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  • 学习笔记242—值得收藏！EEG/ MEG/MRI/ fNIRS公开数据库大盘点

    公开数据库对于促进科学研究的快速发展意义重大，公开数据的建立可以让全世界各国的领域内研究者对某些问题进行更深入更全面的研究。在大数据时代，数据库的开放和共享已逐渐成为研究领域的趋势之一，目前很多国外期刊杂志也鼓励投稿者共享和开放研究数据。上述情况对于脑科学领域的研究也是如此。此外，我们个人同样可以利用各类脑科学公开数据库方便地进行各种研究。

    笔者在这里较为全面地盘点目前免费的EEG/MEG/MRI/ fNIR公开数据库，希望对大家的研究有所帮助。

    人脑连接组计划

    大名鼎鼎的人脑连接组计划（Human Connectome Project, HCP），该公开数据库是由美国美国国立卫生研究院（NIH）负责，于2009年开始启动。该数据库目前被试数约1200人，包括结构MRI、静息态MRI、任务态fMRI、MEG等数据模态，其他数据还包括人口统计学数据、神经心理学数据、基因数据。

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    1000功能连接组计划

    1000功能连接组计划(1000 Functional Connectomes Project, FCP)于2009年启动，已经采集和公布来自35个中心，1355名被试的MRI数据，包括结构MRI和静息态fMRI数据，此外还包括人口统计学数据。

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    信度与可重复性联盟

    神经影像大数据国际“信度与可重复性联盟”(Consortium for Reliability and Reproducibility, CORR)是由中科院心理所和美国儿童心理研究所于2014年共同发起，目前该数据库包含1629名来自不同中心被试的MRI数据，MRI数据模态包括结构MRI、静息态fMRI、dMRI、扩散磁共振成像和动脉自旋标记成像ALS，此外还包括人口统计学数据。

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    DEAP数据库

    采用生理信号进行情绪分析的数据库（Database for Emotion Analysis using Physiological Signals，DEAP）是由来自英国伦敦玛丽皇后大学等单位的研究人员通过实验采集到的，用来研究人类情感状态的多通道数据。该数据库主要包括每个被试在面部表情视频刺激下的EEG数据以及心理量表数据。

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    我的脑连接组计划

    我的脑连接组计划（My Connectome Project）只记录了斯坦福大学R. Poldrack教授1个人的大脑在18个月内的各种模态MRI数据（包括结构、静息态、任务态、扩散MRI模态）。

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    中国AD临床前期联盟多中心认知下降纵向研究数据库

    中国AD临床前期联盟多中心认知下降纵向研究数据库(SILCODE)是由中国国家老年疾病临床医学研究中心（宣武医院）发起，主要包括健康人和阿尔兹海默症（AD）患者各个阶段的多模态MRI和PET数据，此外还包括临床与行为学数据。

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    OpenfMRI数据库

    OpenfMRI数据库包含来自65个中心共计约2256名被试的多模态MRI数据，包括结构MRI、静息态fMRI、任务态fMRI、扩散MRI、MEG模态，其他数据还包括人口统计学数据、神经心理学数据。

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    英国生物银行

    英国生物银行(UK Biobank)数据库已经采集自3个中心，5000名被试的多模态MRI数据，包括结构MRI、静息态fMRI、任务态fMRI、扩散MRI，此外，还包括人口统计学数据、神经心理学数据、基因数据、血液数据等。

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    美国国家精神卫生数据档案研究所

    美国国家精神卫生数据档案研究所（NDA）数据库整合了多个数据库的数据，包括美国国家自闭症研究数据库（NDAR），与精神疾病相关的国家临床试验数据库（NDCT），研究领域标准数据库（RDoC db）和NIH小儿MRI数据存储库等。从内容上来说，该数据库数据内容丰富，包含临床、影像学，基因组等方面的数据。

