区别如下：
1、简单的说手自一体是自动挡加了一些功能的，是可以人为的给变速箱电脑一个换档信息，就好象手动档车辆那样换档的感觉一样 （图为手自一体的汽车）。
2、就是有两套变速箱，各自的变速比是不同的，在不同的行车环境可选择不同的变速方式，如在密集交通时可使用自动档，以减轻操作强度；在长途或高速时可选择手动，以体验提速超车的快感，提升驾驶乐趣！ （图为自动档）
3、手自一体就是在自动波的基础上，在D档的左右增加了向手动波一样的1、2、3、4档，开的时候既可以向自动波一样把变速杆挂在D档不用换档，也可以向手动波一样在1、2、3、4档之间换档，不过即使在1、2、3、4档之间换档也是和手动波还是有区别的，因为手自一体的车换档时是不用踩离合的。另外手自一体的车换档换烦了就可以当自动波开，但手波车换烦了也要坚持。
4、原理上区别不大，只是在提速超车方面，手自一体的车子在换档的时候更加令驾驶者随心所欲，减少了单一自动波的换档时间，手动更为灵活比如在超车的时候需要从高档换入抵挡，这时候可用手动波操纵。
5、1档这个功能就是只用1档来行驶，可以给车辆最大的牵引力，上坡可以给车辆更大的动力，下坡可以牵制车速。2档就是只能升到2档，坡不大不小的时候可以用。手自一体是有一个可以自己控制档位的功能，比较中高档的手自一体车会在方向盘后面做换档拔片的，如果没有换档拔片至少会在D档旁边有个“+”和“-”的。