zoukankan      html  css  js  c++  java
  • DBSCAN算法实现---Python

    生活不易啊,公司考核,初步写出来了,脑阔疼。。。

    思路:

      设定阈值与半径;

      计算点之间的距离(欧式距离实现);

      区分核心点、边界点与离群点;

      将每个点的领域作为一个类(即将密度可达的点归为一个簇);

      找出每个独立的领域;

      对最后的聚类进行标记;

      可视化。

    代码实现:

      1、设定eps = 2,MinPts  = 3;

      2、实现点与点欧氏距离的计算

     1 def ecludDist(x,y):
     2     return np.sqrt(sum(np.sqrt(np.array(x) - np.array(y))))
     3 
     4 def euclidean_distance(data):
     5     all_points = []
     6     for i in data:
     7         temp = []
     8         for j in data:
     9             temp.append(ecludDist(i,j))
    10         all_points.append(temp)
    11     return all_points

      3、点种类的划分:

     1 def classify(z):   #z为通过欧式距离计算所得的矩阵
     2     pts = []
     3     for row in z:
     4         density = np.sum(z.ix[row] < eps)
     5         pts = 0   
     6         if density > MinPts:
     7             pts = 1      #核心点
     8         elif density > 1:
     9             pts = 2    #边界点
    10         else:
    11             pts = 0    #离群点
    12         pts.append(pts)
    13 return pts

      4、将每个点的领域作为一个类:

     1 def point_type:
     2     cluster = dict()
     3     i = 0
     4     for row in z:
     5         cluster[i] = np.where(z.ix[row] < eps)[0]
     6         i = i+1
     7     for i in range(len(cluster)):
     8         for j in range(len(cluster)):
     9             if len(set(cluster[i]) & set(cluster[j])) > 0 and i!=j:
    10                 cluster[i] = cluster[i] | cluster[j]
    11                 cluster[j] = []

      5、找出独立的领域

    1 def independent_filed(cluster):
    2     j = 0
    3     result = dict()
    4     for i in range(len(cluster)):
    5         if len(cluster[i]) >0:    
    6             result[j] = cluster[i]
    7             j =j+1
    8     return result

      6、对最后聚类的结果标记

     1 def mark(df):    #传进来的是转换后的数据
     2     for i in range(result):   #result 为一个字典型结构
     3         for j in result[i]:
     4             df.at[j,'type'] = i     #新建一列,并给它把i值添加上去
     5 
     6 
     7 plt.scatter(
     8     df['one'],
     9     df['two'],
    10     c=df['type'])
    11     

    最后把这些函数封装一下就Ok啦

  • 相关阅读:
    Mysql group by语句的优化
    Mysql join语句的优化
    jquery 只读
    【Unity Shaders】Transparency —— 使用渲染队列进行深度排序
    oracle多表查询之内连接,外连接语句总结
    String比较相等的问题探索
    markdown实例
    集合list里存储list,要遍历最底层list的对象元素的遍历方法
    System.out.println(i++); System.out.println(++i);的区别
    windows自动快捷方式
  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/U940634/p/10074411.html
Copyright © 2011-2022 走看看