在许多应⽤中,数据可能分散在许多⽂件或数据库中,存储的形式也不利于分析。本章关注可以聚合、合并、重塑数据的⽅法。⾸先,介绍pandas的层次化索引,它⼴泛⽤于以上操作。然后,深⼊介绍了⼀些特殊的数据操作。
一、层次化索引
层次化索引(hierarchical indexing)是pandas的⼀项重要功能,它使你能在⼀个轴上拥有多个(两个以上)索引级别。抽象点说,它使你能以低维度形式处理⾼维度数据。我们先来看⼀个简单的例⼦:创建⼀个Series,并⽤⼀个由列表或数组组成的列表作为索引:
data = pd.Series(np.random.randn(9),
index=[['a', 'a', 'a', 'b', 'b', 'c', 'c', 'd', 'd'],
[1, 2, 3, 1, 3, 1, 2, 2, 3]])
data # 输出如下:
a 1 1.007189
2 -1.296221
3 0.274992
b 1 0.228913
3 1.352917
c 1 0.886429
2 -2.001637
d 2 -0.371843
3 1.669025
dtype: float64
看到的结果是经过美化的带有MultiIndex索引的Series的格式。索引之间的“间隔”表示“直接使⽤上⾯的标签”:
data.index # 输出如下:
MultiIndex(levels=[['a', 'b', 'c', 'd'], [1, 2, 3]],
labels=[[0, 0, 0, 1, 1, 2, 2, 3, 3], [0, 1, 2, 0, 2, 0, 1, 1, 2]])
对于⼀个层次化索引的对象,可以使⽤所谓的部分索引,使⽤它选取数据⼦集的操作更简单:
data['b'] # 输出如下:
1 0.228913
3 1.352917
dtype: float64
data['b':'c'] # 输出如下:
b 1 0.228913
3 1.352917
c 1 0.886429
2 -2.001637
dtype: float64
data.loc[['b', 'd']] # 输出如下:
b 1 0.228913
3 1.352917
d 2 -0.371843
3 1.669025
dtype: float64
有时甚⾄还可以在“内层”中进⾏选取:
data.loc[:, 2] # 输出如下:(选取带2的标签)
a -1.296221
c -2.001637
d -0.371843
dtype: float64
层次化索引在数据重塑和基于分组的操作(如透视表⽣成)中扮演着重要的⻆⾊。例如,可以通过unstack⽅法将这段数据重新安排到⼀个DataFrame中:
data.unstack() # 输出如下:
1 2 3
a 1.007189 -1.296221 0.274992
b 0.228913 NaN 1.352917
c 0.886429 -2.001637 NaN
d NaN -0.371843 1.669025
unstack的逆运算是stack:
data.unstack().stack() # 输出如下:
a 1 1.007189
2 -1.296221
3 0.274992
b 1 0.228913
3 1.352917
c 1 0.886429
2 -2.001637
d 2 -0.371843
3 1.669025
dtype: float64
stack和unstack将在后⾯详细讲解。
对于⼀个DataFrame,每条轴都可以有分层索引:
frame = pd.DataFrame(np.arange(12).reshape((4, 3)),
index=[['a', 'a', 'b', 'b'], [1, 2, 1, 2]],
columns=[['Ohio', 'Ohio', 'Colorado'],
['Green', 'Red', 'Green']])
frame # 输出如下:
Ohio Colorado
Green Red Green
a 1 0 1 2
2 3 4 5
b 1 6 7 8
2 9 10 11
各层都可以有名字(可以是字符串,也可以是别的Python对象)。如果指定了名称,它们就会显示在控制台输出中:
frame.index.names = ['key1', 'key2'] # 设置行索引属性名称
frame.columns.names = ['state', 'color'] # 设置列索引属性名称
frame # 输出如下:
state Ohio Colorado
color Green Red Green
key1 key2
a 1 0 1 2
2 3 4 5
b 1 6 7 8
2 9 10 11
注意:⼩⼼区分索引名state、color与⾏标签。
有了部分列索引,因此可以轻松选取列分组:
frame['Ohio'] # 输出如下:
color Green Red
key1 key2
a 1 0 1
2 3 4
b 1 6 7
2 9 10
可以单独创建MultiIndex然后复⽤。上⾯那个DataFrame中的(带有分级名称)列可以这样创建:
MultiIndex.from_arrays([['Ohio', 'Ohio', 'Colorado'], ['Green', 'Red', 'Green']],
names=['state', 'color'])
1、重排与分级排序
有时,你需要重新调整某条轴上各级别的顺序,或根据指定级别上的值对数据进⾏排序。swaplevel接受两个级别编号或名称,并返回⼀个互换了级别的新对象(但数据不会发⽣变化):
frame.swaplevel('key1', 'key2') # 输出如下:(互换'key1'和'key2')
state Ohio Colorado
color Green Red Green
key2 key1
1 a 0 1 2
2 a 3 4 5
1 b 6 7 8
2 b 9 10 11
⽽sort_index则根据单个级别中的值对数据进⾏排序。交换级别时,常常也会⽤到sort_index,这样最终结果就是按照指定顺序进⾏字⺟排序了:
frame.sort_index(level=1) # 输出如下:(对第二个索引排序('key2'))
state Ohio Colorado
color Green Red Green
key1 key2
a 1 0 1 2
b 1 6 7 8
a 2 3 4 5
b 2 9 10 11
frame.swaplevel(0, 1).sort_index(level=0) # 输出如下:(互换两个索引,对第一个索引排序)
state Ohio Colorado
color Green Red Green
key2 key1
1 a 0 1 2
