2014-06-18 20:34:59,622 FATAL org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode: Initialization failed for block pool Block pool <registering> (Datanode Uuid unassigned) service to localhost/127.0.0.1:9000
java.io.IOException: Incompatible clusterIDs in /usr/local/hadoop/hdfs/data: namenode clusterID = CID-af6f15aa-efdd-479b-bf55-77270058e4f7; datanode clusterID = CID-736d1968-8fd1-4bc4-afef-5c72354c39ce
at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataStorage.doTransition(DataStorage.java:472)
at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataStorage.recoverTransitionRead(DataStorage.java:225)
at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataStorage.recoverTransitionRead(DataStorage.java:249)
at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode.initStorage(DataNode.java:929)
at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.DataNode.initBlockPool(DataNode.java:900)
at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.BPOfferService.verifyAndSetNamespaceInfo(BPOfferService.java:274)
at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.BPServiceActor.connectToNNAndHandshake(BPServiceActor.java:220)
at org.apache.hadoop.hdfs.server.datanode.BPServiceActor.run(BPServiceActor.java:815)
at java.lang.Thread.run(Thread.java:744)
从日志中可以看出，原因是因为datanode的clusterID 和 namenode的clusterID 不匹配。
打开hdfs-site.xml里配置的datanode和namenode对应的目录，分别打开current文件夹里的VERSION，可以看到clusterID项正如日志里记录的一样，确实不一致，修改datanode里VERSION文件的clusterID 与namenode里的一致，再重新启动dfs（执行start-dfs.sh）再执行jps命令可以看到datanode已正常启动。
出现该问题的原因：在第一次格式化dfs后，启动并使用了hadoop，后来又重新执行了格式化命令（hdfs namenode -format)，这时namenode的clusterID会重新生成，而datanode的clusterID 保持不变。