时钟是STM32单片机的驱动源，使用任何一个外设都必须打开相应的时钟。这样的好处就是，如果不使用一个外设的时候，就把它的时钟关掉，从而可以降低系统的功耗，达到节能，实现低功耗的效果。（低功耗）
寄存器是由D触发器组成的，只有送来了时钟，触发器才能被改写值。任何MCU的任何外设都需要有时钟，8051也是如此；STM32为了让用户更好地掌握功耗，对每个外设的时钟都设置了开关，让用户可以精确地控制，关闭不需要的设备，达到节省供电的目的。51单片机不用配置IO时钟，只是因为默认使用同一个时钟，这样是方便，但是这样的话功耗就降低不了。51中某个功能不需要，但是它还是一直运行。32中当你想关闭某个IO的时候，关闭它想对应的时钟使能就是了。
ARM的芯片都是这样，外设通常都是给了时钟后，才能设置它的寄存器（即才能使用这个外设），这么做的目的是为了省电，使用了所谓时钟门控的技术。
在STM32中，有五个时钟源，为HSI、HSE、LSI、LSE、PLL。
①、HSI是高速内部时钟，RC振荡器，频率为8MHz。
②、HSE是高速外部时钟，可接石英/陶瓷谐振器，或者接外部时钟源，频率范围为4MHz~16MHz。
③、LSI是低速内部时钟，RC振荡器，频率为40kHz，看门狗时钟
④、LSE是低速外部时钟，接频率为32.768kHz的石英晶体，主要做RTC时钟源
⑤、PLL为锁相环倍频输出，其时钟输入源可选择为HSI/2、HSE或者HSE/2。倍频可选择为2~16倍，但是其输出频率最大不得超过72MHz。
备注：MCO接口的两个作用 --①其上有选择开关，可以观察波形是否正常
--②可以作为其他部件的时钟
系统时钟SYSCLK，它是供STM32中绝大部分部件工作的时钟源。系统时钟可选择为PLL输出、HSI或者HSE。系统时钟最大频率为72MHz，它通过AHB分频器分频后送给各模块使用，AHB分频器可选择1、2、4、8、16、64、128、256、512分频。其中AHB分频器输出的时钟送给5大模块使用：
①、送给AHB总线、内核、内存和DMA使用的HCLK时钟。
②、通过8分频后送给Cortex的系统定时器时钟。
③、直接送给Cortex的空闲运行时钟FCLK。
④、送给APB1分频器。APB1分频器可选择1、2、4、8、16分频，其输出一路供APB1外设使用(PCLK1，最大频率36MHz)，另一路送给定时器(Timer)2、3、4倍频器使用。该倍频器可选择1或者2倍频，时钟输出供定时器2、3、4使用。
⑤、送给APB2分频器。APB2分频器可选择1、2、4、8、16分频，其输出一路供APB2外设使用(PCLK2，最大频率72MHz)，另一路送给定时器(Timer)1倍频器使用。该倍频器可选择1或者2倍频，时钟输出供定时器1使用。另外，APB2分频器还有一路输出供ADC分频器使用，分频后送给ADC模块使用。ADC分频器可选择为2、4、6、8分频。
HCLK ：AHB总线时钟，由系统时钟SYSCLK 分频得到，一般不分频，等于系统时钟，HCLK是高速外设时钟，是给外部设备的，比如内存，flash。
STM32单片机的时钟可以由以下3个时钟源提供：
1、HSI:高速内部时钟信号 stm32单片机内带的时钟 (8M频率) 精度较差
2、HSE:高速外部时钟信号 精度高 来源(1)HSE外部晶体/陶瓷谐振器(晶振) (2)HSE用户外部时钟
3、LSE:低速外部晶体 32.768kHz 主要提供一个精确的时钟源 一般作为RTC时钟使用
stm32单片机的将时钟信号(例如HSE)经过分频或倍频(PLL)后,得到系统时钟，系统时钟经过分频，产生外设所使用的时钟。
设置时钟流程：
1、将RCC寄存器重新设置为默认值 RCC_DeInit
2、打开外部高速时钟晶振HSE RCC_HSEConfig(RCC_HSE_ON);
3、等待外部高速时钟晶振工作 HSEStartUpStatus = RCC_WaitForHSEStartUp();
4、设置AHB时钟 RCC_HCLKConfig
5、设置高速AHB时钟 RCC_PCLK2Config
6、设置低速速AHB时钟 RCC_PCLK1Config
7、设置PLL RCC_PLLConfig
8、打开PLL RCC_PLLCmd(ENABLE);
9、等待PLL工作 while(RCC_GetFlagStatus(RCC_FLAG_PLLRDY) == RESET)
10、设置系统时钟 RCC_SYSCLKConfig
11、判断是否PLL是系统时钟 while(RCC_GetSYSCLKSource()!= 0x08)
12、打开要使用的外设时钟 RCC_APB2PeriphClockCmd()/RCC_APB1PeriphClockCmd（）
关于系统时钟配置分为寄存器配置和固件库配置两种：
（1）固件库配置
void RCC_Config(void)
{
RCC_DeInit(); //设置RCC寄存器默认值
RCC_HSEConfig(RCC_HSE_ON); //使能外部高速时钟HSE
while(RCC_GetFlagStatus(RCC_FLAG_HSERDY)==RESET);//等待HSE使能就绪
FLASH_PrefetchBufferCmd(FLASH_PrefetchBuffer_Enable);//enable prefetch buffer(开启预取指令功能，可以提高效率)
FLASH_SetLatency(FLASH_Latency_2); //flash 2 wait state
RCC_HCLKConfig(RCC_SYSCLK_Div1);//HCLK=SYSCLK
RCC_PCLK1Config(RCC_HCLK_Div2); //PCLK1=HCLK/2
RCC_PCLK2Config(RCC_HCLK_Div1); //PCLK2=HCLK
RCC_PLLConfig(RCC_PLLSource_HSE_Div1,RCC_PLLMul_9);//PLLCLK=8*9
RCC_PLLCmd(ENABLE); //enable PLLCLK
while(RCC_GetFlagStatus(RCC_FLAG_PLLRDY)==RESET);//wait till PLLCLK is ready
RCC_SYSCLKConfig(RCC_SYSCLKSource_PLLCLK);//select PLL as system clock
while(RCC_GetSYSCLKSource()!=0x08); //wait till PLL is used as system clock source
}
参考：http://blog.csdn.net/u011784994/article/details/53057736