1、直接放到Webapps目录下
Tomcat的Webapps目录是Tomcat默认的应用目录，当服务器启动时，会加载所有这个目录下的应用。也可以将JSP程序打包成一个war包放在目录下，服务器会自动解开这个war包，并在这个目录下生成一个同名的文件夹。一个war包就是有特性格式的jar包，它是将一个Web程序的所有内容进行压缩得到。具体如何打包，可以使用许多开发工具的IDE环境，如Eclipse、NetBeans、ant、JBuilder等。也可以用cmd 命令：jar -cvf applicationname.war package.*；
甚至可以在程序执行中打包：
try{
string strjavahome = system.getproperty("Java.home");
strjavahome = strjavahome.substring(0,strjavahome.lastindexof(//))+"//bin//";
runtime.getruntime().exec("cmd /c start "+strjavahome+"jar cvf hello.war c://tomcat5.0//webapps//root//*");
}
catch(exception e){system.out.println(e);}
webapps这个默认的应用目录也是可以改变。打开Tomcat的conf目录下的server.xml文件，找到下面内容：
<Host name="localhost" debug="0" appBase="webapps" unpackWARs="true" autoDeloy="true" xmlValidation="falase" xmlNamespaceAware="false">
2、在server.xml中指定
在Tomcat的配置文件中，一个Web应用就是一个特定的Context，可以通过在server.xml中新建Context里部署一个JSP应用程序。打开server.xml文件，在Host标签内建一个Context，内容如下。
<Context path="/myapp" reloadable="true" docBase="D:/myapp" workDir="D:/myapp/work"/>
其中path是虚拟路径，docBase是JSP应用程序的物理路径，workDir是这个应用的工作目录，存放运行是生成的于这个应用相关的文件。
3、创建一个Context文件
以上两种方法，Web应用被服务器加载后都会在Tomcat的conf/catalina/localhost目录下生成一个XML文件，其内容如下：
<Context path="/admin" docBase="${catalina.home}/server/webapps/admin" debug="0" privileged="true"></Context>
可以看出，文件中描述一个应用程序的Context信息，其内容和server.xml中的Context信息格式是一致的，文件名便是虚拟目录名。您可以直接建立这样的一个xml文件，放在Tomcat的conf/catalina/localhost目录下。例子如下：
注意：删除一个Web应用同时也要删除webapps下相应的文件夹祸server.xml中相应的Context，还要将Tomcat的conf
/catalina/localhost目录下相应的xml文件删除。否则Tomcat仍会岸配置去加载。。。
tomcat部署web应用主要有以下几种方式：
1．拷贝你的WAR文件或者你的web应用文件夹（包括该web的所有内容）到$CATALINA_BASE/webapps目录下。
2．为你的web服务建立一个只包括context内容的XML片断文件，并把该文件放到$CATALINA_BASE/webapps目录下。这个web应用本身可以存储在硬盘上的任何地方。这种context片断提供了一种便利的方法来部署web应用，你不需要编辑server.xml，除非你想改变缺省的部署特性，安装一个新的web应用时不需要重启动Tomcat。
3． 同方法2,只是将context片断放在CATALINA_BASE/conf/Catalina/localhost目录下.这种方法比方法2>要有效,笔者经过多次实验发现方法2不如后面这种方法好用.前者多次出现系统打不开的情况.
4．直接在server.xml中</Host>前加上Context片断,使用这种方法时,tomcat会自动在CATALINA_BASE/conf/Catalina/localhost目录下生成一个文件片断.方法同方法3具有同样效果.这种方式需要将ROOT目录删除才行.
另外，为了让tomcat只运行conf/server.xml中指定的web应用，可以有以下几种办法：
实现一:
1)将要部署的WEB应用放在webapps以外的路径, 并在server.xml相应的context中的docBase指定.
2)删除webapps中的所有文件夹, 以及conf/catalina/localhost下所有xml文件.
注: webapps是server.xml中的Host元素的appBase属性的值.
实现二:
1) 修改server.xml中Host元素的属性, 添加或修改: deployXML="false" deployOnStartup="false" autoDeploy="false"
2) 含义:
deployXML="false": 不部署conf/catalina/localhost下的xml相应的WEB应用 deployOnStartup="false" : tomcat启动时, 不部署webapps下的所有web应用 autoDeploy="false": 避免tomcat在扫描改动时, 再次把webapps下的web应用给部署进来.