根据你的DDR2手册配置好megacore，megacore会生成一个example top；
在quartus中运行megacore生成的xxx_pin_assignments.tcl，指定DDR2 Pin的IO Standard；
在Pin Planner中将DDR2引脚指定到side，或指定到bank，或指定好DQS Pin，还可以顺便指定好CK/CK# Pin；
DDR2的DQ必须连接到FPGA的DQ，DDR2的DQS必须连接到FPGA的DQS，DDR2的DM可以连接到FPGA的DQ或DM；
将FPGA的RUP和RDN设置为保留引脚（在Pin Planner里的芯片引脚上右键菜单中可设置）避免quartus自动分配给DDR2控制器用，PCB上接50ohm电阻pullup到1.8V和pulldown到GND；
CK/CK#不能和用到的DQ/DQS在同一Pin group，pin group信息可以在Pin Planner中的芯片图四周查看；
确认编译message中没有critical warning；
layout时不要使用quartus没有自动分配上的Pin，因为除了一般性的DQ/DQS等规则外还有其他一些我们不知道的规则；
同一DQS组内的各DQ可以任意交换；各DQS组可以整体交换；CTL Pin可以任意交换；
一般Top/Bottom side要比Left/Right side能达到更高的时钟速率；
如果你的local side用的是Avalon-MM，记得write侧要支持burst，read侧要支持burst+pipeline；
实测连续地址读或写效率能达到85%以上；
再次强调，编译message不能有critical warning。