作为安装程序的Setup文件是软件的开发者专门为其软件设计的.exe文件，是当前最为盛行的安装程序。在运行该Setup文件进行软件安装时，Setup除了进行复制、改名、解压和目录维护等基本安装工作外，还要对系统进行必要的配置，通常是修改config.sys、autoexec.bat和注册表等文件，以适应软件自身特殊的需要，如内存容量、显示模式等。
Install用于计算机时意为“安装”。它的文件可能是.exe、.bat或.com，是DoS时代盛行的安装程序，现已很少使用。运行Install进行软件安装时，通常不会对系统配置进行修改，仅是完成将软件中的文件按需求、顺序地装入硬盘的过程。有个别的Install文件可能会将软件安装路径写入autoexec.bat文件，以求文件共享，但这并非严格意义上的系统配置。