我给出的意见：
目前主流和常用的Linux版本主要有：
1、Redhat 版本5.5和6.0最新；培训、学习、应用、知名度最高的Linux发行版本，对硬件兼容性来说也比较不错，版本更新很快，对新硬件和新技术支持较好。
2、Debian 版本5.0和6.0最新；社区版的Linux来说是较好的，文档和资料较多，尤其是英文的。但在国内的占有率有一定的局限性。关键是上手难，但在所有的Linux发行版本中，这个版本应该说是最自由的。
3、SuSe 版本11和11.4最新；最华丽的Linux发行版，很多人都这样说，X windows和程序应用方面做的确实不错。尤其与Microsoft的合作关系，应该是在所有的Linux发行版本中最亲密的。
4、Ubuntu 版本9和10最新；最近几年出来的，主要指Server版本，强项就是其desktop版，应用是在太广泛了。
5、Centos 版本5.4和6.0最新；这个发行版主要是Redhat企业版的社区版，基本上跟redhat是兼容的，相对来说局限性教少。很多人都喜欢使用。
至少gentoo、mandriva、Slackware、redflag等可以暂时不考虑。虽然各自均有特点，但市场占有率和应用相对较少。
说了各自的特点，给出结论：
----如果作为php、jsp等开发平台使用，最好选择Redhat或Centos，原因主要是硬件和软件兼容性方面应该是所有Linux发行版本中较好的。最主要的原因是国内的多数游戏运营商和大型网站，使用这两个版本的较多。
----如果是作为asp.net等开发平台使用，最好使用suse，原因是与Microsoft的合作关系。同时也说明下，移动运营商好像很多使用suse的操作系统平台。
----如果是作为c或c++等开发平台使用，而且对应用程序开发要求较高，建议使用debian版本的Linux，毕竟这个版本的Linux限制性是最小的。自由度较大。
像腾讯的服务器就是SUSE Linux（据调查机构称，SUSE是国内服务器市场占有率最高的系统），而Red Hat Linux在国内服务器市场份额也很高。