b 6 7 8
2 a 3 4 5
b 9 10 11
2、根据级别汇总统计
许多对DataFrame和Series的描述和汇总统计都有⼀个level选项,它⽤于指定在某条轴上求和的级别。再以上⾯那个DataFrame为例,我们可以根据⾏或列上的级别来进⾏求和:
frame.sum(level='key2') # 输出如下:(注意level参数后面给的是行索引或列索引的属性名称)
state Ohio Colorado
color Green Red Green
key2
1 6 8 10
2 12 14 16
frame.sum(level='color', axis=1) # 输出如下:(根据相同的颜色(Green,Red)按行求和)
color Green Red
key1 key2
a 1 2 1
2 8 4
b 1 14 7
2 20 10
这其实是利⽤了pandas的groupby功能,稍后将对其进⾏详细讲解。
3、使⽤DataFrame的列进⾏索引
经常要将DataFrame的⼀个或多个列当做⾏索引来⽤,或者可能希望将⾏索引变成DataFrame的列。以下⾯这个DataFrame为例:
frame = pd.DataFrame({'a': range(7), 'b': range(7, 0, -1),
'c': ['one', 'one', 'one', 'two', 'two', 'two', 'two'],
'd': [0, 1, 2, 0, 1, 2, 3]})
frame # 输出如下:
a b c d
0 0 7 one 0
1 1 6 one 1
2 2 5 one 2
3 3 4 two 0
4 4 3 two 1
5 5 2 two 2
6 6 1 two 3
DataFrame的set_index函数会将其⼀个或多个列转换为⾏索引,并创建⼀个新的DataFrame:
frame2 = frame.set_index(['c', 'd']) # c、d列转换为行索引
frame2 # 输出如下:
a b
c d
one 0 0 7
1 1 6
2 2 5
two 0 3 4
1 4 3
2 5 2
3 6 1
默认情况下,那些列会从DataFrame中移除,但也可以将其保留下来:
frame.set_index(['c', 'd'], drop=False) # 输出如下:
a b c d
c d
one 0 0 7 one 0
1 1 6 one 1
2 2 5 one 2
two 0 3 4 two 0
1 4 3 two 1
2 5 2 two 2
3 6 1 two 3
reset_index的功能跟set_index刚好相反,层次化索引的级别会被转移到列⾥⾯:
frame2.reset_index() # 输出如下:
c d a b
0 one 0 0 7
1 one 1 1 6
2 one 2 2 5
3 two 0 3 4
4 two 1 4 3
5 two 2 5 2
6 two 3 6 1
二、合并数据集
pandas对象中的数据可以通过⼀些⽅式进⾏合并:
pandas.merge可根据⼀个或多个键将不同DataFrame中的⾏连接起来。SQL或其他关系型数据库的⽤户对此应该会⽐较熟悉,因为它实现的就是数据库的join操作。
pandas.concat可以沿着⼀条轴将多个对象堆叠到⼀起。实例⽅法combine_first可以将重复数据编接在⼀起,⽤⼀个对象中的值填充另⼀个对象中的缺失值。
接下来对它们进⾏讲解,并给出⼀些例⼦。后面部分的示例中将经常⽤到它们。
1、数据库⻛格的DataFrame合并
数据集的合并(merge)或连接(join)运算是通过⼀个或多个键将⾏链接起来的。这些运算是关系型数据库(基于SQL)的核⼼。pandas的merge函数是对数据应⽤这些算法的主要切⼊点。
以⼀个简单的例⼦开始:
df1 = pd.DataFrame({'key': ['b', 'b', 'a', 'c', 'a', 'a', 'b'], 'data1': range(7)})
df2 = pd.DataFrame({'key': ['a', 'b', 'd'], 'data2': range(3)})
df1 # 输出如下:
key data1
0 b 0
1 b 1
2 a 2
3 c 3
4 a 4
5 a 5
6 b 6
df2 # 输出如下:
key data2
0 a 0
1 b 1
2 d 2
这是⼀种多对⼀的合并。df1中的数据有多个被标记为a和b的⾏,⽽df2中key列的每个值则仅
对应⼀⾏。对这些对象调⽤merge即可得到:
pd.merge(df1,df2) # 输出如下:(合并具有相同的行索引,键的并集)
key data1 data2
0 b 0 1
1 b 1 1
2 b 6 1
3 a 2 0
4 a 4 0
5 a 5 0
注意,我并没有指明要⽤哪个列进⾏连接。如果没有指定,merge就会将重叠列的列名当做键。不过,最好明确指定⼀下:
pd.merge(df1, df2, on='key') # 输出如下:
key data1 data2
0 b 0 1
1 b 1 1
2 b 6 1
3 a 2 0
4 a 4 0
5 a 5 0
如果两个对象的列名不同,也可以分别进⾏指定:
df3 = pd.DataFrame({'lkey': ['b', 'b', 'a', 'c', 'a', 'a', 'b'], 'data1': range(7)})
df4 = pd.DataFrame({'rkey': ['a', 'b', 'd'], 'data2': range(3)})
pd.merge(df3, df4, left_on='lkey', right_on='rkey') # 输出如下:
lkey data1 rkey data2
0 b 0 b 1
1 b 1 b 1
2 b 6 b 1
3 a 2 a 0
4 a 4 a 0
5 a 5 a 0
可能你已经注意到了,结果⾥⾯c和d以及与之相关的数据消失了。默认情况下,merge做的是“内连接”;结果中的键是交集。其他⽅式还有"left"、"right"以及"outer"。外连接求取的是键的并集,组合了左连接和右连接的效果:
pd.merge(df1, df2, how='outer') # 输出如下:(结果是键的并集)
key data1 data2
0 b 0.0 1.0
1 b 1.0 1.0
2 b 6.0 1.0
3 a 2.0 0.0
4 a 4.0 0.0
5 a 5.0 0.0
6 c 3.0 NaN
7 d NaN 2.0
表8-1对这些选项进⾏了总结
选项 说明
'inner' 使用两个表都有的键(默认)
'left' 使用左表中所有的键
'right' 使用右表中所有的键
