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  • bzoj1966: [Ahoi2005]VIRUS 病毒检测

    Description

    科学家们在Samuel星球上的探险仍在继续。非常幸运的,在Samuel星球的南极附近,探险机器人发现了一个巨大的冰湖!机器人在这个冰湖中搜集到了许多RNA片段运回了实验基地。科学家们经过几个昼夜的研究,发现这些RNA片段中有许多是未知的病毒!每个RNA片段都是由A、C、T、G组成的序列。科学家们也总结出了Samuel星球上的“病毒模版片段”。一个模版片段是由A、C、T、G的序列加上通配符 * 和 ? 来表示。其中 * 的意思是可以匹配上0个或任意多个字符,而 ? 的意思是匹配上任意一个字母。如果一个RNA片段能够和“病毒模版片段”相匹配,那么这个RNA片段就是未知的病毒。例如,假设“病毒模版片段”为A*G?C。RNA片段:AGTC,AGTGTC都是未知的病毒,而RNA片段AGTGC则不是病毒。由于,机器人搜集的这些RNA片段中除去病毒的其他部分都具有非常高的研究价值。所以科学家们希望能够分辨出其中哪些RNA片段不是病毒,并将不是病毒的RNA片段运回宇宙空间站继续进行研究。科学家将这项任务交给了小联。现在请你为小联编写程序统计哪些RNA片段不是病毒。

    Input

    第一行有一个字符串,由A、C、T、G、*、? 组成。表示“病毒模版片段”。“病毒模版片段”的长度不超过1000。第二行有一个整数N(0<N<500),表示机器人搜集到的RNA片段的数目。随后的N行,每一行有一个字符串,由A、C、T、G组成,表示一个RNA片段。每个RNA片段的长度不超过500。注意:“病毒模版片段”和RNA片段的长度都至少为1。

    Output

    只有一行输出,为整数M,即不是病毒的RNA片段的数目。

    数据范围小所以n3能过。。

    模板显然是一个简单的正则表达式,所以建一个NFA然后就可以O(n2)判定一个串是否匹配了,总复杂度还是 O(n3)

    #include<cstdio>
    #include<vector>
    #include<cstring>
    int n,ans=0;
    char s[512];
    int cid[256],p=1;
    std::vector<int>nx[512][5];
    bool d[512],d1[512];
    void adde(int a,int b,int c){
        nx[a][b].push_back(c);
    }
    int main(){
        for(int i=0;i<5;i++)cid["ATGC#"[i]]=i;
        scanf("%s",s+1);
        int l=strlen(s+1),w=1,w2=0;
        s[0]=s[++l]='#';
        for(int i=0;i<=l;i++){
            int c=s[i],u=++p;
            if(c=='*'){
                if(!w2){
                    for(c=0;c<5;c++)adde(w,c,u),adde(u,c,u);
                    w2=w;w=u;
                }
            }else if(c=='?'){
                for(c=0;c<5;c++)adde(w,c,u);
                if(w2){
                    for(c=0;c<5;c++)adde(w2,c,u);
                    w2=0;
                }
                w=u;
            }else{
                c=cid[c];
                adde(w,c,u);
                if(w2)adde(w2,c,u),w2=0;
                w=u;
            }
        }
        scanf("%d",&n);
        while(n--){
            scanf("%s",s+1);
            int len=strlen(s+1);
            s[0]=s[++len]='#';
            memset(d1,0,512);
            d1[1]=1;
            for(int i=0;i<=len;i++){
                memcpy(d,d1,p+1);
                memset(d1,0,p+1);
                int c=cid[s[i]];
                for(int j=1;j<=p;j++)if(d[j]){
                    for(int k=0;k<nx[j][c].size();k++)d1[nx[j][c][k]]=1;
                }
            }
            if(!d1[p])++ans;
        }
        printf("%d",ans);
        return 0;
    }
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