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  • FP-growth算法发现频繁项集(一)——构建FP树

      常见的挖掘频繁项集算法有两类,一类是Apriori算法,另一类是FP-growth。Apriori通过不断的构造候选集、筛选候选集挖掘出频繁项集,需要多次扫描原始数据,当原始数据较大时,磁盘I/O次数太多,效率比较低下。FPGrowth不同于Apriori的“试探”策略,算法只需扫描原始数据两遍,通过FP-tree数据结构对原始数据进行压缩,效率较高。

      FP代表频繁模式(Frequent Pattern) ,算法主要分为两个步骤:FP-tree构建、挖掘频繁项集。

    FP树表示法

      FP树通过逐个读入事务,并把事务映射到FP树中的一条路径来构造。由于不同的事务可能会有若干个相同的项,因此它们的路径可能部分重叠。路径相互重叠越多,使用FP树结构获得的压缩效果越好;如果FP树足够小,能够存放在内存中,就可以直接从这个内存中的结构提取频繁项集,而不必重复地扫描存放在硬盘上的数据。

      一颗FP树如下图所示:

      通常,FP树的大小比未压缩的数据小,因为数据的事务常常共享一些共同项,在最好的情况下,所有的事务都具有相同的项集,FP树只包含一条节点路径;当每个事务都具有唯一项集时,导致最坏情况发生,由于事务不包含任何共同项,FP树的大小实际上与原数据的大小一样。

      FP树的根节点用φ表示,其余节点包括一个数据项和该数据项在本路径上的支持度;每条路径都是一条训练数据中满足最小支持度的数据项集;FP树还将所有相同项连接成链表,上图中用蓝色连线表示。

      为了快速访问树中的相同项,还需要维护一个连接具有相同项的节点的指针列表(headTable),每个列表元素包括:数据项、该项的全局最小支持度、指向FP树中该项链表的表头的指针。

    构建FP树

      现在有如下数据:

      FP-growth算法需要对原始训练集扫描两遍以构建FP树。

      第一次扫描,过滤掉所有不满足最小支持度的项;对于满足最小支持度的项,按照全局最小支持度排序,在此基础上,为了处理方便,也可以按照项的关键字再次排序。

    第一次扫描的后的结果

      第二次扫描,构造FP树。

      参与扫描的是过滤后的数据,如果某个数据项是第一次遇到,则创建该节点,并在headTable中添加一个指向该节点的指针;否则按路径找到该项对应的节点,修改节点信息。具体过程如下所示:

    事务001,{z,x}

    事务002,{z,x,y,t,s}

    事务003,{z}

    事务004,{x,s,r}

     

    事务005,{z,x,y,t,r}

    事务006,{z,x,y,t,s}

      从上面可以看出,headTable并不是随着FPTree一起创建,而是在第一次扫描时就已经创建完毕,在创建FPTree时只需要将指针指向相应节点即可。从事务004开始,需要创建节点间的连接,使不同路径上的相同项连接成链表。

      代码如下:

     1 def loadSimpDat():
     2     simpDat = [['r', 'z', 'h', 'j', 'p'],
     3                ['z', 'y', 'x', 'w', 'v', 'u', 't', 's'],
     4                ['z'],
     5                ['r', 'x', 'n', 'o', 's'],
     6                ['y', 'r', 'x', 'z', 'q', 't', 'p'],
     7                ['y', 'z', 'x', 'e', 'q', 's', 't', 'm']]
     8     return simpDat
     9 
    10 def createInitSet(dataSet):
    11     retDict = {}
    12     for trans in dataSet:
    13         fset = frozenset(trans)
    14         retDict.setdefault(fset, 0)
    15         retDict[fset] += 1
    16     return retDict
    17 
    18 class treeNode:
    19     def __init__(self, nameValue, numOccur, parentNode):
    20         self.name = nameValue
    21         self.count = numOccur
    22         self.nodeLink = None
    23         self.parent = parentNode
    24         self.children = {}
    25 
    26     def inc(self, numOccur):
    27         self.count += numOccur
    28 
    29     def disp(self, ind=1):
    30         print('   ' * ind, self.name, ' ', self.count)
    31         for child in self.children.values():
    32             child.disp(ind + 1)
    33 
    34 
    35 def createTree(dataSet, minSup=1):
    36     headerTable = {}
    37     #此一次遍历数据集, 记录每个数据项的支持度
    38     for trans in dataSet:
    39         for item in trans:
    40             headerTable[item] = headerTable.get(item, 0) + 1
    41 
    42     #根据最小支持度过滤
    43     lessThanMinsup = list(filter(lambda k:headerTable[k] < minSup, headerTable.keys()))
    44     for k in lessThanMinsup: del(headerTable[k])
    45 
    46     freqItemSet = set(headerTable.keys())
    47     #如果所有数据都不满足最小支持度,返回None, None
    48     if len(freqItemSet) == 0:
    49         return None, None
    50 
    51     for k in headerTable:
    52         headerTable[k] = [headerTable[k], None]
    53 
    54     retTree = treeNode('φ', 1, None)
    55     #第二次遍历数据集,构建fp-tree
    56     for tranSet, count in dataSet.items():
    57         #根据最小支持度处理一条训练样本,key:样本中的一个样例,value:该样例的的全局支持度
    58         localD = {}
    59         for item in tranSet:
    60             if item in freqItemSet:
    61                 localD[item] = headerTable[item][0]
    62 
    63         if len(localD) > 0:
    64             #根据全局频繁项对每个事务中的数据进行排序,等价于 order by p[1] desc, p[0] desc
    65             orderedItems = [v[0] for v in sorted(localD.items(), key=lambda p: (p[1],p[0]), reverse=True)]
    66             updateTree(orderedItems, retTree, headerTable, count)
    67     return retTree, headerTable
    68 
    69 
    70 def updateTree(items, inTree, headerTable, count):
    71     if items[0] in inTree.children:  # check if orderedItems[0] in retTree.children
    72         inTree.children[items[0]].inc(count)  # incrament count
    73     else:  # add items[0] to inTree.children
    74         inTree.children[items[0]] = treeNode(items[0], count, inTree)
    75         if headerTable[items[0]][1] == None:  # update header table
    76             headerTable[items[0]][1] = inTree.children[items[0]]
    77         else:
    78             updateHeader(headerTable[items[0]][1], inTree.children[items[0]])
    79 
    80     if len(items) > 1:  # call updateTree() with remaining ordered items
    81         updateTree(items[1:], inTree.children[items[0]], headerTable, count)
    82 
    83 
    84 def updateHeader(nodeToTest, targetNode):  # this version does not use recursion
    85     while (nodeToTest.nodeLink != None):  # Do not use recursion to traverse a linked list!
    86         nodeToTest = nodeToTest.nodeLink
    87     nodeToTest.nodeLink = targetNode
    88 
    89 simpDat = loadSimpDat()
    90 dictDat = createInitSet(simpDat)
    91 myFPTree,myheader = createTree(dictDat, 3)
    92 myFPTree.disp()

      上面的代码在第一次扫描后并没有将每条训练数据过滤后的项排序,而是将排序放在了第二次扫描时,这可以简化代码的复杂度。

      控制台信息:

     

    项的顺序对FP树的影响

      值得注意的是,对项的关键字排序将会影响FP树的结构。下面两图是相同训练集生成的FP树,图1除了按照最小支持度排序外,未对项做任何处理;图2则将项按照关键字进行了降序排序。树的结构也将影响后续发现频繁项的结果。

    图1 未对项的关键字排序

    图2 对项的关键字降序排序

     

      下篇继续,介绍如何发现频繁项集。

     


       出处:微信公众号 "我是8位的"

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