命名空间是一种用于将逻辑上相似的类按层次结构分组的机制。这种机制防止了命名冲突。在这种结构化采用被点号"."分隔的单词来实现。通常最顶层的命名空间是System，例如System;IO和System Net（完整的命名空间列表可以在Mono文档中找到）。当然还有别的顶层命名空间，例如Accessibility和Windows就是这样的例子。新建的命名空间还可以以开发组织的名字开头。
程序集是这些类库的物理载体。它们跟Win32共享库一样都是dll文件，尽管不完全一样。一些程序集的例子有：mscorlib.dll，System.dll，System.Data.dll和Accessibility.dll。命名空间经常被分拆到几个程序集中，而一个程序集可以由几个文件组成。比如在一个项目中添加对另一个项目的引用，添加的就是另一个项目的程序集dll，这里面包含了该项目所有的类库和文件