PHPUnit应该使用PEAR安装程序安装。它为PHP软件包提供分发系统，是PEAR的支柱，并且从4.3.0版开始随PHP一同发行。
用于分发PHPUnit的PEAR通道（pear.phpunit.de）需要在本地PEAR环境登记：
pear channel-discover pear.phpunit.de
这种做法只需进行一次。现在PEAR安装程序可从PHPUnit通道安装软件包了：
pear install phpunit/PHPUnit
之后，你能在你的本地PEAR目录中见到PHPUnit源代码文件；该路经通常是 /usr/lib/php/PHPUnit.
尽管安装PHPUnit只支持通过PEAR安装，你也能手动安装PHPUnit。对于手动安装，做法如下：
1. 从http://pear.phpunit.de/get/下载一个发行存档并解压至你的php.ini配置文件的include_path中列举的一个目录。
2. 准备phpunit脚本：
a. 将pear-phpunit脚本改名为phpunit。
b. 用你得PHP命令行解释器的路径（通常是/usr/bin/php）替换文件中的@php_bin@。
c. 将它拷贝到你的PATH中的一个目录并使之可运行（chmod +x phpunit）。
3. 准备PHPUnit/Util/Fileloader.php脚本：
a. 用你得PHP命令行解释器的路径（通常是/usr/bin/php）替换文件中的@php_bin@。