis[i] >= Yaxis[TopIndex])
                    {
                        TopIndex = i;
                    }
                    if (Yaxis[Yaxis.Count - 1 - i] >= Yaxis[BottomIndex])
                    {
                        BottomIndex = Yaxis.Count - 1 - i;
                    }
                }
                //判断是否满足条件检索条件
                int newTopIndex = TopIndex;
                int newBottomIndex = BottomIndex;
                for (int i = 0; i <= FJ; i++)
                {
    
                    if (Yaxis[TopIndex + i] >= Yaxis[TopIndex])
                    {
                        newTopIndex = TopIndex + i;
                    }
                    if (Yaxis[BottomIndex - i] >= Yaxis[BottomIndex])
                    {
                        newBottomIndex = BottomIndex - i;
                    }
                }
                TopIndex = newTopIndex;
                BottomIndex = newBottomIndex;
    
                //添加到结果序列
                if (TopIndex <= FJ && TopIndex != 0)
                {
                    index.Insert(0, TopIndex);
                }
                if (BottomIndex >= BottomIndex - FJ && BottomIndex != Xaxis.Count - 1)
                {
                    index.Add(BottomIndex);
                }
                return index;
            }

    最后,也就是最简单的峰值判断了。比一下就好了。

            //根据最小峰值序列进行筛选
            private static List<int> FindMinPeakValue(double minFZ, List<double> Yaxis, List<int> index)
            {
                List<int> finalresult = new List<int>();
                for (int i = 0; i < index.Count; i++)
                {
                    if (Yaxis[index[i]] >= minFZ)
                    {
                        finalresult.Add(index[i]);
                    }
                }
                index = null;
                index = finalresult;
                return index;
            }
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