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  • LibSVM笔记系列(3)——初学移植libsvm的C/C++版本

    LibSVM笔记系列(1)中已经提到在g++环境中编译LibSVM只需要一个make命令那样简单。

    本文将介绍

    (1)LibSVM的编译文件结构

    (2)svm.h中重要数据结构及函数分析

    (3)svm_train.c 和 svm_predict.c源代码分析

    (4)如何将LibSVM移植到eclipse IDE环境中


    1. LibSVM编译文件结构

    要了解一个工程是如何编译链接的,最好的办法是参考Makefile。

    CXX ?= g++
    CFLAGS = -Wall -Wconversion -O3 -fPIC
    SHVER = 2
    OS = $(shell uname)

    all: svm-train svm-predict svm-scale

    lib: svm.o
    if [ "$(OS)" = "Darwin" ]; then
    SHARED_LIB_FLAG="-dynamiclib -Wl,-install_name,libsvm.so.$(SHVER)";
    else
    SHARED_LIB_FLAG="-shared -Wl,-soname,libsvm.so.$(SHVER)";
    fi;
    $(CXX) $${SHARED_LIB_FLAG} svm.o -o libsvm.so.$(SHVER)

    svm-predict: svm-predict.c svm.o
    $(CXX) $(CFLAGS) svm-predict.c svm.o -o svm-predict -lm
    svm-train: svm-train.c svm.o
    $(CXX) $(CFLAGS) svm-train.c svm.o -o svm-train -lm
    svm-scale: svm-scale.c
    $(CXX) $(CFLAGS) svm-scale.c -o svm-scale
    svm.o: svm.cpp svm.h
    $(CXX) $(CFLAGS) -c svm.cpp
    clean:
    rm -f *~ svm.o svm-train svm-predict svm-scale libsvm.so.$(SHVER)

    tags:
    ctags --c++-kinds=+p --fields=+iaS --extra=+q -R 

    从上面的Makefile可以看出,之前的make命令执行的是all目标,all目标包括svm-train, svm-predict和svm-scale三个依赖,因此使用make编译后的可执行文件有svm-train, svm-predict和svm-scale共3个。

    下图描述了生成svm-predict和svm-train目标的过程,支持向量机的所有相关的核心代码在svm.cpp中实现,svm_train.c和svm_predict.c中只是提供了训练和预测的主函数接口而已。我们将svm修改移植时只需要仿照svm_train.c或svm_predict.c进行修改就可以了。


    2. svm.h中重要数据结构及函数分析(参考README)

    大部分函数在头文件“svm.h”,因此在自己的C/C++文件中必须#include "svm.h",而且
    要将svm.cpp一同编译到自己的程序当中。可以参考svm-train.c和svm-predict.c。在
    svm.h中定义了LIBSVM_VERSION以及声明了'extern int libsvm_version'。

    在对测试数据分类前,需要使用训练数据构建一个'svm_model',这个模型可以存到文件
    中或立即被使用。

    - Function: struct svm_model *svm_train(const struct svm_problem *prob,
    const struct svm_parameter *param);

        This function constructs and returns an SVM model according to
        the given training data and parameters.

        struct svm_problem
        {
            int l;                 // 训练数据的数量
            double *y;             // 包含标签值的数组
            struct svm_node **x;   // 指针数组,每一个指针指向一个训练的特征向量
        };


        比如,数据如下:

        LABELATTR1ATTR2ATTR3ATTR4ATTR5
        ------------------------------
          1 0  0.1 0.2  0 0
          2 0  0.1 0.3 -1.2 0
          1 0.4  0 0 0 0
          2 0  0.1 0  1.4 0.5
          3-0.1 -0.2 0.1  1.1 0.1

        则svm_problem结构体成员的值如下:

        l = 5

        y -> 1 2 1 2 3

        x -> [ ] -> (2,0.1) (3,0.2) (-1,?)
    [ ] -> (2,0.1) (3,0.3) (4,-1.2) (-1,?)
    [ ] -> (1,0.4) (-1,?)
    [ ] -> (2,0.1) (4,1.4) (5,0.5) (-1,?)
    [ ] -> (1,-0.1) (2,-0.2) (3,0.1) (4,1.1) (5,0.1) (-1,?)


       注意x,其中的(index,value)存储在'svm_node'结构体中:
     
       struct svm_node
    {
    int index;         // 特征向量中非0元素的索引
    double value;      // 索引值位置对应的特征值
    };        
       
       index = -1 表示向量的结束。注意,index的值是递增的。

       struct svm_parameter 描述了SVM model的参数:

    struct svm_parameter
    {
    int svm_type;
    int kernel_type;
    int degree; /* for poly */
    double gamma; /* for poly/rbf/sigmoid */
    double coef0; /* for poly/sigmoid */

    /* these are for training only */
    double cache_size; /* in MB */
    double eps; /* stopping criteria */
    double C; /* for C_SVC, EPSILON_SVR, and NU_SVR */
    int nr_weight;/* for C_SVC */
    int *weight_label;/* for C_SVC */
    double* weight;/* for C_SVC */
    double nu; /* for NU_SVC, ONE_CLASS, and NU_SVR */
    double p; /* for EPSILON_SVR */
    int shrinking;/* use the shrinking heuristics */
    int probability; /* do probability estimates */
    };

        svm_type 可以为C_SVC, NU_SVC, ONE_CLASS, EPSILON, NU_SVR.

