C#程序的编译过程，如下图
总结：编译器将C#代码编译成DLL/EXE,DLL/EXE包含metadata（清单数据，对代码的描述）和IL（中间语言），IL（中间语言）经过CLR/JIT第二次编译才是机器码
一，程序的编译过程，步骤理解
1>C#源文件经过CSC.exe把Visual C#程序代码编译成IL文件(这里有很多参数和开关选项,参考 http://blog.chinaunix.net/uid-20715239-id-1219110.html)，编译器编译生成程序集（exe dll）
2>c#代码第一次编译为一种伪代码称微软中间语言(MSIL)和元数据，MSIL和元数据同时储存在exe或dll 文件中，该伪代码是独立于任何CPU 的，所以只要装有.Net FrameWork的机器均可以运行该伪代码，这就增强了c#代码的可移植性。(ps.中间语言IL不是计算机识别语言,此IL文件不能直接被计算机使用)
3>程序执行时，该伪代码被CLR(Commom Language RunTime)捕获，CLR激活内部的 JIT(Just in time)编译器，将伪代码编译成针对特定CPU的机器语言，当然该步还要进行类型检查等，这样程序就能在任意合理的电脑中运行，得出结果。JIT 的意思为“仅在运行时编译”，整个代码的处理过程要编译两次。（PS:从IL文件到机器语言，这个工程是机器自动实现的）
二，JIT（即时编辑)又是什么？
1》JIT：即时编译（Just In-Time compile），这是.NET运行可执行程序的基本方式，也就是在需要运行的时候，才将对应的IL代码编译为本机指令。传入JIT的是IL代码（第一次编译生成的代码），输出的是本机代码（机器能识别的代码），然后把结果保存起来用于将来对同一方法的调用，直到应用程序结束，大大提高了效率，所以部分加密软件通过挂钩JIT来进行IL加密，同时又保证程序正常运行。同解释执行的代码相比，JIT的执行效率要高很多。
2》，当JIT需要再调用这些已经被编译好并存储到代码缓存中的方法时，它不用再去解释执行了，而是可以使用代码缓存中已编译好的汇编代码。这能提升你的应用程序的执行效率，因为使用编译好的代码要比运行时去解释要快得多。（PS:JIT将编译好的代码储存在GAC中）
三，GAC是什么？
1》GAC是Global Assembly Cache，全局程序集缓存的简称。它解决了几个程序共享某一个程序集的问题。不必再将那个被共享的程序集拷贝到应用程序目录了，.NET应用程序在加载的时候，会首先查看全局应用程序集缓存，如果有就可以直接使用，没有再到应用程序目录进行查找。
2》GAC还有一个很重要的作用，所有被放入GAC的程序集都是强名程序集，这样可以保证相同文件名不同版本的程序集被正确的引用，这样解决了COM时代的DLL地狱问题。同时强名还可以防止程序集伪造。
四，Assembly(程序集)是什么？
1》Assembly是一个包含来程序的名称，版本号，自我描述，文件关联关系和文件位置等信息的一个集合。在.net框架中通过Assembly类来支持，该类位于System.Reflection下，物理位置位于：mscorlib.dll。
2》我们可以通过Assembly的信息来获取程序的类，实例等编程需要用到的信息。
五，编译流程
六，托管程序集
