1、 计价依据不同
定额计价：统一的预算定额＋费用定额＋调价系数 政府定价。
清单计价：企业定额 市场竞争定价
2、计价项目划分不同
①定额计价模式中计价项目的划分以施工工序为主，内容单一（有一个工序即有一个计价项目）。而清单计价模式中计价项目的划分分别以工程实体为对象，项目综合度较大，将形成某实体部位或构件必须的多项工序或工程内容并为一体，能直观地反映出该实体的基本价格。
如：砖砌化粪池按座综合了挖土方、作垫层、池底板、砌砖池、抹灰、回填等。锚杆支护按㎡综合了钻孔、制浆、压浆、锚杆制作、张拉锚、喷射砂浆等工序或工程内容。
②定额计价模式中计价项目的工程实体与措施合二为一。即该项目既有实体因素又包含措施因素在内。而清单计价模式工程量计算方法是将实体部分与措施部分分离，有利于业主、企业视工程实际自主组价，实现了个别成本控制。
③定额计价模式的项目划分中着重考虑了施工方法因素，从而限制了企业优势的展现，而清单计价模式的项目中不再与施工方法挂钩，而是将施工方法的因素放在组价中由计价人考虑。
3、单价组成不同
定额计价模式中使用的单价为“工料单价法”，即人+材+机，将管理费、利润等在取费中考虑。清单计价模式中使用的单价为“综合单价法”，单价组成为：人工+材料+机械+管理费+利润+风险。使用“综合单价法”更直观的反映了各计价项目（包括构成工程实体的分部分项工程项目和措施项目、其它项目）的实际价格，但现阶段当不包括“规费和税金”。
4、工程量计算规则不同
定额计价模式按分部分项工程的实际发生量计量，而清单计价模式则按分部分项实物工程量净量计量，当分部分项子目综合多个工程内容时，以主体工程内容的单位为该项目的计量单位。
比如：挖10m底面宽为1.8m，深2m的砖基础土方，定额计价的工程量计算要考虑增及工作面及放坡因素，为：（1.8+2×0.2+2×0.33）×2×10=57.2m3，清单计价中工程量的计算不考虑增加工作面及放坡，为1.8×2×10=36m3。又如清单计价的挖基础土方中包括破桩头的工程内容时，无论破桩头的工程量多大均以挖基础土方的工程量m3为单位计价，破桩头不再单列工程量。
5、计价程序不同
定额计价的思路与程序是：直接费+间接费+利润+差价+规费+税金
清单计价的思路与程序是：分部分项工程费+措施项目费+其它项目费+规费+税金
定额计价和清单计价最大的区别是：
定额计价没有清单编码，是直接套定额的，没有“综合单价”的概念。
清单计价是有清单编码的，每个分项都有“综合单价”。
实例说明一下:如“管道安装”。
清单计价时：在清单编码“030801001001”下的管道安装“综合单价中”一般包括内容是：管道安装、管道支架、管道保温、管道冲洗、管道刷油等。
而定额计价时：管道安装、管道安装、管道支架、管道保温、管道冲洗、管道刷油都是单独列一项算的。