ERP和MES是制造企业管理信息系统中重要的组成部分。从表面上看，二者有着很多相似之处。而事实上，在管理方向上存在着很大的不同，主要体现在以下五个方面：
1、二者的管理对象不同。ERP软件一般面向的是服务业或流通业。企业上信息化管理系统，因为MES没有管理对象。对于制造业，主要看在生产过程中，现场对产品信息的需求程度来定。譬如一个配件厂，其产品就是三个，每天每个产品的需求量变化不大，配件的无外乎就是一两件，这样就没有必要上MES，最多用些自动识别技术加一两台电脑统计统计产量，统计统计物料就可以了。
2、二者的管理的范围不同。二者相比，ERP管理的范围比MES大，而MES管理比ERP细。企业生产资源作为企业资源的一部分，也在ERP管理的范围内，也相应有生产计划、数据收集、质量管理、物料管理等功能模块，所以往往和MES会混淆。但ERP管理的范围主要是以工作中心为单位，MES能更细致到每个制造工序，对每个工序进行任务的下达、执行的控制和数据采集、现场调度。ERP要做到工序级的管理，需要进行定制开发。
3、管理的功能不同。ERP在制造管理方面的功能主要是编制生产计划，收集生产数据。MES除了细化生产计划和收集生产数据外，还有批次级的生产控制和调度的管理功能，例如：批次级的工艺流程变更，对制造设备、人员和物料的验证控制，批次分拆、合并，批次的生产订单变更等现场调度功能。
4、实现的方式不同。ERP主要采用填写表单和表单抛转的方式实现管理，现场收到的制造任务是通过表单传达，现场制造数据也是通过填写表单完成收集。MES是采用事件的方式实现管理，生产订单的变化和现场的制造情况，通过MES内置的WIP引擎立刻触发相关事件，要求相关人员或设备采取相应的行动。因此，MES可以减少数据的输入工作，减少差错，也提高了及时性。
5、工作方法的不同。为了实现对制造现场的实时控制和调度，现场的工作方法也会发生一些变化。没有信息系统时的工作方法是从生产计划部门获取生产订单或生产进度，完成现场作业后将生产情况填写在制令单或批次流转单上向上级报告。ERP的方式与此类似，只是制造现场和生产管理部门的接口通过信息系统来连接。但使用MES系统后，工作现场的指令下达和数据收集都是通过信息系统来实现的。
从以上五点可以看出，MES和ERP既有联系又有不同。只有将二者有机结合起来，统筹兼顾，各司其职，才能为企业带来最佳的管理效率和经济效益。