生物信息类期刊全集大全

计算生物学，生物信息学，计算生物信息学 杂志 期刊

BMC Bioinformatics
BMC Genomics

BMC System Biology

BMC subs

BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
Bioinformatics
COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY
Cell and subs
Current Bioinformatics
Evolutionary Bioinformatics
GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS
Genome Biology
Genome Research
IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
International Journal of Data Mining and Bioinformatics
JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY
Journal of Bioinformatics and Computational Biology
NAR
Nature and subs
PLoS Computational Biology
PLoS Genetics
PLoS ONE
PNAS
RNA
Science and subs
Trends and subs

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1. Nature (impact factor = 40.137)
2. Science (impact factor = 37.205)
3. Cell (impact factor = 30.41)
4. Nature Genetics (impact factor = 27.959)
5. Nature Methods (impact factor = 25.062)
6. Nature Communications  (impact factor = 12.124)
7. Plos Biology (impact factor = 9.797)
8. Genome Research (impact factor = 11.351)
9. Genome Biology (impact factor = 11.908)
10. Nucleic Acids Research (impact factor = 10.162)
11. American Journal of Human Genetics (impact factor = 9.025)
12. elife (impact factor = 7.725)
13. Genome Medicine (impact factor = 7.071)
14. Genomics, Proteomics & Bioinformatics (impact factor = 6.615)
15. Bioinformatics (impact factor = 5.481)
16. Human Molecular Genetics (impact factor = 5.340)
17. Human Genetics (impact factor = 4.637)
18. Plos Computational Biology (impact factor = 4.587)
19. European Journal of Human Genetics (impact factor = 4.349)
20. Scientific Reports (impact factor = 4.259)
21. Frontiers in Genetics (impact factor = 3.789)
22. BMC Genomics (impact factor = 3.729)
23. Human Genomics (impact factor = 3.327)
24. G3: Genes, Genomes, Genetics (impact factor = 2.861)
25. BMC Bioinformatics  (impact factor = 2.448)
26. Journal of Biomedical Informatics (impact factor = 2.753)
27. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (impact factor =1.955)
28. Statistics in Medicine  (impact factor = 1.861)
29. Computers in Biology and Medicine (4区；impact factor = 1.836)
30. Algorithms for Molecular Biology (impact factor = 1.786)
31. BioData Mining (impact factor = 1.577)

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Nature Communications   10.742，综合：一区，12.124

Nucleic Acid Research     8.808，生物：一区；10.162

Scientific Reports         5.078，综合类：二区，4.259

Methods                3.221，生物，二区，3.802

BMC Systems Biology     2.853，生物：3区，2.003

Journal of Biomedical informatics  2.482，医学：3区；2.753

Journal of Computational Biology  1.670，生物：四区；1.032

Journal of Bioinformatics and Computational Biology   0.931，生物：四区；0.800

Journal of Theoretical Biology 1.833 生物、数学与计算生物学 三区

Journal of Mathematical Biology 1.786 生物4区 数学与计算生物学3区

Bioinformatics (IF: 4.328)

BMC Bioinformatics (IF: 3.781)，生物：三区；2.448

BMC Biology (IF: 4.734)，生物：一区；6.779

Briefings in Bioinformatics (IF: 4.627)，生物：一区；5.134

Journal of Computational Biology (IF: 1.563)，生物：四区；1.032

PLoS Computational Biology  (IF: 5.895)，生物：二区，2.542

Mathematical Biosciences (IF: 1.148)，生物：四区；1.246

Journal of Biomedical Informatics (IF: 1.924)，医学：三区；2.753

Molecular Biosystems  ( IF: 4.236)，生物：三区；2.781

Frontiers in Genetics 4.151 生物 二区

Microbial Ecology 3.614 生物：二区，微生物 3区

Frontiers in Microbiology 4.019 生物、微生物 2区

Frontiers in Cellular and Infection Microbiology 3.520 医学、微生物 2区

Research in Microbiology 2.372 生物、微生物 3区

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1.Bioinformatics是作为生物信息学最重要的专门期刊了。