'outer' 使用两个表中所有的键
多对多的合并有些不直观。看下⾯的例⼦:
df1 = pd.DataFrame({'key': ['b', 'b', 'a', 'c', 'a', 'b'], 'data1': range(6)})
df2 = pd.DataFrame({'key': ['a', 'b', 'a', 'b', 'd'], 'data2': range(5)})
df1 # 输出如下:
key data1
0 b 0
1 b 1
2 a 2
3 c 3
4 a 4
5 b 5
df2 # 输出如下:
key data2
0 a 0
1 b 1
2 a 2
3 b 3
4 d 4
pd.merge(df1, df2, on='key', how='left') # 输出如下:
key data1 data2
0 b 0 1.0
1 b 0 3.0
2 b 1 1.0
3 b 1 3.0
4 a 2 0.0
5 a 2 2.0
6 c 3 NaN
7 a 4 0.0
8 a 4 2.0
9 b 5 1.0
10 b 5 3.0
多对多连接产⽣的是⾏的笛卡尔积。由于左边的DataFrame有3个"b"⾏,右边的有2个,所以最终结果中就有6个"b"⾏。连接⽅式只影响出现在结果中的不同的键的值:
pd.merge(df1, df2, how='inner') # 输出如下:(等同于:pd.merge(df1, df2))
key data1 data2
0 b 0 1
1 b 0 3
2 b 1 1
3 b 1 3
4 b 5 1
5 b 5 3
6 a 2 0
7 a 2 2
8 a 4 0
9 a 4 2
要根据多个键进⾏合并,传⼊⼀个由列名组成的列表即可:
left = pd.DataFrame({'key1': ['foo', 'foo', 'bar'], 'key2': ['one', 'two', 'one'], 'lval': [1, 2, 3]})
right = pd.DataFrame({'key1': ['foo', 'foo', 'bar', 'bar'], 'key2': ['one', 'one', 'one', 'two'], 'rval': [4, 5, 6, 7]})
pd.merge(left, right, on=['key1', 'key2'], how='outer') # 输出如下:(根据多个键合并)
key1 key2 lval rval
0 foo one 1.0 4.0
1 foo one 1.0 5.0
2 foo two 2.0 NaN
3 bar one 3.0 6.0
4 bar two NaN 7.0
结果中会出现哪些键组合取决于所选的合并⽅式,你可以这样来理解:多个键形成⼀系列元组,并将其当做单个连接键(当然,实际上并不是这么回事)。
注意:在进⾏列-列连接时,DataFrame对象中的索引会被丢弃。
对于合并运算需要考虑的最后⼀个问题是对重复列名的处理。虽然你可以⼿⼯处理列名重叠的问题(查看前⾯介绍的重命名轴标签),但merge有⼀个更实⽤的suffixes选项,⽤于指定附加到左右两个DataFrame对象的重叠列名上的字符串:
pd.merge(left, right, on='key1') # 输出如下:
key1 key2_x lval key2_y rval
0 foo one 1 one 4
1 foo one 1 one 5
2 foo two 2 one 4
3 foo two 2 one 5
4 bar one 3 one 6
5 bar one 3 two 7
pd.merge(left, right, on='key1', suffixes=('_left', '_right')) # 输出如下(指定后缀)
key1 key2_left lval key2_right rval
0 foo one 1 one 4
1 foo one 1 one 5
2 foo two 2 one 4
3 foo two 2 one 5
4 bar one 3 one 6
5 bar one 3 two 7
表8-2 merge函数的参数
2、索引上的合并
有时候,DataFrame中的连接键位于其索引中。在这种情况下,你可以传⼊left_index=True或right_index=True(或两个都传)以说明索引应该被⽤作连接键:
left1 = pd.DataFrame({'key': ['a', 'b', 'a', 'a', 'b', 'c'], 'value': range(6)})
right1 = pd.DataFrame({'group_val': [3.5, 7]}, index=['a', 'b'])
left1 # 输出如下:
key value
0 a 0
1 b 1
2 a 2
3 a 3
4 b 4
5 c 5
right1 # 输出如下:
group_val
a 3.5
b 7.0
pd.merge(left1, right1, left_on='key', right_index=True) # 输出如下:
key value group_val
0 a 0 3.5
2 a 2 3.5
3 a 3 3.5
1 b 1 7.0
4 b 4 7.0
由于默认的merge⽅法是求取连接键的交集,因此你可以通过外连接的⽅式得到它们的并集:
pd.merge(left1, right1, left_on='key', right_index=True, how='outer') # 输出如下:
key value group_val
0 a 0 3.5
2 a 2 3.5
3 a 3 3.5
1 b 1 7.0
4 b 4 7.0
5 c 5 NaN
对于层次化索引的数据,事情就有点复杂了,因为索引的合并默认是多键合并:
lefth = pd.DataFrame({'key1': ['Ohio', 'Ohio', 'Ohio', 'Nevada', 'Nevada'],
'key2': [2000, 2001, 2002, 2001, 2002],
'data': np.arange(5.)})
righth = pd.DataFrame(np.arange(12).reshape((6, 2)),
index=[['Nevada', 'Nevada', 'Ohio', 'Ohio', 'Ohio', 'Ohio'],
[2001, 2000, 2000, 2000, 2001, 2002]],
columns=['event1', 'event2'])
lefth # 输出如下:
key1 key2 data
0 Ohio 2000 0.0
1 Ohio 2001 1.0
2 Ohio 2002 2.0
