R学习 第十篇：包

包（Package）是实现特定功能的、预先写好的代码库（library），通俗地说，包是含有函数、数据等的功能模块。R拥有大量的软件包，许多包都是由某一领域的专家编写的，但并不是所有的包都有很高的质量。在使用包之前，最好到社区中了解其他网友的反馈。R预先安装了一系列的基础包，包括base、datasets、utils、grDevices、graphics、stats、以及methods，由于已经预先安装，因此，可以直接使用，提供了系统默认的函数和数据集。

一，包操作

在使用包之前，用户必须把包安装到本地的R引擎中；把包安装到本地之后，只有在包被引用之后，才可以引用包中的函数。

通常情况下，用户只需要知道如何安装包和引用包，就可以用R编程了，安装包和引用包的命令分别是：

install.packages("package-name")
library(package-name)

1，安装包

在使用包之前，必须把包安装到R引擎中，install.packages()函数用于从CRAN或本地下载和安装包：

install.packages(pkgs="package_name", lib)

参数注释：

• pkgs：包的名称，使用字符串来表示；
• lib：安装包的库路径，如果省略，那么默认值是函数 .libPaths()返回的第一个元素

注意，R将反斜杠视为一个转义字符，表示路径，要么使用"D:\mydata“，要么使用"D:/mydata"。

例如，把包ggplot2安装到默认的库路径中：

install.packages("ggplot2")

2，引用包和分离包

在安装包之后，若要使用包中的数据和函数，则必须把包载入（引用）到R会话中。R使用library()载入包，参数是包的名称，或是名称的字符串。

library(package_name)

当包被载入之后，R引擎把该包添加到包的搜索路径中。可以使用search()函数查看当前R会话搜索路劲。

search()

当把包载入后，可以使用search()函数查看当前R脚本可以直接应用搜索路径中的所有包。如果要把包从当前的搜索路径中移除，可以使用detach()函数，detach()是library()的逆操作。

detach(package:plyr)
detach("package:plyr",character.only = TRUE)

当把包从搜索路径中移除后，当前的R脚本不能直接引用该包。如果想要重新引用包中的函数或数据，必须使用library()函数重新引用该包。

3，查看已经安装的包

如果要查看已经安装到本地的包，可以使用installed.packages()，该函数返回一个矩阵（Matrix），列名主要有：包名（Package Name）、引用路径（Library Path）和版本号（Version Number），行名是包的名称（Package Name）。

installed.packages(lib.loc = NULL)

参数 lib.loc 是指要搜索的 R 库的路径。默认值是NULL，表示 libPaths()下面的所有路径。

> installed.packages(lib.loc = NULL)
                 Package            LibPath                                                Version      
assertthat       "assertthat"       "C:/Users/xxx/Documents/R/win-library/3.3"         "0.1"      

4，包的移除

如果把已安装的包从本地移除，可以使用remove.packages()函数，它是install.packages()的逆向操作。如果想要再次使用该包，那么必须重新把包安装到本地。

remove.packages(pkgs, lib)

参数注释：

• pkgs：用于指定包的名称；
• lib：用于指定要搜索的R库的的路径，从该路径下搜索要移除的包；如果不指定，那么lib 是 .libPaths() 返回的第一个元素。

二，查看包安装的路径

使用path.packages()函数可以直接查看包安装的路径，参数是包的名字（字符串）

> library(ggplot2)
> path.package("ggplot2")
[1] "C:/Users/xxx/Documents/R/win-library/3.5/ggplot2"

三，库路径

存储包的目录称作库（library），库的路径（也叫library tree）就是搜索包的位置。在本地中，库的路径不是唯一的，通过base包中的函数 .libPaths()查看库的所有路径：

> .libPaths()
[1] "C:/Users/xxx/Documents/R/win-library/3.5" "C:/Program Files/R/R-3.5.1/library" 

该函数返回的库路径，用于安装用户通过执行函数 install.packages() 安装的包。

R中预装的默认库的路径，和用户安装的库的路径是不相同的，默认库的安装路径的通过base包中的变量 .library 查看：

> .Library
[1] "C:/PROGRA~1/R/R-35~1.1/library"

该变量 .Library 表示默认库的路径。