第一种：
在windows环境下以批处理文件方式启动tomcat，只要运行<CATALINA_HOME>/bin/startup.bat这个文件，就可以启动Tomcat。在启动时，startup.bat会调用catalina.bat文件，而catalina.bat会调用setclasspath.bat文件来获取JAVA_HOME和JRE_HOME这两个环境变量的值，因此若要在tomcat启动时指向特定的JDK，则需在setclasspath.bat文件的开头处加入以下内容：
rem ---------------------------------------------------------------------------
rem Set CLASSPATH and Java options
rem
rem $Id: setclasspath.bat 730396 2008-12-31 13:49:30Z markt $
rem ---------------------------------------------------------------------------
set JAVA_HOME=C:Javajdk1.60
set JRE_HOME=C:Javajre1.60
C:Javajdk1.60就是JDK的安装路径。
同下：
默认情况下，JDK安装好后，在系统环境变量里设置好JAVA_HOME就可了，但如果系统有多个web服务器，而每个WEB服务器根据需要，要使用不用的JDK版本，那么如下设置就可以解决此类问题。
在tomcat所在目录下的bin子目录里面有个setclasspath.bat文件，
打开并找到 if not "%JAVA_HOME%" == "" goto gotJdkHome 字样。
在该行代码上面加上set JAVA_HOME=C:Program FilesJavajdk1.6.0_18
当然后面的值就是为这个tomcat所指定的特定的JDK安装目录。
设置好启动tomcat即可。
rem表示注释。
注：需要说明的是部分版本的tomcat5是没有bat文件的 它的启动直接是exe，暂时还没想到方法。
转载第二种：
1、修改tomcat/bin/catalina.bat，增加 set JAVA_HOME=XXXXXX，其中XXXXXX为jdk 的路径，如c:j2sdk1_4
2、修改tomcat/bin/setclasspath.bat，同样增加 set JAVA_HOME=XXXXXX
一般人常常忘了步骤2，导致的结果就是特定版本的java启动tomcat，但是jdk用的还是系统默认的（在系统的JAVA_HOME中的设置）。
另外再说一点就是 如果电脑上装了多个版本的jdk 譬如1.5跟1.6 ，都在path环境变量里配置了。那么在启动tomcat的时候会怎么样呢。我做了一个简单的测试：
1：首先在path里添加两个版本的jdk 1.5跟1.6
2：然后先用1.5先编译项目A 编译后复制部署到tomcat6中 启动 可以正常访问
3：再用1.5编译执行2的步骤，也是可以正常访问。
推测：电脑中安装配置多个版本的jdk时，tomcat会根据部署的项目智能选择需要的版本的jdk.
全文貌似主要针对win系统