（以Ubuntu10.04，bash shell为准）
在linux下设定环境变量时，如果只是临时用一下，可以直接在shell下用set或export命令设定环境变量，如果希望此环境变量每次开机或打开 shell时自动设定而无须每次都手动设定，那么需要将export命令写入某个系统文件中，拥有这种功能的文件常见的有如下几个：
/etc/environment 或 /etc/profile 或 ~/.profile 或 /etc/bash.bashrc 或 ~/.bashrc等。
有这么多可以用，到底它们有什么区别，谁先谁后呢？
首先，来看看这几个文件都是干什么的：
1./etc/environment–>是系统在登录时读取的第一个文件，用于为所有进程设置环境变量。系统使用此文件时并不是执行此文件中的命 令，而是根据KEY=VALUE模式的代码，对KEY赋值以VALUE，因此文件中如果要定义PATH环境变量，只需加入一行形如 PATH=$PATH:/xxx/bin的代码即可。
2./etc/profile–>是系统登录时执行的第二个文件，可以用于设定针对全系统所有用户的环境变量。
3.~/.profile–>是对应当前登录用户的profile文件，用于定制当前用户的个人工作环境。
4./etc/bash.bashrc–>是针对所有用户的bash初始化文件，在此中设定的环境变量将应用于所有用户的shell中，此文件会在用户每次打开shell时执行一次。
5.~/.bashrc–>是对应当前登录用户的bash初始化文件，当用户每次打开shell时，系统都会执行此文件一次。
那么根据以上描述，这几个文件的执行先后顺序应当是：
/etc/enviroment –>/etc/profile –>~/.profile –>/etc/bash.bashrc–> ~/.bashrc
为了验证此顺序是否正确，这里可以做一个小试验，假定我们登录的用户名为xyz。在/etc/environment中加入一行:
ENV_MSG=”this is /etc/environment”
这样也就是添加了一个环境变量ENV_MSG，然后在/etc/profile中加入两行代码:
echo $ENV_MSG >> /home/xyz/log.txt
echo “this is /etc/profile” >> /home/xyz/log.txt
这样，如果/etc/environment在profile之前被系统读取，则在/home/xyz/log.txt 中会先后打印出EVN_MSG的值和 this is /etc/profile这两条消息。
在/home/xyz/.profile中加入一行代码:
echo “this is .profile” >> /home/xyz/log.txt
在/etc/bash.bashrc中加入一行代码:
echo “this is /etc/bash.bashrc” >> /home/xyz/log.txt
在/home/xyz/.bashrc中加入一行代码:
echo “this is .bashrc” >> /home/xyz/log.txt
然后，重启计算机，看看log.txt文件中会是什么样子。
启动计算机后以xyz用户登录并立即打开/home/xyz/log.txt，可以看到文件中有如下三行消息：
this is /etc/environment
this is /etc/profile
this is .profile
这说明系统在启动登录的过程中依次读取执行了/etc/enviroment 、/etc/profile和~/.profile中的内容。
然后打开一个shell窗口，log文件中就会增加两行消息：
this is /etc/bash.bashrc
this is .bashrc
这说明在打开shell过程中，系统又依次执行/etc/bash.bashrc和~/.bashrc。如果关闭shell窗口后再次打开一个新的 shell窗口，则log文件中会又增加两行同样的消息。由此可以获知，每次打开一个新shell，系统都会重复执行这两个文件，而不会再动那头三个文件 的内容。
接下来我们再打开/etc/environment ，把刚才写入的那行改成ENV_MSG=”this is not /etc/environment”，然后注销，重新以xyz登录，结果会发现log文件中会又多了三行：
this is not /etc/environment
this is /etc/profile
this is .profile
这也就看出来，注销重登录也会引发系统对这三个文件的读取与执行。
不过，如果按下Ctrl+Alt+F1，然后登录xyz，那么log文件中会多出来如下几行，这又是怎么回事呢？
this is /etc/bash.bashrc
this is /etc/environment
this is /etc/profile
this is .bashrc
this is .profile
