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  • kerfdr软件包安装-R

    阅读到一篇比较早的文献,09年发表

    Mickael Guedj, Stephane Robin, Alain Celisse, et al.   Kerfdr: a semi-parametric kernel-based approach to local false discovery rate estimation[J]. BMC Bioinformatics, 2009, 10(1):1-12.

    涉及到一种半参数估计p值混合分布的方法,给出一个R语言软件包kerfdr,但是在目前的R 3.5.0的版本下安装出现问题,可以看一下问题:

    1:软件过老已经移出cran,但是可以在http://cran.cnr.berkeley.edu/src/contrib/Archive/kerfdr/ 下载,得到格式为 kerfdr_1.0.0.tar.gz,正常的安装出现问题如下:

         cran安装无用,安装tar.gz提示是无效的已经安装的程序包,上网查询无果

             

    2:解决办法是:

           install.packages("devtools")(之后安装一个Rtools)

           devtools::install_github("cran/kerfdr")

            

     3: 又出现新的问题,就是其中调用的C函数报错。。。。详情参看讨论  http://r.789695.n4.nabble.com/get-quot-massdist-quot-in-R-td4750980.html

        只是安装上了,但是程序运行还是有问题,太讨厌版本问题了,心塞。。。。。求help

           

        问题已经解决,想哭,安装了不知道几次,转换R版本为2.14(老版本的R语言地址 https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/),链接 http://cran.cnr.berkeley.edu/src/contrib/Archive/kerfdr/ 上下载软件包,手动安装结果竟然成了,同样的方法安装      在R 3.5.0上依然存在问题

           

           

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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/lmj-sky/p/9931981.html
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