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  • circos的ubuntu和mac安装

    最近要使用circos,分别在ubuntu和mac上面安装了~~还是遇到了一些麻烦的。

    Ubuntu 和mac上面基本上都是一样地 ~

    什么都不说了,直接下载,解压,然后cd到文件夹的 bin/目录中

    ./test.modules

    如果显示都安装没问题,就好。否则,还要继续到CPAN上面下载需要的包

    ./circos

    如果还有一些module没有装上,此时会显示

     #### 更新 20160812 ####

    最新的CPAN安装好像不太好用了

    一个新的方法如下:

    # 先安装cpanminus
    curl -L http://cpanmin.us | perl - --sudo App::cpanminus
    # 再使用cpanminus进行安装
    sudo cpanm Some::Module

    ####################

    只有GD是不能够直接从CPAN上面安装的

    所以 google一下gd2.49即可,源码安装:

    perl Makemodules.PL  #如果有需要安装的包还会提醒你

    make #如果有需要安装的包会提醒你 

    sudo make install

    安装完GD

    再./test.modules

    看看有没有问题,如果一切OK

    ./ circos -man

    能够运行的话酒没问题了~

    注意这里:如果直接打 ./circos是会返回一些错误信息的。但是这没事,因为circos的运行是需要 .conf 文件的,你需要指定一个.conf文件

    如果你没有制定,自然不能正确运行!

    OK!

    现在应该安装好了!

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