 

2.另外还有Briefings in Bioinformatics，这个杂志每年的发稿量少，最近几年IF波动很大，第一年24+，后来到9+。

 

3.稍次一点的杂志，如BMC Bioinformatics，也是生物信息学的专刊。

 

4.对于计算向的生物信息学，PLOS Computational Biology是一个很好的期刊。

 

5.除此之外，Nature Method，也会有生物信息学相关的方法发表。

 

生物信息学相关的文章不一定要发到专门的生物信息学杂志，因为生物信息学作为一个工具，已经融入到很多生物问题的研究中，而不仅仅是一门孤立的学科了。

 

PLOS Biology也是很好的杂志。PLOS One也会经常有生物信息学文章，算不得牛刊。

 

 

生物信息学两大顶会：

1. ISMB

2. RECOMB

ISMB会转投Bioinformatics杂志， RECOMB会转发Journal of Computational Biology

 

杂志：

1. Bioinformatics 好文章基本都发这上面了

2. Nature Method 偶尔有生物信息的文章

3. Genome Research (Method)

4. Genome Biology (Method)

5. Nucleic Acid Research

2-5 这些杂志出的关于生物信息的都是好文章，这些都算牛刊

 

剩下还有一些杂志

Plos Computational Biology

BMC Bioinformatics

Algorithms for Molecular Biology

 

 

除了bioinformatics等最中规中矩的生信刊物(一般纯算法会投这种)，视子领域不同（偏statistical genetics/genomics/epigenetics），生信领域研究者的常发的还有

BMC genomics IF ~ 5

NAR(Nucleic acids research) IF ~ 8 

Genome Research IF ~10

Nature Genetics IF ~30

Genome biology IF ~10

另外有时也会投 BMC system biology. 一般业内顶级会议（RECOMB,GIW等）最终都会发在bioinformatics/BMC genomics/BMC bioinformatics/NAR之类的期刊上

 

 

Plos computational biology。

其实很多生物信息学的东西会发在所研究领域相关的期刊上。比如TCR分析的文章就有在Blood上的，我也正在往Journal of Immunology上面投一个。

 

Bioinformatics，很多方法类文章都发在上面，但是影响因子一般。

如果有实验和数据分析，大多投到生物相关的杂志，比如genome research, nature genetics, nature等，在method里面涉及一些生信的方法，连带把algorithm放出来，供大家使用。所以，不一定非要发到bioinformatics。

因为如果仅仅是一个算法，比如如何优化read alignment，并不是解决一个生物问题，所以一般发到方法类的journal，只有结合生物实验分析数据，得到新的结论，有一个完整的story，才会发到更comprehensive的journal里面。

 

生物信息学发表论文不只是在专业的期刊上发表，主要是看自己研究的方向偏向哪里，例如我做的是优化算法在生物信息学中的应用，就不怎么愿意在专业的生物信息学上发表，都是在数学、信息学等期刊发表，生物信息学是交叉学科，很容易发文章，但是别想着一定要在 Bioinformatics等上发表，很难得。

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Bioinformatics Journals Ranks from Google Scholar

1: Bioinformatics Journals (the most recent Impact Factor :: 5-year Impact Factor)

