windows的扩展和优化的空间的确和linux比是有限的，不过这个有限也是相对的。
而且，“有限”并不代表“做不好”，事实上windows + asp.net性能是非常可靠的。
Linux的确可以根据业务特性调优到极致，windows能调优到90%，一般也够了。
例如你要考虑，最后10%的调优和所耗费的代价，与回报相比起来是否合算呢？
存储方面，sql server太贵，可以用linux上的存储。
至于页面seo……这完全和asp.net无关了，你估计又看到一些xxoo的资料在乱说了……
所以，asp.net绝对可以做大型应用，关键在于你怎么做，不在用asp.net还是php在做。
例如，MySpace和微软的网站算不算大型应用？就是这个道理。