RNAfold是预测序列二级结构的软件。
本地版下载地址：
http://www.tbi.univie.ac.at/~ivo/RNA/windoze/
在上面网址中还有其他预测结构的软件可供下载。现在主要介绍一下本地下载版的使用方法：
1.不能够双击应用程序，若双击RNAfold.exe应用,只能手动输入序列，而且只能一条一条输入，极其麻烦。
2.应该在Dos环境下，到达应用程序的当前目录。
然后输入命令：
RNAfold.exe <seq.fasta >result.txt
其中“<”代表序列以文件形式作为输入，这就允许输入多个序列进行结构预测，而不单单是一个。若没有这个"<", 则无结果。
“>”代表结果以文件形式输出，最终的预测的结构在result.txt文件中。若没有这个符号，则会输出在dos环境下。
当然还有online服务的网址：http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAfold.cgi