基因序列相似性问题

给定2个长度分别为m和n的DNA序列X和Y，以及一个长度为p的模式子串P．
带有子序列包含约束的最长公共子序列问题就是要找出x和Y的不包含P为其子串的最长公共子序列。
例如，如果给定的DNA序列x和Y分别为X=AATGCCTAGGC，Y=CGATCTGGAC，模式子序列P=TGGC，
则子序列ATCTGGC是X和Y的一个无约束的最长公共子序列
而不包含P为其子串的最长公共子序列是ATCTGC(可能不唯一)。
编程任务：找出给定序列X和Y带有不包含子串P约束的最长公共子序列。
Input

第1行中给出正整数m,n,p，分别表示给定序列X和Y以及模式子序列P的长度。
接下来的3行分别给出序列X和Y以及模式子串P。
注意：此题输入数据，全是一些小写英文字母。
m<200,n<200,p<200
Output

将计算出的X和Y带有包含子序列P约束的最长公共子串的长度输出
不存在则长度为0。
Sample Input

11 10 4

AATGCCTAGGC

CGATCTGGAC

TGGC
Sample Output

6

#include <cstdio>
#include <cstring>
#include <cstdlib>
#include <algorithm>
using namespace std;
const int Maxn = 210;
int f[Maxn][Maxn][Maxn];
char s1[Maxn], s2[Maxn], s3[Maxn]; int n, m, p;
int _max(int x, int y) { return x > y ? x : y; }
int next[Maxn];
int main() {
    int i, j, k;
    scanf("%d%d%d", &n, &m, &p);
    scanf("%s%s%s", s1+1, s2+1, s3+1);
    j = 0;
    for(i = 2; i <= p; i++){
        while(s3[i] != s3[j+1] && j > 0) j = next[j];
        if(s3[i] == s3[j+1]) j++;
        next[i] = j;
    }
    for(i = 0; i <= n; i++){
        for(j = 0; j <= m; j++){
            for(k = 0; k < p; k++){
                f[i+1][j][k] = _max(f[i+1][j][k], f[i][j][k]);
                f[i][j+1][k] = _max(f[i][j+1][k], f[i][j][k]);
                if(s1[i+1] == s2[j+1]){
                    int po = k;
                    while(s1[i+1] != s3[po+1] && po > 0) po = next[po];
                    if(s1[i+1] == s3[po+1]) po++;
                    f[i+1][j+1][po] = _max(f[i+1][j+1][po], f[i][j][k]+1);
                }
            }
        }
    }
    int ans = 0;
    for(i = 0; i < p; i++) ans = _max(ans, f[n][m][i]);
    printf("%d
", ans);
    return 0;
}