猜想应该是asp.net安装出了问题，需要重新安装。可是下载新的net framework程序包却不能安装。只能通过下面方式重新安装。
一下是引用的资料。
出错信息：
服务器应用程序不可用
您试图在此 Web 服务器上访问的 Web 应用程序当前不可用。请点击 Web 浏览器中的“刷新”按钮重试您的请求。
管理员注意事项: 详述此特定请求失败原因的错误信息可在 Web 服务器的系统事件日志中找到。请检查此日志项以查明导致该错误发生的原因。
前几天给学校安装IIS后运行ASP.NET2.0网页时遇到了 服务器应用程序不可用 的问题，很是头痛，服务器操作系统是WindowsServer2003，我装了一个SP1补丁包，然后在一个大网站上下载了一个IIS6安装包，一切安装都很顺利，安装过程中所需要的DLL文件也是从官方网站上下载的，.NetFrameWork2.0也安装成功，IIS可以运行ASP和静态网页，但是不能运行ASP.NET2.0网页，困惑了好几天，最好终于想到了有可能是网站文件夹的权限问题，于是给网站文件夹的everyone用户添加了全部控制权限，终于问题解决，希望遇到同样问题的朋友们看了这篇文章后会有所帮助。
另外，如果这个办法不行的话，请按以下步骤再试一下：
需要在IIS中重新注册.net
也就是要用到系统盘：
cd c:\windows\microsoft.net\framework\v2.0.50727(此处版本号自己填写）\aspnet_regiis.exe -i
执行后会提示
开始安装 ASP.NET (2.0.50727)。
.....................................
ASP.NET (2.0.50727)安装完毕。
现在 .aspx文件就可以在IIS中运行了