在文件结构上，三者并没有什么不同，它们都采用zip或jar档案文件压缩格式。但是它们的使用目的有所区别：
Jar文件（扩展名为. Jar）[其实就相当于C#当中的“类库”] 包含Java类的普通库、资源（resources）、辅助文件（auxiliary files）等
War文件（扩展名为.War）[其实就相当于C#当中的“Web应用程序”] 包含全部Web应用程序。在这种情形下，一个Web应用程序被定义为单独的一组文件、类和资源，用户可以对jar文件进行封装，并把它作为小型服务程序（servlet）来访问。
Ear文件（扩展名为.Ear）[其实就相当于C#当中的“解决方案”] 包含全部企业应用程序。在这种情形下，一个企业应用程序被定义为多个jar文件、资源、类和Web应用程序的集合。
每一种文件（.jar, .war, .ear）只能由应用服务器（application servers）、小型服务程序容器（servlet containers）、EJB容器（EJB containers）等进行处理。