这个问题困扰了我很久。我的电脑上装的CTEX的最新版本，原来我的系统是windows 7 64位系统。装好了CTEX之后，在里面可以直接输入中文，显示和编译生成的PDF文件都正常。但是后来系统崩溃了一次就装回了Windows XP SP3系统。这次装好CTEX之后，发现在WinEdit中输入中文后，竟然是一个个方块。如下图：
于是到网上搜了很久，最终找到的都是一些解决方案，都是在文件头部加入“% !Mode:: "TeX:UTF-8"”来解决。但是我试了试，发现完全不是这个问题。根本没有一点作用。
后来一次搜索到一个解决办法是：改变字体！我琢磨着，改变字体和乱码有什么关系吗？但是无所谓了，反正试了这么多次，再试一次也无妨。于是试着将winedit的文本字体设置为
“仿宋GB2312”，再一看，果然没有乱码了。但是，这个时候英文字体稍微难看了一点。
估计是系统字体的问题，原先出现乱码时候的字体是“Courier New”。可能是这个字体下中文无法正常显示，具体原因也就没有再去深究。
设置方法：preferences-->Font-->change font-->仿宋GB2312.