由于作者对齐次坐标真的解释的不错，我就原封不动的摘抄过来：
对于一个向量v以及基oabc，可以找到一组坐标(v1,v2,v3)，使得v = v1 a + v2 b + v3 c （1）
而对于一个点p，则可以找到一组坐标（p1,p2,p3），使得 p – o = p1 a + p2 b + p3 c （2），
从上面对向量和点的表达，我们可以看出为了在坐标系中表示一个点（如p），我们把点的位置看作是对这个基的原点o所进行的一个位移，即一个向量——p – o（有的书中把这样的向量叫做位置向量——起始于坐标原点的特殊向量），我们在表达这个向量的同时用等价的方式表达出了点p：p = o + p1 a + p2 b + p3 c (3)
(1)(3)是坐标系下表达一个向量和点的不同表达方式。这里可以看出，虽然都是用代数分量的形式表达向量和点，但表达一个点比一个向量需要额外的信息。如果我写出一个代数分量表达(1, 4, 7)，谁知道它是个向量还是个点！
我们现在把（1）（3）写成矩阵的形式：v = (v1 v2 v3 0) X (a b c o)
p = (p1 p2 p3 1) X (a b c o),这里(a,b,c,o)是坐标基矩阵，右边的列向量分别是向量v和点p在基下的坐标。这样，向量和点在同一个基下就有了不同的表达：3D向量的第4个代数分量是0，而3D点的第4个代数分量是1。像这种这种用4个代数分量表示3D几何概念的方式是一种齐次坐标表示。
这样，上面的(1, 4, 7)如果写成（1,4,7,0），它就是个向量；如果是(1,4,7,1)，它就是个点。下面是如何在普通坐标(Ordinary Coordinate)和齐次坐标(Homogeneous Coordinate)之间进行转换：
(1)从普通坐标转换成齐次坐标时
如果(x,y,z)是个点，则变为(x,y,z,1);
如果(x,y,z)是个向量，则变为(x,y,z,0)
(2)从齐次坐标转换成普通坐标时
如果是(x,y,z,1)，则知道它是个点，变成(x,y,z);
如果是(x,y,z,0)，则知道它是个向量，仍然变成(x,y,z)
以上是通过齐次坐标来区分向量和点的方式。从中可以思考得知，对于平移T、旋转R、缩放S这3个最常见的仿射变换，平移变换只对于点才有意义，因为普通向量没有位置概念，只有大小和方向.
而旋转和缩放对于向量和点都有意义，你可以用类似上面齐次表示来检测。从中可以看出，齐次坐标用于仿射变换非常方便。
此外，对于一个普通坐标的点P=(Px, Py, Pz)，有对应的一族齐次坐标(wPx, wPy, wPz, w)，其中w不等于零。比如，P(1, 4, 7)的齐次坐标有(1, 4, 7, 1)、（2, 8, 14, 2）、（-0.1, -0.4, -0.7, -0.1）等等。因此，如果把一个点从普通坐标变成齐次坐标，给x,y,z乘上同一个非零数w，然后增加第4个分量w；如果把一个齐次坐标转换成普通坐标，把前三个坐标同时除以第4个坐标，然后去掉第4个分量。
由于齐次坐标使用了4个分量来表达3D概念，使得平移变换可以使用矩阵进行，从而如F.S. Hill, JR所说，仿射（线性）变换的进行更加方便。由于图形硬件已经普遍地支持齐次坐标与矩阵乘法，因此更加促进了齐次坐标使用，使得它似乎成为图形学中的一个标准。
以上很好的阐释了齐次坐标的作用及运用齐次坐标的好处。其实在图形学的理论中，很多已经被封装的好的API也是很有研究的，要想成为一名专业的计算机图形学的学习者，除了知其然必须还得知其所以然。这样在遇到问题的时候才能迅速定位问题的根源，从而解决问题。
首先，谈到矩阵，就离不开坐标变换，而3D坐标变换的基础是来源于线性代数。以下摘抄自孟岩的blog：
1 线性空间中的任何一个对象，通过选取基和坐标的办法，都可以表达为向量的形式。这里只要把基看成是线性空间里的坐标系就可以了。在线性空间中选定基之后，向量刻画对象，矩阵刻画对象的运动，用矩阵与向量的乘法施加运动。所以，矩阵的本质是运动的描述。
2 矩阵是线性空间中的线性变换的一个描述。在一个线性空间中，只要我们选定一组基，那么对于任何一个线性变换，都能够用一个确定的矩阵来加以描述。
3 矩阵不仅可以作为线性变换的描述，而且可以作为一组基的描述。而作为变换的矩阵，不但可以把线性空间中的一个点给变换到另一个点去，而且也能够把线性空间中的一个坐标系（基）表换到另一个坐标系（基）去。而且，变换点与变换坐标系，具有异曲同工的效果。线性代数里最有趣的奥妙，就蕴含在其中。
我们先讨论3*3矩阵：
1 矩阵的行序和列序（也称行优先或列优先）仅仅是指矩阵的存储方式，即我们如果用一个4*4数组m存储矩阵，如果m[0][0]-m[0][3]连续存储了矩阵的第一行，那么就是行优先，反之就是列优先。无论是行优先还是列优先，它们代表的数学意义是相同的。