3 Nevada 2001 3.0
4 Nevada 2002 4.0
righth # 输出如下:
event1 event2
Nevada 2001 0 1
2000 2 3
Ohio 2000 4 5
2000 6 7
2001 8 9
2002 10 11
这种情况下,必须以列表的形式指明⽤作合并键的多个列(注意⽤how='outer'对重复索引值的处理):
pd.merge(lefth, righth, left_on=['key1', 'key2'], right_index=True) # 输出如下:
key1 key2 data event1 event2
0 Ohio 2000 0.0 4 5
0 Ohio 2000 0.0 6 7
1 Ohio 2001 1.0 8 9
2 Ohio 2002 2.0 10 11
3 Nevada 2001 3.0 0 1
pd.merge(lefth, righth, left_on=['key1', 'key2'], right_index=True, how='outer') # 输出如下:
key1 key2 data event1 event2
0 Ohio 2000 0.0 4.0 5.0
0 Ohio 2000 0.0 6.0 7.0
1 Ohio 2001 1.0 8.0 9.0
2 Ohio 2002 2.0 10.0 11.0
3 Nevada 2001 3.0 0.0 1.0
4 Nevada 2002 4.0 NaN NaN
4 Nevada 2000 NaN 2.0 3.0
同时使⽤合并双⽅的索引也没问题:
left2 = pd.DataFrame([[1., 2.], [3., 4.], [5., 6.]],
index=['a', 'c', 'e'],
columns=['Ohio', 'Nevada'])
right2 = pd.DataFrame([[7., 8.], [9., 10.], [11., 12.], [13, 14]],
index=['b', 'c', 'd', 'e'],
columns=['Missouri', 'Alabama'])
left2 # 输出如下:
Ohio Nevada
a 1.0 2.0
c 3.0 4.0
e 5.0 6.0
right2 # 输出如下:
Missouri Alabama
b 7.0 8.0
c 9.0 10.0
d 11.0 12.0
e 13.0 14.0
pd.merge(left2, right2, how='outer', left_index=True, right_index=True) # 输出如下:
Ohio Nevada Missouri Alabama
a 1.0 2.0 NaN NaN
b NaN NaN 7.0 8.0
c 3.0 4.0 9.0 10.0
d NaN NaN 11.0 12.0
e 5.0 6.0 13.0 14.0
DataFrame还有⼀个便捷的join实例⽅法,它能更为⽅便地实现按索引合并。它还可⽤于合并多个带有相同或相似索引的DataFrame对象,但要求没有重叠的列。在上⾯那个例⼦中,我们可以编写:
left2.join(right2, how='outer') # 输出如下:
Ohio Nevada Missouri Alabama
a 1.0 2.0 NaN NaN
b NaN NaN 7.0 8.0
c 3.0 4.0 9.0 10.0
d NaN NaN 11.0 12.0
e 5.0 6.0 13.0 14.0
因为⼀些历史版本的遗留原因,DataFrame的join⽅法默认使⽤的是左连接,保留左边表的⾏索引。它还⽀持在调⽤的DataFrame的列上,连接传递的DataFrame索引:
left1.join(right1, on='key') # 输出如下:
key value group_val
0 a 0 3.5
1 b 1 7.0
2 a 2 3.5
3 a 3 3.5
4 b 4 7.0
5 c 5 NaN
最后,对于简单的索引合并,还可以向join传⼊⼀组DataFrame,后面会介绍更为通⽤的concat函数,也能实现此功能:
another = pd.DataFrame([[7., 8.], [9., 10.], [11., 12.], [16., 17.]],
index=['a', 'c', 'e', 'f'],
columns=['New York', 'Oregon'])
another # 输出如下:
New York Oregon
a 7.0 8.0
c 9.0 10.0
e 11.0 12.0
f 16.0 17.0
left2.join([right2, another]) # 输出如下:(注意参数是列表)
Ohio Nevada Missouri Alabama New York Oregon
a 1.0 2.0 NaN NaN 7.0 8.0
c 3.0 4.0 9.0 10.0 9.0 10.0
e 5.0 6.0 13.0 14.0 11.0 12.0
left2.join([right2, another], how='outer') # 输出如下:(行索引合并)
Ohio Nevada Missouri Alabama New York Oregon
a 1.0 2.0 NaN NaN 7.0 8.0
b NaN NaN 7.0 8.0 NaN NaN
c 3.0 4.0 9.0 10.0 9.0 10.0
d NaN NaN 11.0 12.0 NaN NaN
e 5.0 6.0 13.0 14.0 11.0 12.0
f NaN NaN NaN NaN 16.0 17.0
3、轴向连接
另⼀种数据合并运算也被称作连接(concatenation)、绑定(binding)或堆叠(stacking)。
NumPy的concatenation函数可以⽤NumPy数组来做:
arr = np.arange(12).reshape((3, 4))
arr # 输出如下:
array([[ 0, 1, 2, 3],
[ 4, 5, 6, 7],
[ 8, 9, 10, 11]])
np.concatenate([arr, arr], axis=1) # 输出如下:
array([[ 0, 1, 2, 3, 0, 1, 2, 3],
[ 4, 5, 6, 7, 4, 5, 6, 7],
[ 8, 9, 10, 11, 8, 9, 10, 11]])
对于pandas对象(如Series和DataFrame),带有标签的轴使你能够进⼀步推⼴数组的连接运算。
具体点说,你还需要考虑以下这些东⻄:
如果对象在其它轴上的索引不同,我们应该合并这些轴的不
同元素还是只使⽤交集?