1. WIREs Computational Molecular Science (11.885 :: 11.118)
2. Briefings in Bioinformatics (9.617 :: 7.017)
3. Bioinformatics (4.981 :: 8.136)
4. PLOS Computational Biology (4.620 :: 5.279)
5. Statistical Methods in Medical Research (1,2，3区；4.472 :: 3.734)
6. Database: The Journal of Biological Databases and Curation (3.372 :: 4.510)
7. BMC Bioinformatics (2.576 :: 3.452)
8. IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine (2.493 :: 2.873)
9. BMC Systems Biology (4区；3区；2.435 :: 2.917)
10. BioData Mining (4区；3区；2.024 :: 2.012)
11. Journal of Mathematical Biology (1.846 :: 2.344)
12. Journal of Computational Biology (4区；1.737 :: 1.818)
13. Medical & Biological Engineering & Computing (1.726 :: 2.005)
14. Mathematical Medicine and Biology (1.658 :: 2.045)
15. Molecular Informatics (1.647 :: 1.886)
16. Evolutionary Bioinformatics (1.452 :: 1.465)
17. Algorithms for Molecular Biology (1.463 :: 2.155)
18. IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (3区；2.8；1.436 :: 1.605)
19. Bulletin of Mathematical Biology (3区；4区；1.389 :: 1.553)
20. Computers in Biology and Biomedicine (4区；1.240 :: 1.459)
21. IET Systems Biology (4区；1.059 :: 1.467)
22. Current Bioinformatics (4区；0.921 :: 1.045)
23. Journal of Bioinformatics and Computational Biology (4区；0.783)
24. Computational and Mathematical Methods in Medicine (4区；0.766 :: 0.756)
25. International Journal of Data Mining and Bioinformatics (4区；0.495 :: 0.721)
26. Journal of Data Mining in Genomics and Proteiomics (不在中科院分区中)

2: Other journals that publish bioinformatics papers

1. Biochimica et Biophysica Acta-Gene Regulatory Mechanisms (6.332 :: 5.661)
2. Biology Direct (4.658 :: 3.826)
3. BioMed Research International (3区；4区；2.1；1.579 :: 1.593)
4. Briefings in Functional Genomics (3.670 :: 3.565)
5. BMC Biotechnology (2.034 :: 2.511)
6. BMC Genetics (2.397 :: 2.896)
7. BMC Genomics (3.986 :: 4.360)
8. BMC Plant Biology (3.813 :: 4.714)
9. Epigenetics (4.780 :: 5.081)
10. Frontiers in Genetics
11. G3-Genes Genomes Genetics (IF=2.6； 3区；3.198 :: 3.508)
12. Gene (3区；2.138 :: 2.185)
13. Genes (3.242)
14. Genetics (5.963 :: 5.241)
15. Genome (2.1,4区；1.424 :: 1.669)
16. Genome Biology (10.810 :: 13.480)
17. Genome Research (14.630 :: 15.567)
18. Genomics (2.284 :: 2.847)
19. Human Mutatione (5.144 :: 5.119)
20. International Journal of Genomics (0.953 :: 0.953)
21. International Journal of Medical Informatics (2.004 :: 2.610)
22. Nature Biotechnology (41.514 :: 38.276)
23. Nature Communications (11.470 :: 11.904)
24. Nature Methods (32.072 :: 31.232)
25. Nature Protocols (9.673 :: 13.469)
26. Nucleic Acids Research (9.112 :: 8.867)
27. OMICS-A JOURNAL OF INTEGRATIVE BIOLOGY (2.362 :: 2.698)
28. Plant and Cell Physiology (4.931 :: 5.156)
29. Plant Methods (3.102 :: 3.651)
30. Plant Physiology (6.841 :: 8.030)
31. Plant Science (3.607 :: 3.904)
32. PLOS ONE (3.234 :: 3.702)
33. Proceedings of the National Academy of Sciences (9.674 :: 10.563)
34. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY (4.936 :: 4.900)
35. RNA Biology (4.974 :: 5.237)
36. Scientific Reports (5.578 :: 5.597)
37. Scientific Data
38. FEBS Journal (4.001 :: 4.068)
39. Tree Genetics & Genomes (2.451 :: 2.563)
40. Genes & Genomics  （4区；0.5-0.8）

3: Low-cost or no-cost journals

1. eLIFE (9.32 :: 9.33)
2. F1000Research
3. PeerJ (2.1)
4. PeerJ Preprints (draft article, abstract and poster that has not been peer-reviewed)