2 如果矩阵是行序，那么它的第一列（m[0][0],m[1][0],m[2][0]）就代表X变换，第二列就是Y变换，第三列就是Z变换。
我们来看看为什么：
刚才提到矩阵把线性空间中的一个点给变换到另一个点，不妨称变换前的点为P1(x1,y1,z1)，变换后的点为P2(x2,y2,z2）：
那么根据线代中的矩阵乘法，P1 * M = P2展开就成了：
x2 = x1*m[0][0] + y1*m[1][0] + z1*m[2][0];
y2 = x1*m[0][1] + y1*m[1][1] + z1*m[2][1];
z2 = x1*m[0][2] + y1*m[1][2] + z1*m[2][2];
看出什么了吗？
如果把一个行序矩阵（接下来讨论的都是行序矩阵，就省略行序二字了）的每一列分别用X,Y,Z三个矢量来表示，那么M就表示为：XYZ三根轴。
现在，矩阵M看起来是不是很像一个坐标系？而P1到P2的变换就是P1分别与X,Y,Z的点积！
也就是矩阵M是把P1从老坐标系变换到新坐标系，而矩阵的三列（三根轴）就分别代表了新坐标系的三根轴在老坐标系中的坐标！
而点积的几何意义其实就是求取投影！所以坐标变换的几何本质（刚才已经讨论过其代数本质），就是把一个点分别投影到三根轴上去而已！
再仔细想一想，P1在XYZ三根轴上的投影，不正是它在新坐标系下的坐标吗？这样一来，坐标变换是不是就太容易理解了呢？
3 所以缩放矩阵M的三根轴，XYZ的模就不等于1，如果某一根轴的模不等于1，那么就有了对应的缩放。所以纯旋转矩阵，前三列的模必然等于1。
4 DX的矩阵是行序，OpenGL的矩阵是列序。我写的引擎，S3D的矩阵也是行序的。
最后说说4*4矩阵：
1 刚才讨论了旋转和缩放，平移如何表示呢？
x2 = x1*m[0][0] + y1*m[1][0] + z1*m[2][0] + Xt;
这里Xt就是表示x方向上的平移。Xt,Yt,Zt共同构成了一个4*4矩阵的第4行的前3列。
2 4*4矩阵的第4列初始情况下一般设置为0,0,0,1，这些值也被称为W，它代表了近大远小的比例关系。此时需要被变换的点（矢量），也必须增加一个元素，成为x,y,z,w，而w的初始值设置为1。注意这里的xyzw并不是四元数的概念，这里的w仅仅是为了配合4*4矩阵运算而存在的。
3 4*4矩阵实际上是为了把多步坐标变换并置而产生的，矩阵并置后可以用一个4*4矩阵代表多次坐标变换，从而显著提高顶点变换的效率。而且参与变换的W最终还可以用于透视校正和深度测试。
4 对于4*4矩阵的上三角阵（3*3矩阵）的理解，可以完全沿用刚才3*3矩阵的讨论。
注1：几何流水线坐标变换基本流程： Local->World->View->Projection->Homo->Viewport->Screen
注2：如果一个矩阵变换是线性的，那么它的转置与求逆等价。我们经常在一些逆变换（比如ShadowMap算法）中看到转置，不必疑惑，它的意义仍然是求逆。
注3：矩阵运算不满足交换律，所以会出现一些有趣的结果，比如M1代表一个旋转操作，M2代表一个平移操作，那么 P*M1*M2 就是先旋转再平移，而P*M2*M1就成了先平移在旋转。我们在实际3D编码中经常遇到这样的问题，就是一个物体是以自己为参照物旋转，还是以世界为参照物旋转，那么按照刚才的描述，假如Mw表示世界变换矩阵，如果Mw左乘M1，再作为最终变换矩阵，那么就是以自己为参照物旋转（很容易理解，因为是先旋转，才变换到世界坐标系嘛，所以这个旋转是定义在本地的），而如果Mw右乘M1，就是先变换到世界坐标系，再旋转了，这时当然就是以以世界为参照物旋转了。
注4：几个最基本的矩阵表达式，感兴趣的可以自己推导一下：
// | x 0 0 0 |
// | 0 y 0 0 |
// | 0 0 z 0 |
// | 0 0 0 1 | 缩放
// | 1 0 0 0 |
// | 0 1 0 0 |
// | 0 0 1 0 |
// | x y z 1 | 平移
// | 1 0 0 0 |
// | 0 c s 0 |
// | 0 -s c 0 |
// | 0 0 0 1 | X旋转 s,c表示旋转角的sin,cos值，下同
// | c 0 -s 0 |
// | 0 1 0 0 |
// | s 0 c 0 |
// | 0 0 0 1 | Y旋转
// | c s 0 0 |
// | -s c 0 0 |
// | 0 0 1 0 |
// | 0 0 0 1 | Z旋转
// | Sx*Sy*Sz + Cy*Cz Cx*Sz Sx*Cy*Sz - Sy*Cz 0 |
// | Sx*Sy*Cz - Cy*Sz Cx*Cz Sx*Cy*Cz + Sy*Sz 0 |
// | Cx*Sy -Sx Cx*Cy 0 |
// | 0 0 0 1 | ZXY旋转的并置