安装R的h5包

• 系统 redhat7

• 安装H5的包， 依赖系统hdf5包，如下安装完, 发现版本不一致，

    sudo yum install  hdf5-devel
  

• 解决办法： 移花接木

    sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5_cpp.so.11 /usr/lib64/    
    sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5.so.10 /usr/lib64/
    sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5_cpp.so.12 /usr/lib64/
  

• 批量处理

    for f in `cat machines`; do  ssh -t $f " sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5_cpp.so.11 /usr/lib64/; sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5.so.10 /usr/lib64/ ; sudo ln -s /opt/anaconda3/lib/libhdf5_cpp.so.12 /usr/lib64/"; done
  
    for f in `cat machines`; do  ssh -t $f " sudo yum install  hdf5-devel;echo "install.packages('h5', repos='http://mirrors.aliyun.com/CRAN')" | sudo R --no-save "; done