http://blog.sina.com.cn/s/blog_6405313801012pxw.html
inux配置java环境变量(详细)
一. 解压安装jdk
在shell终端下进入jdk-6u14-linux-i586.bin文件所在目录，
执行命令 ./jdk-6u14-linux-i586.bin 这时会出现一段协议，连继敲回车，当询问是否同意的时候，输入yes，回车。之后会在当前目录下生成一个jdk1.6.0_14目录，你可以将它复制到 任何一个目录下。
二. 需要配置的环境变量
1. PATH环境变量。作用是指定命令搜索路径，在shell下面执行命令时，它会到PATH变量所指定的路径中查找看是否能找到相应的命令程序。我们需要把 jdk安装目录下的bin目录增加到现有的PATH变量中，bin目录中包含经常要用到的可执行文件如javac/java/javadoc等待，设置好 PATH变量后，就可以在任何目录下执行javac/java等工具了。
2. CLASSPATH环境变量。作用是指定类搜索路径，要使用已经编写好的类，前提当然是能够找到它们了，JVM就是通过CLASSPTH来寻找类的。我们 需要把jdk安装目录下的lib子目录中的dt.jar和tools.jar设置到CLASSPATH中，当然，当前目录“.”也必须加入到该变量中。
3. JAVA_HOME环境变量。它指向jdk的安装目录，Eclipse/NetBeans/Tomcat等软件就是通过搜索JAVA_HOME变量来找到并使用安装好的jdk。
三. 三种配置环境变量的方法1. 修改/etc/profile文件
如果你的计算机仅仅作为开发使用时推荐使用这种方法，因为所有用户的shell都有权使用这些环境变量，可能会给系统带来安全性问题。
·用文本编辑器打开/etc/profile
·在profile文件末尾加入：
export JAVA_HOME=/usr/share/jdk1.6.0_14
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH
export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar
·重新登录
·注解
a. 你要将 /usr/share/jdk1.6.0_14改为你的jdk安装目录
b. linux下用冒号“:”来分隔路径
c. $PATH / $CLASSPATH / $JAVA_HOME 是用来引用原来的环境变量的值
在设置环境变量时特别要注意不能把原来的值给覆盖掉了，这是一种
常见的错误。
d. CLASSPATH中当前目录“.”不能丢,把当前目录丢掉也是常见的错误。
e. export是把这三个变量导出为全局变量。
f. 大小写必须严格区分。
2. 修改.bash_profile文件
这种方法更为安全，它可以把使用这些环境变量的权限控制到用户级别，如果你需要给某个用户权限使用这些环境变量，你只需要修改其个人用户主目录下的.bash_profile文件就可以了。
·用文本编辑器打开用户目录下的.bash_profile文件
·在.bash_profile文件末尾加入：
export JAVA_HOME=/usr/share/jdk1.6.0_14
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH
export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar
·重新登录
3. 直接在shell下设置变量
不赞成使用这种方法，因为换个shell，你的设置就无效了，因此这种方法仅仅是临时使用，以后要使用的时候又要重新设置，比较麻烦。
只需在shell终端执行下列命令：
export JAVA_HOME=/usr/share/jdk1.6.0_14
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH
export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar
四. 测试jdk
1. 用文本编辑器新建一个Test.java文件，在其中输入以下代码并保存：
public class test {
public static void main(String args[]) {
System.out.println("A new jdk test !");
}
}
2. 编译：在shell终端执行命令 javac Test.java
3. 运行：在shell终端执行命令 java Test
当shell下出现“A new jdk test !”字样则jdk运行正常。
五. 卸载jdk
·找到jdk安装目录的_uninst子目录
·在shell终端执行命令./uninstall.sh即可卸载jdk。
http://www.cnblogs.com/samcn/archive/2011/03/16/1986248.html