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  • Uniprot Python API

    简要回忆下,第一次使用是在大四,傻傻的用,老师教了一个定制所显示的列,就觉得神奇的不得了。

    uniprot 提供了可供编程的api,这样大大简化了处理流程。http://www.uniprot.org/help/programmatic_access

    不过,在进行batch retrieve时,没有提供python的代码,还是很蛋疼的。

    于是又找到了一个module,https://pypi.python.org/pypi/uniprot_tools/0.4.1。用了这个之后还是非常方便的。

    处理出的结果,用biopython中的swissprot模块进行解析。就ok了。Uniprot的服务挂掉了。明天再贴代码。

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    分割线

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    今天买了六本书,《风流去》《三十六大》《自私的基因》《乖,摸摸头》《最好金龟换酒》《金融的解释》

    媳妇看了之后很高兴。

    继续看美国种族简史。

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