连接的数据集是否需要在结果对象中可识别?
连接轴中保存的数据是否需要保留?许多情况下,
DataFrame默认的整数标签最好在连接时删掉。
pandas的concat函数提供了⼀种能够解决这些问题的可靠⽅式。
下面将给出⼀些例⼦来讲解其使⽤⽅式。假设有三个没有重叠索引的Series:
s1 = pd.Series([0, 1], index=['a', 'b'])
s2 = pd.Series([2, 3, 4], index=['c', 'd', 'e'])
s3 = pd.Series([5, 6], index=['f', 'g'])
对这些对象调⽤concat可以将值和索引粘合在⼀起:
pd.concat([s1, s2, s3]) # 输出如下:
a 0
b 1
c 2
d 3
e 4
f 5
g 6
dtype: int64
默认情况下,concat是在axis=0上⼯作的,最终产⽣⼀个新的Series。如果传⼊axis=1,则结果就会变成⼀个DataFrame(axis=1是列):
pd.concat([s1, s2, s3], axis=1) # 输出如下:
0 1 2
a 0.0 NaN NaN
b 1.0 NaN NaN
c NaN 2.0 NaN
d NaN 3.0 NaN
e NaN 4.0 NaN
f NaN NaN 5.0
g NaN NaN 6.0
这种情况下,另外的轴上没有重叠,从索引的有序并集(外连接)上就可以看出来。
传⼊join='inner'即可得到它们的交集:
s4 = pd.concat([s1, s3])
s4 # 输出如下:
a 0
b 1
f 5
g 6
dtype: int64
pd.concat([s1, s4], axis=1) # 输出如下:(并集)
0 1
a 0.0 0
b 1.0 1
f NaN 5
g NaN 6
pd.concat([s1, s4], axis=1, join='inner') # 输出如下:(交集)
0 1
a 0 0
b 1 1
在这个例⼦中,f和g标签消失了,是因为使⽤的是join='inner'选项。
你可以通过join_axes指定要在其它轴上使⽤的索引:
pd.concat([s1, s4], axis=1, join_axes=[['a', 'c', 'b', 'e']]) # 输出如下:(指定行索引)
0 1
a 0.0 0.0
c NaN NaN
b 1.0 1.0
e NaN NaN
不过有个问题,参与连接的⽚段在结果中区分不开。假设你想要在连接轴上创建⼀个层次化索引。使⽤keys参数即可达到这个⽬的:
result = pd.concat([s1, s1, s3], keys=['one', 'two', 'three']) # 层次化索引
result # 输出如下:
one a 0
b 1
two a 0
b 1
three f 5
g 6
dtype: int64
result.unstack() # 输出如下:
a b f g
one 0.0 1.0 NaN NaN
two 0.0 1.0 NaN NaN
three NaN NaN 5.0 6.0
如果沿着axis=1对Series进⾏合并,则keys就会成为DataFrame的列头:
pd.concat([s1, s2, s3], axis=1, keys=['one', 'two', 'three']) # 输出如下:
one two three
a 0.0 NaN NaN
b 1.0 NaN NaN
c NaN 2.0 NaN
d NaN 3.0 NaN
e NaN 4.0 NaN
f NaN NaN 5.0
g NaN NaN 6.0
同样的逻辑也适⽤于DataFrame对象:
df1 = pd.DataFrame(np.arange(6).reshape(3, 2), index=['a', 'b', 'c'],
columns=['one', 'two'])
df2 = pd.DataFrame(5 + np.arange(4).reshape(2, 2), index=['a', 'c'],
columns=['three', 'four'])
df1 # 输出如下:
one two
a 0 1
b 2 3
c 4 5
df2 # 输出如下:
three four
a 5 6
c 7 8
pd.concat([df1, df2], axis=1, keys=['level1', 'level2']) # 输出如下:
level1 level2
one two three four
a 0 1 5.0 6.0
b 2 3 NaN NaN
c 4 5 7.0 8.0
如果传⼊的不是列表⽽是⼀个字典,则字典的键就会被当做keys选项的值:
pd.concat({'level1': df1, 'level2': df2}, axis=1) # 输出如下
level1 level2
one two three four
a 0 1 5.0 6.0
b 2 3 NaN NaN
c 4 5 7.0 8.0
此外还有两个⽤于管理层次化索引创建⽅式的参数(参⻅表8-3)。举个例⼦,我们可以⽤names参数命名创建的轴级别:
pd.concat([df1, df2], axis=1, keys=['level1', 'level2'],
names=['upper', 'lower']) # 输出如下
upper level1 level2
lower one two three four
a 0 1 5.0 6.0
b 2 3 NaN NaN
c 4 5 7.0 8.0
最后⼀个关于DataFrame的问题是,DataFrame的⾏索引不包含任何相关数据:
df1 = pd.DataFrame(np.random.randn(3, 4), columns=['a', 'b', 'c', 'd'])
df2 = pd.DataFrame(np.random.randn(2, 3), columns=['b', 'd', 'a'])
df1 # 输出如下
a b c d
0 1.721685 -0.160918 -2.419580 -1.634277
1 -1.039395 -0.595996 0.788547 0.455259
2 0.342471 -0.118662 1.402167 0.280451
df2 # 输出如下
b d a
0 0.236757 -0.909635 0.986049
1 -0.038411 -0.034186 -0.879236
在这种情况下,传⼊ignore_index=True即可:
pd.concat([df1, df2], ignore_index=True) # 输出如下:
a b c d
0 1.721685 -0.160918 -2.419580 -1.634277
1 -1.039395 -0.595996 0.788547 0.455259
2 0.342471 -0.118662 1.402167 0.280451
3 0.986049 0.236757 NaN -0.909635
4 -0.879236 -0.038411 NaN -0.034186
表8-3 concat函数的参数
4、合并重叠数据
还有⼀种数据组合问题不能⽤简单的合并(merge)或连接(concatenation)运算来处理。⽐如说,你可能有索引全部或部分重叠的两个数据集。举个有启发性的例⼦,我们使⽤NumPy的where函数,它表示⼀种等价于⾯向数组的if-else:
a = pd.Series([np.nan, 2.5, np.nan, 3.5, 4.5, np.nan],
index=['f', 'e', 'd', 'c', 'b', 'a'])
b = pd.Series(np.arange(len(a), dtype=np.float64),
index=['f', 'e', 'd', 'c', 'b', 'a'])
b[-1] = np.nan
a # 输出如下:
f NaN
e 2.5
d NaN
c 3.5
b 4.5
a NaN
dtype: float64
b # 输出如下:
f 0.0
e 1.0
d 2.0
c 3.0
b 4.0
a NaN
dtype: float64
np.where(pd.isnull(a), b, a) # 输出:array([0. , 2.5, 2. , 3.5, 4.5, nan])
Series有⼀个combine_first⽅法,实现的也是⼀样的功能,还带有pandas的数据对⻬:
b[:-2].combine_first(a[2:]) # 输出如下:(a[2:]为b[:-2]缺失的数据打补丁)
a NaN
b 4.5
c 3.0
d 2.0
e 1.0
f 0.0
dtype: float64
对于DataFrame,combine_first⾃然也会在列上做同样的事情,因此你可以将其看做:⽤传递对象中的数据为调⽤对象的缺失数据“打补丁”:
df1 = pd.DataFrame({'a': [1., np.nan, 5., np.nan],
'b': [np.nan, 2., np.nan, 6.],
'c': range(2, 18, 4)})
df2 = pd.DataFrame({'a': [5., 4., np.nan, 3., 7.],
'b': [np.nan, 3., 4., 6., 8.]})
df1 # 输出如下:
a b c
0 1.0 NaN 2
1 NaN 2.0 6
2 5.0 NaN 10
3 NaN 6.0 14
df2 # 输出如下:
a b
0 5.0 NaN
1 4.0 3.0
2 NaN 4.0
3 3.0 6.0
4 7.0 8.0
df1.combine_first(df2) # 输出如下:相当于df1缺失的数据用df2来填充
a b c
0 1.0 NaN 2.0
1 4.0 2.0 6.0
2 5.0 4.0 10.0
3 3.0 6.0 14.0
4 7.0 8.0 NaN
三、重塑和轴向旋转
有许多⽤于重新排列表格型数据的基础运算。这些函数也称作重塑(reshape)或轴向旋转(pivot)运算。
1、重塑层次化索引
层次化索引为DataFrame数据的重排任务提供了⼀种具有良好⼀致性的⽅式。主要功能有⼆:
stack:将数据的列“旋转”为⾏。
unstack:将数据的⾏“旋转”为列。
下面通过⼀系列的范例来讲解这些操作。接下来看⼀个简单的DataFrame,其中的⾏列索引均为字符串数组:
data = pd.DataFrame(np.arange(6).reshape((2, 3)),
index=pd.Index(['Ohio', 'Colorado'], name='state'),
columns=pd.Index(['one', 'two', 'three'], name='number'))
data # 输出如下:
number one two three
state
Ohio 0 1 2
Colorado 3 4 5
对该数据使⽤stack⽅法即可将列转换为⾏,得到⼀个Series:
result = data.stack()
result # 输出如下:
state number
Ohio one 0
two 1
three 2
Colorado one 3
two 4
three 5
dtype: int32
对于⼀个层次化索引的Series,你可以⽤unstack将其重排为⼀个DataFrame:
result.unstack() # 输出如下:
number one two three
state
Ohio 0 1 2
Colorado 3 4 5
默认情况下,unstack操作的是最内层(stack也是如此)。传⼊分层级别的编号或名称即可对其它级别进⾏unstack操作:
result.unstack(0) # 输出如下:将第1层索引变为列,索引从0开始,0表示第1层
state Ohio Colorado
number
one 0 3
two 1 4
three 2 5
result.unstack('state') # 输出如下:使用列索引的属性名称
state Ohio Colorado
number
one 0 3
two 1 4
three 2 5
如果不是所有的级别值都能在各分组中找到的话,则unstack操作可能会引⼊缺失数据:
s1 = pd.Series([0, 1, 2, 3], index=['a', 'b', 'c', 'd'])
s2 = pd.Series([4, 5, 6], index=['c', 'd', 'e'])
data2 = pd.concat([s1, s2], keys=['one', 'two'])
data2 # 输出如下:
one a 0
b 1
c 2
d 3
two c 4
d 5
e 6
dtype: int64
data2.unstack() # 输出如下:
a b c d e
one 0.0 1.0 2.0 3.0 NaN
two NaN NaN 4.0 5.0 6.0
stack默认会滤除缺失数据,因此该运算是可逆的:
data2.unstack().stack() # 输出如下:
one a 0.0
b 1.0
c 2.0
d 3.0
two c 4.0
d 5.0
e 6.0
dtype: float64
