1.下载ndk和cygwin
NDK 下载地址：http://developer.android.com/tools/sdk/ndk/index.html
Cygwin 下载地址：http://cygwin.com/setup.exe
2.把ndk解压到一个磁盘里即可
3.
安装Cygwin
4.配置ndk的环境变量
PATH="${HOME}/bin:/cygdrive/d/ndk/android-ndk-r9:${PATH}"
MANPATH="${HOME}/man:${MANPATH}"
INFOPATH="${HOME}/info:${INFOPATH}"
其中 /cygdrive/d/ndk/android-ndk-r7b
d:代表你windows的盘符
5.输入:ndk-build命令，出现如下界面说明配置成功
6.用NDK来编译程序
a、运行cygwin，输入命令cd /cygdrive/d/ndk/android-ndk-r9/samples/hello-jni，进入到D: dkandroid-ndk-r9sampleshello-jni目录
b、输入$NDK/ndk-build，执行成功后，它会自动生成一个libs目录，把编译生成的.so文件放在里面。($NDK是调用我们之前配置好的环境变量，ndk-build是调用ndk的编译程序)
c、此时去hello-jni的libs目录下看有没有生成的.so文件，如果有，你的ndk就运行正常啦！
7.配置C/C++的编译器
1、 打开eclipse，导入ndk自带的hello-jni例子，右键单击项目名称，点击Properties，弹出配置界面，之后再点击Builders，弹出项目的编译工具列表，之后点击New，新添加一个编译器，点击后出现添加界面，选择Program，点 击OK
2、出现了添加界面，首先给编译配置起个名字，如：C_Builder
设置Location为<你cygwin安装路径>inash.exe程序，例如：E:cygwininash.exe，设置Working Directory为<你cygwin安装路径>in目录，例如：E:cygwinin
设置Arguments为
--login -c "cd /cygdrive/I/JavaWorkSpace/Blog/NDK_02 && $NDK/ndk-build"
上面的配置中 /cygdrive/I/JavaWorkSpace/Blog/NDK_02是你当前要编译的程序的目录，$NDK是之前配置 的ndk的环境变量，这两个根据你具体的安装目录进行配置，其他的不用变，Arguments这串参数实际是 给bash.exe命令行程序传参数，进入要编译的程序目录，然后运行ndk-build编译程序
./usr/bin/bash: /cygdrive/d/android-ndk-r7: is a directory 说明目录有空格，改成一个没有空格的目录就行
8、接着切换到Refresh选项卡，给Refresh resources upon completion打上钩
9、然后切换到Build Options选项卡，勾选上最后三项
10、之后点击Specify Resources按钮，选择资源目录，勾选你的项目目录即可
11、 最后点击Finish，点击OK一路把刚才的配置都保存下来，注意：如果你配置的编译器在其它编译器下边，记得一定要点Up按钮，把它排到第一位，否则C代码的编译晚于Java代码的编译，会造成你的C代码要编译两次才能看到最新的修改
12、 这一路下来肯定很累了吧，现在再次恭喜你，编译配置也配置完成啦，现在来测试一下是否可以自动编译呢，打开项目jni目录里的hello-jni.c文件把提示Hello from JNI!改成其他的文字：如：Hello，My name is alex.，然后再模拟器中运行你的程序，如果模拟器中显示了你最新修改的文字，那么Congratulations！你已经全部配置成功啦！