1、首先讨论一下哪些现象造成：IO thread和SQL thread的双Yes假象的问题
① 正常shutdown 或者 kill mysqld
结果状态单：
Slave_IO_Running: Connecting
Slave_SQL_Running: Yes
Last_IO_Errno: 2003
② kill -9 mysqld 或者 reboot 服务器
结果状态:有可能同①，也有可能是双Yes（我自己测试的是同①结果，看别人测的有的是双yes）
③ 临时断开主库的网络，并 kill 掉主库 MySQL 的 binlog dump 线程
结果状态单：
Slave_IO_Running: Yes
Slave_SQL_Running: Yes
说明：
网络恢复之后，binlog dump线程已不存在；
主库有新的写入，从库无法同步，但是I/O线程和SQL线程都是YES，SBM也没有延迟
2、主从同步机制
主库上记录二进制日志，也就是binlog日志。
备库将主库的二进制日志复制到其本地的中继日志中。首先，备库会启动一个工作线程，称为I/O线程，I/O线程跟主库建立一个普通的客户端连接，然后在主库上启动一个特殊的二进制转存（Binglog Dump）线程，这个转存线程会读取主库上的二进制日志中事件，并发送给从库的I/O线程；如果主库没有更新信息将进入休眠。
备库的SQL线程执行最后一步，该线程从中继日志中读取事件并在备库执行，从而实现备库数据的更新。
3 binlog‘推’还是‘拉’
首先， MySQL 的复制是“推”的，而不是“拉”的。“拉”是指 MySQL 的备库不断的循环询问主库是否有数据更新，这种方式资源消耗多，并且效率低。“推”是指 MySQL 的主库在自己有数据更新的时候推送这个变更给备库，这种方式只有在数据有变更的时候才会发生交互，资源消耗少。如果你是程序员出身，你一定会选择“推”的方式。
那么 MySQL 具体是怎么“推”的列，实际上备库在向主库申请数据变更记录的时候，需要指定从主库Binlog 的哪个文件 ( MASTER_LOG_FILE ) 的具体多少个字节偏移位置 ( MASTER_LOG_POS ) 。对应的，主库会启动一个 Binlog dump 的线程，将变更的记录从这个位置开始一条一条的发给备库。备库一直监听主库过来的变更，接收到一条，才会在本地应用这个数据变更。
4 原因解析
从上面的分析，我们可以大致猜到为什么 show slave status 显示一切正常，但是实际上主库的变更都无法同步到备库上来：
出现问题的时候， Binlog dump 程序被我们 kill 掉了。作为监听的一方，备库一直没有收到任何变更，它会认为主库上长时间没有任何变更，导致没有变更数据推送过来。备库是无法判断主库上对应的Binlog dump 线程到底是意外终止了，还是长时间没有任何数据变更的。所以，对这两种情况来说，备库都显示为正常。
当然， MySQL 会尽量避免这种情况。比如：
a.在 Binlog dump 被 kill 掉时通知备库 线程 被 kill 掉了。所以我们重现时需要保证这个通知发送不到备库，也就是说该问题重现的关键在于 Binlog dump 被 kill 的消息由于网络堵塞或者其他原因无法发送到备库。
b.备库如果长时间没有收到从主库过来的变更，它会每隔一段时间重连主库。
5 问题避免
基于上面的分析，我们知道 MySQL 在这种情况下确实无法避免，那么我们可以有哪些办法可以避开：
（1） 被动处理：修改延迟的监控方法，发现问题及时处理。
（2） 主动预防：正确设置 --master-retry-count ， --master-connect-retry ， --slave-net-timeout 复制重试参数。
被动处理
MySQL 的延迟监控大部分直接采集 show slave status 中的 Seconds_Behind_Master。这种情况下，Seconds_Behind_Master 就无法用来真实的衡量主备之间的复制延迟了。我们建议通过在主库轮询插入时间信息，并通过复制到备库的时间差来获得主备延迟的方案。 Percona 提供了一种类似的方案 pt-heartbeat 。
发现这个问题以后，我们只需要 stop slave; start slave; 重启复制就能解决这个问题。
主动预防
MySQL 可以指定三个参数，用于复制线程重连主库： --master-retry-count ， --master-connect-retry ， --slave-net-timeout 。
其中 master-connect-retry 和 master-retry-count 需要在 Change Master 搭建主备复制时指定，而 slave-net-timeout 是一个全局变量，可以在 MySQL 运行时在线设置。
具体的重试策略为：
备库过了 slave-net-timeout 秒还没有收到主库来的数据，它就会开始第一次重试。然后每过 master-connect-retry 秒，备库会再次尝试重连主库。直到重试了 master-retry-count 次，它才会放弃重试。如果重试的过程中，连上了主库，那么它认为当前主库是好的，又会开始 slave-net-timeout 秒的等待。
slave-net-timeout 的默认值是 3600 秒，
master-connect-retry 默认为 60 秒，
master-retry-count 默认为 86400 次。
也就是说，如果主库一个小时都没有任何数据变更发送过来，备库才会尝试重连主库。这就是为什么在我们模拟的场景下，一个小时后，备库才会重连主库，继续同步数据变更的原因。
这样的话，如果你的主库上变更比较频繁，可以考虑将 slave-net-timeout 设置的小一点，避免主库Binlog dump 线程 终止了，无法将最新的更新推送过来。
当然 slave-net-timeout 设置的过小也有问题，这样会导致如果主库的变更确实比较少的时候，备库频繁的重新连接主库，造成资源浪费。