（1）如果是InnoDB存储引擎，主键不宜过长；
（2）如果是MyISAM存储引擎，影响不大；
先举个简单的栗子说明一下前序知识。
假设有数据表：
t(id PK, name KEY, sex, flag);（PK：primary key，主键）
其中：
（1）id是主键;
（2）name建了普通索引;
假设表中有四条记录：
1, shenjian, m, A
3, zhangsan, m, A
5, lisi, m, A
9, wangwu, f, B
如果存储引擎是MyISAM，其索引与记录的结构是这样的：
（1）有单独的区域存储记录(record)；
（2）主键索引与普通索引结构相同，都存储记录的指针（暂且理解为指针）；
画外音：
（1）主键索引与记录不存储在一起，因此它是非聚集索引(Unclustered Index)；
（2）MyISAM可以没有PK；
MyISAM使用索引进行检索时，会先从索引树定位到记录指针，再通过记录指针定位到具体的记录。
画外音：不管主键索引，还普通索引，过程相同。
InnoDB则不同，其索引与记录的结构是这样的：
（1）主键索引与记录存储在一起；
（2）普通索引存储主键（这下不是指针了）；
画外音：
（1）主键索引与记录存储在一起，所以才叫聚集索引(Clustered Index)；
（2）InnoDB一定会有聚集索引；
InnoDB通过主键索引查询时，能够直接定位到行记录。
但如果通过普通索引查询时，会先查询出主键，再从主键索引上二次遍历索引树。
回归正题，为什么InnoDB的主键不宜过长呢？
假设有一个用户中心场景，包含身份证号，身份证MD5，姓名，出生年月等业务属性，这些属性上均有查询需求。
最容易想到的设计方式是：
身份证作为主键
其他属性上建立索引
user(id_code PK,
id_md5(index),
name(index),
birthday(index));
此时的索引树与行记录结构如上：
- id_code聚集索引，关联行记录
- 其他索引，存储id_code属性值
身份证号id_code是一个比较长的字符串，每个索引都存储这个值，在数据量大，内存珍贵的情况下，MySQL有限的缓冲区，存储的索引与数据会减少，磁盘IO的概率会增加。
画外音：同时，索引占用的磁盘空间也会增加。
此时，应该新增一个无业务含义的id自增列：
- 以id自增列为聚集索引，关联行记录
- 其他索引，存储id值
user(id PK auto inc,
id_code(index),
id_md5(index),
name(index),
birthday(index));
如此一来，有限的缓冲区，能够缓冲更多的索引与行数据，磁盘IO的频率会降低，整体性能会增加。
总结
（1）MyISAM的索引与数据分开存储，索引叶子存储指针，主键索引与普通索引无太大区别；
（2）InnoDB的聚集索引和数据行统一存储，聚集索引存储数据行本身，普通索引存储主键；
（3）InnoDB不建议使用太长字段作为PK（此时可以加入一个自增键PK），MyISAM则无所谓；
希望解答了这位水友的疑问。