要使用SSH远程登录，Linux常用的软件是OpenSSH，这个软件这些Linux发行版已经自带了。首先确保服务器已经安装了 openssh-server，并且已经启动了sshd。在自己的机器上安装openssh-clients软件包(在Debian和Ubuntu中，这个软件包为openssh-client)，然后就可以用这个软件包里的程序远程连接服务器了。这些程序包括ssh（类似于telnet，用于安全地远程登录），scp（类似于rcp，用于安全地传输文件）和 sftp（类似于ftp，用于安全的ftp互动文件传输）。例如:
ssh user1@cocooker.gro.clinux.org
scp myfile user1@cocooker.gro.clinux.org:/home/user1
sftp user1@cocooker.gro.clinux.org
使用SSH远程登录，除了通常的密码认证方式，还可以使用公钥私钥的认证方式。首先你得用ssh-keygen程序生成自己的一对公钥和私钥(通常使用的是RSA钥匙对)：
ssh-keygen -t rsa
生成的钥匙对放在你的主目录的.ssh目录下，id_rsa文件是私钥，id_rsa.pub文件是公钥文件。把id_rsa.pub文件里面的内容复制到你在服务器的主目录的~/.ssh/authorized_keys文件里，就可以连接这个服务器了。登录过程需要输入私钥的密码，这个是你生成这对钥匙时输入的密码。
如果你以前使用putty生成了一对钥匙对，由于格式不同，openssh是不能直接使用这对钥匙对的。这时候你可以先安装putty，然后利用 putty自带的程序将putty格式的钥匙对转化为openssh格式的钥匙对（假设putty生成的私钥文件名为grokey.ppk）：
puttygen grokey.ppk -O private-openssh -o id_rsa
puttygen grokey.ppk -O public-openssh -o id_rsa.pub
当然，也可以用图形界面的gftp来远程登录上传或下载文件，在连接的时候选择协议为"SSH2"就可以了。
在Fedora 4中，如果你需要通过HTTP代理连接SSH主机，你可以使用nc（netcat）程序来连接代理。只需要在 ~/.ssh／config 文件中增加类似这样的一行：
ProxyCommand nc -X connect -x 192.168.2.67:808 %h %p
如果你是使用SOCKS代理，则需要把上面的"connect"换成"4"或者"5"，这个"4"或者"5"对应你的SOCKS代理的版本。
在Debian 3.2和Ubuntu 6.06中你可以使用connect-proxy程序来连接HTTP代理。首先得安装这个connect-proxy软件包，然后在 ~/.ssh／config 文件中增加类似这样的一行：
ProxyCommand connect-proxy -H 192.168.2.67:808 %h %p
如果你是使用SOCKS代理，则需要把上面的"-H"换成"-S"。
Mandriva 2006与Debian 3.2的情形类似，只是它的软件包和程序的名字都叫connect，作相应的修改就可以了。
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