        C_SVC:C-SVM classification
        NU_SVC:nu-SVM classification
        ONE_CLASS:one-class-SVM
        EPSILON_SVR:epsilon-SVM regression
        NU_SVR:nu-SVM regression

        kernel_type可以为LINEAR, POLY, RBF, SIGMOID.

        LINEAR:u'*v
        POLY:(gamma*u'*v + coef0)^degree
        RBF:exp(-gamma*|u-v|^2)
        SIGMOID:tanh(gamma*u'*v + coef0)
        PRECOMPUTED: kernel values in training_set_file

        注意:在还要使用svm_train返回的svm_model的情况下,不能将svm_problem的内存空间释放,
        因为svm_model中含有指向svm_problem结构的指针。

        注意:为了避免传入错误的参数,应该在使用svm_train之前使用svm_check_parameter()检验。

        svm_model存储了训练过程获得的模型,不建议直接访问该结构体中的实体,而应该使用接口
        函数获得结构体中成员的值。


    struct svm_model
    {
    struct svm_parameter param;/* parameter */
    int nr_class; /* number of classes, = 2 in regression/one class svm */
    int l; /* total #SV */
    struct svm_node **SV;   /* SVs (SV[l]) */
    double **sv_coef;/* coefficients for SVs in decision functions (sv_coef[k-1][l]) */
    double *rho; /* constants in decision functions (rho[k*(k-1)/2]) */
    double *probA;/* pairwise probability information */
    double *probB;
    int *sv_indices;        /* sv_indices[0,...,nSV-1] are values in [1,...,num_traning_data] to indicate SVs in the training set */

    /* for classification only */

    int *label; /* label of each class (label[k]) */
    int *nSV; /* number of SVs for each class (nSV[k]) */
    /* nSV[0] + nSV[1] + ... + nSV[k-1] = l */
    /* XXX */
    int free_sv; /* 1 if svm_model is created by svm_load_model*/
    /* 0 if svm_model is created by svm_train */
    };


        SV和sv_coef是支持向量和对应的系数。假设有k类,对于第j类中的数据,对应的sv_coef包括
        支持向量的系数是一个 (k-1)y*alpha 的向量,比如有4类,则sv_coef和SV如下:

            +-+-+-+--------------------+
            |1|1|1|                    |
            |v|v|v|  SVs from class 1  |
            |2|3|4|                    |
            +-+-+-+--------------------+
            |1|2|2|                    |
            |v|v|v|  SVs from class 2  |
            |2|3|4|                    |
            +-+-+-+--------------------+
            |1|2|3|                    |
            |v|v|v|  SVs from class 3  |
            |3|3|4|                    |
            +-+-+-+--------------------+
            |1|2|3|                    |
            |v|v|v|  SVs from class 4  |
            |4|4|4|                    |
            +-+-+-+--------------------+

        参考svm_train(),其中给sv_coef赋了值。

        rho是平衡项(-b)。probA和probB是用于概率输出的参数。如果有k类,则有k*(k-1)/2
        个二元分类问题,按照如下的方式对齐:

        1 vs 2, 1 vs 3, ..., 1 vs k, 2 vs 3, ..., 2 vs k, ..., k-1 vs k.

        sv_indices[0,...,nSV-1]值在[1,...,num_training_data]范围内,标识训练数据集中的支持向量。

        label 包含了训练数据集中的标签。

        nSV包含了训练数据集中每类的支持向量数。

        free_sv是一个标志,决定是否在free_model_content(struct svm_model*)中
        和free_and_destroy_model(struct svm_model**)中将SV的空间释放。如果SV是由svm_train()得到
        的,则设置为0,不能释放,如果是通过svm_load_model加载的,则设置为1。

    - Function: double svm_predict(const struct svm_model *model,
                                   const struct svm_node *x);

        For a classification model, the predicted class for x is returned.
        For a regression model, the function value of x calculated using
        the model is returned. For an one-class model, +1 or -1 is
        returned.


    3. svm_train.c的源代码分析

    注意,虽然看到的是.c的文件,但里面实际使用了不少C++特有的东西,因此,在后面eclipse移植过程中最好“新建C++”工程。


    svm_predict.c的代码分析类似,svm_predict的过程比svm_train更简单。


    4. 将LibSVM移植到eclipse IDE的过程

    前提要求:配置好的eclipse C/C++环境,或者使用VC环境也一样

    移植文件:svm.cpp  svm.h  svm-train.c

    拷贝数据文件:heart_scale


    (1)新建C++工程

    (2)将“移植文件”拷贝到工程目录并添加到工程

    (3)添加命令行参数,eclipse中,在“Run Configurations”的Arguments选项卡中添加heart_scale heart_scale.model。



    (4)编译运行结果,与make结果相同

    *
    optimization finished, #iter = 162
    nu = 0.431029
    obj = -100.877288, rho = 0.424462
    nSV = 132, nBSV = 107
    Total nSV = 132



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