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    神经信息数据库

    神经信息数据库（Neuroinformatics database，NIDB）是一个神经影像数据上传和分享的平台，主要包括fMRI和EEG等数据。

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    OpenNEURO

    OpenNEURO数据库是一个用于分析和共享来自人脑成像研究的神经影像数据的开放平台。数据类型主要包括MRI，MEG，EEG，iEEG和ECoG。

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    脑成像图书馆

    脑成像图书馆（Brain Image Library, BIL）是匹兹堡大学建立的用于脑成像数据上传和分享的网络平台，数据主要类型是哺乳动物全脑体积数据（共聚焦显微镜脑成像数据）。

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    ADNI数据库

    Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI)主要针对AD以及轻度认知障碍患者，数据类型包括MRI和PET图像、遗传学、认知测试、CSF和血液生物标志物等。北美ADNI研究的研究资源和数据可通过该网站获得，其中包括阿尔茨海默氏病患者，轻度认知障碍受试者和老年人对照。

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    NeuroMorpho

    NeuroMorpho主要用于搜集已经出版的研究中的神经元结构，是目前为止最大的3D神经元重建和相关元数据的数据库。

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    BrainMap

    BrainMap是由德克萨斯大学健康科学中心的研究成像研究所负责运营，主要提供功能和结构MRI数据。BrainMap不仅提供用于荟萃分析和数据挖掘的数据，还发布用于定量整合神经影像数据的软件和工具。

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    分子脑成像中心数据库

    分子脑成像中心数据库（The Center for Integrated Molecular Brain Imaging Database）主要提供PET和MRI数据的下载以及Cimbi团队利用这些数据已经发表的文章。

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    OASIS数据库

    OASIS（Open Access Series of Imaging Studies）数据库主要针对AD患者，提供正常衰老和AD的纵向MRI神经影像，临床、认知和生物标志物等数据。

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    Delorme脑电数据库

    Delorme脑电数据库提供包括认知、癫痫、睡眠等多种EEG/ERP数据。

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    Dtmri数据库

    Dtmri数据库主要包含人和大鼠的DTI数据。

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    F.M.Kirby Research Center

    F.M.Kirby Research Center主要提供多模态的MRI数据，以及相应的软件工具。

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    OMEGA数据库

    OMEGA（Open MEG Archive）是麦康奈尔脑成像中心（McGill）与蒙特利尔大学之间的合作成果，旨在为开放式传播提供MEG数据。磁瓦，其还包含MRI，人口统计信息和问卷信息以及多模式电生理数据（例如，EEG，细胞记录）。

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    Australian EEG database

    主要提供EEG/ERP数据。

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    CENTRAL脑影像数据库

    CENTRAL脑影像数据库目前包含445个 projects, 合计6175 个被试,主要包含MRI、PET和CT数据。

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    欧洲癫痫数据库

    欧洲癫痫数据库（European Epilepsy Database）主要提供癫痫患者连续EEG数据

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    figshare数据平台

    figshare数据平台是一个多种数据的存储和分享平台，数据类型包括EEG、MRI等。

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    EEGbase平台

    EEGbase是一个用于存储，管理，共享和检索与电生理相关的EEG / ERP、元数据、工具和文档的系统和平台。EEGbase通过允许访问公共数据，工具和结果来推进电生理学研究。

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    BNCIHorizon 2020

    BNCIHorizon 2020项目提供多种模态的数据，包括EEG、ERP、fNIRS、Ecog等。

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    PhysioNet

    PhysioNet于1999年在美国国立卫生研究院（NIH）的主持下成立，其提供大量的生理和临床数据以及相关的开源软件来。

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    总结

    笔者在这里较为全面地盘点目前免费的EEG/MEG/MRI/ fNIR公开数据库，这些数据库为科研人员提供了可供分析的海量数据，特别是对脑科学研究结果的可重复性验证以及大数据分析具有重要意义。

    参考连接：https://zhuanlan.zhihu.com/p/147561580

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