data2.unstack().stack(dropna=False) # 输出如下:参数dropna=False不滤除缺失数据
one a 0.0
b 1.0
c 2.0
d 3.0
e NaN
two a NaN
b NaN
c 4.0
d 5.0
e 6.0
dtype: float64
在对DataFrame进⾏unstack操作时,作为旋转轴的级别将会成为结果中的最低级别:
result # result的输出如下:
state number
Ohio one 0
two 1
three 2
Colorado one 3
two 4
three 5
dtype: int32
df = pd.DataFrame({'left': result, 'right': result + 5},
columns=pd.Index(['left', 'right'], name='side'))
df # 输出如下:
side left right
state number
Ohio one 0 5
two 1 6
three 2 7
Colorado one 3 8
two 4 9
three 5 10
df.unstack('state') # 输出如下:
side left right
state Ohio Colorado Ohio Colorado
number
one 0 3 5 8
two 1 4 6 9
three 2 5 7 10
当调⽤stack,我们可以指明轴的名字:
df.unstack('state').stack('side') # 输出如下:
state Colorado Ohio
number side
one left 3 0
right 8 5
two left 4 1
right 9 6
three left 5 2
right 10 7
2、将“⻓格式”旋转为“宽格式”
多个时间序列数据通常是以所谓的“⻓格式”(long)或“堆叠格式”(stacked)存储在数据库和CSV中的。我们先加载⼀些示例数据,做⼀些时间序列规整和数据清洗:
data = pd.read_csv('examples/macrodata.csv')
data.head() # 输出如下:
year quarter realgdp realcons realinv realgovt realdpi cpi
0 1959.0 1.0 2710.349 1707.4 286.898 470.045 1886.9 28.98
1 1959.0 2.0 2778.801 1733.7 310.859 481.301 1919.7 29.15
2 1959.0 3.0 2775.488 1751.8 289.226 491.260 1916.4 29.35
3 1959.0 4.0 2785.204 1753.7 299.356 484.052 1931.3 29.37
4 1960.0 1.0 2847.699 1770.5 331.722 462.199 1955.5 29.54
m1 tbilrate unemp pop infl realint
0 139.7 2.82 5.8 177.146 0.00 0.00
1 141.7 3.08 5.1 177.830 2.34 0.74
2 140.5 3.82 5.3 178.657 2.74 1.09
3 140.0 4.33 5.6 179.386 0.27 4.06
4 139.6 3.50 5.2 180.007 2.31 1.19
periods = pd.PeriodIndex(year=data.year, quarter=data.quarter, name='date')
columns = pd.Index(['realgdp', 'infl', 'unemp'], name='item')
data = data.reindex(columns=columns)
data.index = periods.to_timestamp('D', 'end')
ldata = data.stack().reset_index().rename(columns={0: 'value'})
在后面的某个章节看到PeriodIndex会更加频繁。总之,它结合了年度(year)和季度(quarter)来创建一种时间间隔类型的列。ldata的数据像这样:
ldata[:10] # 输出如下:
date item value
0 1959-03-31 realgdp 2710.349
1 1959-03-31 infl 0.000
2 1959-03-31 unemp 5.800
3 1959-06-30 realgdp 2778.801
4 1959-06-30 infl 2.340
5 1959-06-30 unemp 5.100
6 1959-09-30 realgdp 2775.488
7 1959-09-30 infl 2.740
8 1959-09-30 unemp 5.300
9 1959-12-31 realgdp 2785.204
这就是多个时间序列(或者其它带有两个或多个键的可观察数据,这⾥,我们的键是date和item)的⻓格式。表中的每⾏代表⼀次观察。
关系型数据库(如MySQL)中的数据经常都是这样存储的,因为固定架构(即列名和数据类型)有⼀个好处:随着表中数据的添加,item列中的值的种类能够增加。在前⾯的例⼦中,date和item通常就是主键(⽤关系型数据库的说法),不仅提供了关系完整性,⽽且提供了更为简单的查询⽀持。有的情况下,使⽤这样的数据会很麻烦,你可能会更喜欢DataFrame,不同的item值分别形成⼀列,date列中的时间戳则⽤作索引。DataFrame的pivot⽅法完全可以实现这个转换:
pivoted = ldata.pivot('date', 'item', 'value')
pivoted # 输出如下:
item infl realgdp unemp
date
1959-03-31 0.00 2710.349 5.8
1959-06-30 2.34 2778.801 5.1
1959-09-30 2.74 2775.488 5.3
1959-12-31 0.27 2785.204 5.6
1960-03-31 2.31 2847.699 5.2
1960-06-30 0.14 2834.390 5.2
1960-09-30 2.70 2839.022 5.6
1960-12-31 1.21 2802.616 6.3
1961-03-31 -0.40 2819.264 6.8
1961-06-30 1.47 2872.005 7.0
... ... ... ...
