Anaconda Linux端环境管理

创建新环境

conda create -n rcnn python=3.6

删除环境

conda remove -n rcnn --all

重命名环境

 参考SO：https://stackoverflow.com/questions/42231764/how-can-i-rename-a-conda-environment

conda 其实没有重命名指令，实现重命名是通过 clone 完成的，分两步：

• 先 clone 一份 new name 的环境
• 删除 old name 的环境

比如，想把环境 rcnn 重命名成 tf

第1步

conda create -n tf --clone rcnn

Source:      /anaconda3/envs/rcnn
Destination: /anaconda3/envs/tf
Packages: 37
Files: 8463

第2步

conda remove -n rcnn --all

结果

conda info -e
# conda environments:
#
crawl                    /anaconda3/envs/crawl
flask                    /anaconda3/envs/flask
tf                       /anaconda3/envs/tf
root                  *  /anaconda3

Linux下取消base

安装conda后取消命令行前出现的base，取消每次启动自动激活conda的基础环境

方法一：

每次在命令行通过conda deactivate退出base环境回到系统自动的环境

方法二

1，通过将auto_activate_base参数设置为false实现：

conda config --set auto_activate_base false

2，那要进入的话通过conda activate base

3，如果反悔了还是希望base一直留着的话通过conda config --set auto_activate_base true来恢复

Linux下jupyter添加conda虚环境

安装完Anaconda利用conda创建了虚拟环境，但是启动jupyter notebook之后却找不到虚拟环境。

实际上是由于在虚拟环境下缺少kernel.json文件，解决方法如下：

首先安装ipykernel：conda install ipykernel

在虚拟环境下创建kernel文件：conda install -n 环境名称 ipykernel

激活conda环境： source activate 环境名称

将环境写入notebook的kernel中

python -m ipykernel install --user --name 环境名称 --display-name "Python (环境名称)"

打开notebook服务器：jupyter notebook

浏览器打开对应地址，新建python，就会有对应的环境提示了

如果经常需要用jupyter notebook，那么最好在创建虚拟环境的时候便安装好ipykernel，

命令：conda create -n 环境名称 python=3.6.8 ipykernel

删除kernel环境：

jupyter kernelspec remove 环境名称

conda下python包安装范例

pip install biopython -i https://pypi.douban.com/simple

pip install torch -i https://pypi.douban.com/simple

pip install torchvision -i https://pypi.douban.com/simple

conda下安装R语言环境

conda create -n r_env python=3.6.8 ipykernel

conda install -c r r-irkernel

进入R：

　　IRkernel::installspec()

　　install.packages("ggplot2")