http://www.cnblogs.com/adolfmc/archive/2012/10/07/2713562.html
大家都知道一个java应用项目可以打包成一个jar，当然你必须指定一个拥有main函数的main class作为你这个jar包的程序入口。
具体的方法是修改jar包内目录META-INF下的MANIFEST.MF文件。
比如有个叫做test.jar的jar包，里面有一个拥有main函数的main class：test.someClassName
我们就只要在MANIFEST.MF里面添加如下一句话：
Main-Class: test.someClassName
然后我们可以在控制台里输入java -jar test.jar即可以运行这个jar。
但是我们这个项目需要引用其他第三方的jar包，在eclipse里面以项目jar包的形式引用了这个叫做some.jar的包，当时放在项目的lib子目录下，最后项目打包时把这个some.jar也打进来了，但是用java -jar执行这个test.jar的时候报找不到Class异常，原因就是jar引用不到放在自己内部的jar包。
那怎么办？
运行时将其加入classpath的方式行不行？就是在运行jar的同时加入classpath参数：
java -classpath some.jar -jar test.jar
这种方式是不行的，因为使用classpath指定的jar是由AppClassloader来加载，java 命令 加了-jar 参数以后，AppClassloader就只关注test.jar范围内的class了，classpath参数失效。
那该怎么引用其他的jar包呢？
方法一、使用Bootstrap Classloader来加载这些类
我们可以在运行时使用如下参数：
-Xbootclasspath:完全取代系统Java classpath.最好不用。
-Xbootclasspath/a: 在系统class加载后加载。一般用这个。
-Xbootclasspath/p: 在系统class加载前加载,注意使用，和系统类冲突就不好了.
win32 java -Xbootclasspath/a: some.jar;some2.jar; -jar test.jar
unix java -Xbootclasspath/a: some.jar:some2.jar: -jar test.jar
win32系统每个jar用分号隔开，unix系统下用冒号隔开
方法二、使用Extension Classloader来加载
你可以把需要加载的jar都扔到%JRE_HOME%/lib/ext下面，这个目录下的jar包会在Bootstrap Classloader工作完后由Extension Classloader来加载。非常方便，非常省心。:)
方法三、还是用AppClassloader来加载，不过不需要classpath参数了
我们在MANIFEST.MF中添加如下代码：
Class-Path: lib/some.jar
lib是和test.jar同目录的一个子目录，test.jar要引用的some.jar包就在这里面。
然后测试运行，一切正常！
如果有多个jar包需要引用的情况：
Class-Path: lib/some.jar lib/some2.jar
每个单独的jar用空格隔开就可以了。注意使用相对路径。
另：如果META-INF 下包含INDEX.LIST文件的话，可能会使Class-Path配置失效。INDEX.LIST是Jar打包工具打包时生成的索引文件，删除对运行不产生影响。
方法四、自定义Classloader来加载
这种方法是终极解决方案，基本上那些知名java应用都是那么干的，如tomcat、jboss等等。
这种方式有点复杂，需要专门开贴讨论。关于ClassLoader的原理和自定义ClassLoader可以参考这篇http://cuixiaodong214.blog.163.com/blog/static/951639820099135859761
总结：
以上四种方法都可以用，特别是程序运行在非常单纯的环境中时。但是，如果是运行在多任务，多应用的环境中时，最好每个应用都能相互独立，第一种和第二种方案都有可能对其他应用产生影响，因此最好就是选择第三种和第四种。