2007-06-30 2.75 13203.977 4.5
2007-09-30 3.45 13321.109 4.7
2007-12-31 6.38 13391.249 4.8
2008-03-31 2.82 13366.865 4.9
2008-06-30 8.53 13415.266 5.4
2008-09-30 -3.16 13324.600 6.0
2008-12-31 -8.79 13141.920 6.9
2009-03-31 0.94 12925.410 8.1
2009-06-30 3.37 12901.504 9.2
2009-09-30 3.56 12990.341 9.6
[203 rows x 3 columns]
前两个传递的值分别⽤作⾏和列索引,最后⼀个可选值则是⽤于填充DataFrame的数据列。假设有两个需要同时重塑的数据列:
ldata['value2'] = np.random.randn(len(ldata))
ldata[:10] # 输出如下:
date item value value2
0 1959-03-31 realgdp 2710.349 -0.844315
1 1959-03-31 infl 0.000 2.452349
2 1959-03-31 unemp 5.800 0.408969
3 1959-06-30 realgdp 2778.801 -0.874402
4 1959-06-30 infl 2.340 -2.426008
5 1959-06-30 unemp 5.100 -1.148190
6 1959-09-30 realgdp 2775.488 0.976518
7 1959-09-30 infl 2.740 -1.178615
8 1959-09-30 unemp 5.300 -0.019268
9 1959-12-31 realgdp 2785.204 -1.245152
如果忽略最后⼀个参数,得到的DataFrame就会带有层次化的列:
pivoted = ldata.pivot('date', 'item')
pivoted[:5] # 输出如下:
value value2
item infl realgdp unemp infl realgdp unemp
date
1959-03-31 0.00 2710.349 5.8 2.452349 -0.844315 0.408969
1959-06-30 2.34 2778.801 5.1 -2.426008 -0.874402 -1.148190
1959-09-30 2.74 2775.488 5.3 -1.178615 0.976518 -0.019268
1959-12-31 0.27 2785.204 5.6 0.945661 -1.245152 1.050657
1960-03-31 2.31 2847.699 5.2 -0.522355 -0.979312 -1.675772
pivoted['value'][:5] # 输出如下:
item infl realgdp unemp
date
1959-03-31 0.00 2710.349 5.8
1959-06-30 2.34 2778.801 5.1
1959-09-30 2.74 2775.488 5.3
1959-12-31 0.27 2785.204 5.6
1960-03-31 2.31 2847.699 5.2
注意,pivot其实就是⽤set_index创建层次化索引,再⽤unstack重塑:
unstacked = ldata.set_index(['date', 'item']).unstack('item')
unstacked[:7] # 输出如下:
value value2
item infl realgdp unemp infl realgdp unemp
date
1959-03-31 0.00 2710.349 5.8 2.452349 -0.844315 0.408969
1959-06-30 2.34 2778.801 5.1 -2.426008 -0.874402 -1.148190
1959-09-30 2.74 2775.488 5.3 -1.178615 0.976518 -0.019268
1959-12-31 0.27 2785.204 5.6 0.945661 -1.245152 1.050657
1960-03-31 2.31 2847.699 5.2 -0.522355 -0.979312 -1.675772
1960-06-30 0.14 2834.390 5.2 0.367315 -1.547255 -0.502727
1960-09-30 2.70 2839.022 5.6 -0.629023 0.244908 -0.188626
3、将“宽格式”旋转为“⻓格式”
旋转DataFrame的逆运算是pandas.melt。它不是将⼀列转换到多个新的DataFrame,⽽是合并多个列成为⼀个,产⽣⼀个⽐输⼊⻓的DataFrame。看⼀个例⼦:
df = pd.DataFrame({'key': ['foo', 'bar', 'baz'],
'A': [1, 2, 3],
'B': [4, 5, 6],
'C': [7, 8, 9]})
df # 输出如下:
key A B C
0 foo 1 4 7
1 bar 2 5 8
2 baz 3 6 9
key列可能是分组指标,其它的列是数据值。当使⽤pandas.melt,必须指明哪些列是分组指标。下⾯使⽤key作为唯⼀的分组指标:
melted = pd.melt(df, ['key'])
melted # 输出如下:
key variable value
0 foo A 1
1 bar A 2
2 baz A 3
3 foo B 4
4 bar B 5
5 baz B 6
6 foo C 7
7 bar C 8
8 baz C 9
使⽤pivot,可以重塑回原来的样⼦:
reshaped = melted.pivot('key', 'variable', 'value')
reshaped # 输出如下:
variable A B C
key
bar 2 5 8
baz 3 6 9
foo 1 4 7
因为pivot的结果从列创建了⼀个索引,⽤作⾏标签,我们可以使⽤reset_index将数据移回列:
reshaped.reset_index() # 输出如下:
variable key A B C
0 bar 2 5 8
1 baz 3 6 9
2 foo 1 4 7
你还可以指定列的⼦集,作为值的列:
pd.melt(df, id_vars=['key'], value_vars=['A', 'B']) # 输出如下:
key variable value
0 foo A 1
1 bar A 2
2 baz A 3
3 foo B 4
4 bar B 5
5 baz B 6
pandas.melt也可以不⽤分组指标:
pd.melt(df, value_vars=['A', 'B', 'C']) # 输出如下:
variable value
0 A 1
1 A 2
2 A 3
3 B 4
4 B 5
5 B 6
6 C 7
7 C 8
8 C 9
pd.melt(df, value_vars=['key', 'A', 'B']) # 输出如下:
variable value
0 key foo
1 key bar
2 key baz
3 A 1
4 A 2
5 A 3
6 B 4
7 B 5
8 B 6