http://superlxw1234.iteye.com/blog/2008274
环境配置：
hadoop-2.0.0-cdh4.3.0 (4 nodes, 24G mem/node)
hbase-0.94.6-cdh4.3.0 (4 nodes,maxHeapMB=9973/node)
hive-0.10.0-cdh4.3.0
一、查询性能比较：
query1:
select count(1) from on_hdfs;
select count(1) from on_hbase;
query2(根据key过滤)
select * from on_hdfs
where key = '13400000064_1388056783_460095106148962';
select * from on_hbase
where key = '13400000064_1388056783_460095106148962';
query3(根据value过滤)
select * from on_hdfs where value = 'XXX';
select * from on_hbase where value = 'XXX';
on_hdfs (20万记录，150M，TextFile on HDFS)
on_hbase(20万记录，160M，HFile on HDFS)
on_hdfs (2500万记录，2.7G，TextFile on HDFS)
on_hbase(2500万记录，3G，HFile on HDFS)
从上图可以看出，
对于全表扫描，hive_on_hbase查询时候如果不设置catching，性能远远不及hive_on_hdfs；
根据rowkey过滤，hive_on_hbase性能上略好于hive_on_hdfs，特别是数据量大的时候；
设置了caching之后，尽管比不设caching好很多，但还是略逊于hive_on_hdfs；
二、Hive over HBase原理
Hive与HBase利用两者本身对外的API来实现整合，主要是靠HBaseStorageHandler进行通信，利用HBaseStorageHandler，Hive可以获取到Hive表对应的HBase表名，列簇以及列，InputFormat和OutputFormat类，创建和删除HBase表等。
Hive访问HBase中表数据，实质上是通过MapReduce读取HBase表数据，其实现是在MR中，使用HiveHBaseTableInputFormat完成对HBase表的切分，获取RecordReader对象来读取数据。
对HBase表的切分原则是一个Region切分成一个Split,即表中有多少个Regions,MR中就有多少个Map；
读取HBase表数据都是通过构建Scanner，对表进行全表扫描，如果有过滤条件，则转化为Filter。当过滤条件为rowkey时，则转化为对rowkey的过滤；
Scanner通过RPC调用RegionServer的next()来获取数据；
三、性能瓶颈分析
1. Map Task
Hive读取HBase表，通过MR,最终使用HiveHBaseTableInputFormat来读取数据，在getSplit()方法中对HBase表进行切分，切分原则是根据该表对应的HRegion，将每一个Region作为一个InputSplit，即，该表有多少个Region,就有多少个Map Task；
每个Region的大小由参数hbase.hregion.max.filesize控制，默认10G，这样会使得每个map task处理的数据文件太大，map task性能自然很差；
为HBase表预分配Region，使得每个Region的大小在合理的范围；
下图是给该表预分配了15个Region，并且控制key均匀分布在每个Region上之后，查询的耗时对比，其本质上是Map数增加。
2. Scan RPC 调用：
- 在Scan中的每一次next()方法都会为每一行数据生成一个单独的RPC请求， query1和query3中，全表有2500万行记录，因此要2500万次RPC请求；
- 扫描器缓存（Scanner Caching）：HBase为扫描器提供了缓存的功能，可以通过参数hbase.client.scanner.caching来设置；默认是1；缓存的原理是通过设置一个缓存的行数，当客户端通过RPC请求RegionServer获取数据时，RegionServer先将数据缓存到内存，当缓存的数据行数达到参数设置的数量时，再一起返回给客户端。这样，通过设置扫描器缓存，就可以大幅度减少客户端RPC调用RegionServer的次数；但并不是缓存设置的越大越好，如果设置的太大，每一次RPC调用将会占用更长的时间，因为要获取更多的数据并传输到客户端，如果返回给客户端的数据超出了其堆的大小，程序就会终止并跑出OOM异常；
所以，需要为少量的RPC请求次数和客户端以及服务端的内存消耗找到平衡点。
rpc.metrics.next_num_ops
未设置caching,每个RegionServer上通过next()方法调用RPC的次数峰值达到1000万：
设置了caching=2000，每个RegionServer上通过next()方法调用RPC的次数峰值只有4000：
设置了caching之后，几个RegionServer上的内存消耗明显增加：
- 扫描器批量（Scanner Batch）：缓存是面向行一级的操作，而批量则是面向列一级的操作。批量可以控制每一次next()操作要取回多少列。比如，在扫描器中设置setBatch(5),则一次next()返回的Result实例会包括5列。
- RPC请求次数的计算公式如下：
RPC请求次数 =
（表行数 * 每行的列数）/ Min(每行的列数，批量大小) / 扫描器缓存
因此，在使用Hive over HBase，对HBase中的表做统计分析时候，需要特别注意以下几个方面：
1. 对HBase表进行预分配Region，根据表的数据量估算出一个合理的Region数；
2. rowkey设计上需要注意，尽量使rowkey均匀分布在预分配的N个Region上；
3. 通过set hbase.client.scanner.caching设置合理的扫描器缓存；
4. 关闭mapreduce的推测执行：
set mapred.map.tasks.speculative.execution = false;
set mapred.reduce.tasks.speculative.execution = false;