引自http://www.cnblogs.com/acker/archive/2011/08/05/2128493.html
【转自】http://hi.baidu.com/roleya/blog/item/2981b4cc1a1d721b00e92848.html
新建网站与新建Asp.Net Web应用程序的区别
新建网站与新建Asp.Net Web 应用程序的区别，VS2005打sp1后，在要新做一个网站项目的时候，有两个选择：新建网站和新建 Asp.net
Web应用程序。那么选择 “新建网站”或 “新建 Asp.net
Web应用程序”各有什么利弊呢？我们该怎么选择？
上网查了一些资料，比较总结了一下，可能会对你有帮助。现在一直用Webapplication方式，感觉比较好用，适合相对较大一些的系统。WebSite模式也就是“新建网站”，比较适合中小型企业网站，下面具体介绍下。
WebApplication编程模型的优点：
●网站编译速度快，使用了增量编译模式，仅仅只有文件被修改后，这部分才会被增量编译进去。
●生成的程序集
新建网站与新建Asp.net Web应用程序的区别，WebSite：生成随机的程序集名，需要通过插件WebDeployment才可以生成单一程序集
WebApplication：可以指定网站项目生成单一程序集，因为是独立的程序集，所以和其他项目一样可以指定应用程序集的名字、版本、输出位置等信息
●可以将网站拆分成多个项目以方便管理
●可以从项目中和源代码管理中排除一个文件
●方便的支持VSTS的Team Build方便每日构建
●更强大的代码检查功能，并且检查策略受源代码控制
●可以对编译前后进行自己规定的处理
●对App_GlobalResources 的Resource强类支持（网上说的，还没有了解过）
●直接升级使用VS2003构建的大型系统
WebSite编程模型的优点：
●动态编译该页面，马上可以看到效果，不用编译整个站点（主要优势）
●同上，可以使错误的部分和使用的部分不相干扰（可以要求只有编译通过才能签入）
●可以每个页面生成一个程序集（一般不会采用这种方式）
●可以把一个目录当做一个Web应用来处理，直接复制文件就可以发布，不需要项目文件（适合小站点）
●可以把页面也编译到程序集中（应该用不到，而且WebApplication也可以通过WebDeployment插件来实现）
两种编程模型的互相转换：
新建网站与新建Asp.net Web应用程序的区别，VS2005 SP1内置了转换程序，可以非常方便的从WebSite转换到WebApplication，只需要复制文件，右键执行“转换为Web应用程序”即可。
新建网站与新建Asp.net Web应用程序的区别，暂时未查到有专门的反向转换工具，但比较后发现如果转换也非常简单，删除所有*.designer.cs，将*.aspx、*.ascx、*.master页面文件中的 Codebehind="******.aspx.cs" 批量替换成CodeFile="******.aspx.cs"，这样就可以转换回来了。
上网查了一些资料，比较总结了一下，可能会对你有帮助。现在一直用Webapplication方式，感觉比较好用，适合相对较大一些的系统。WebSite模式也就是“新建网站”，比较适合中小型企业网站，下面具体介绍下。
WebApplication编程模型的优点：
●网站编译速度快，使用了增量编译模式，仅仅只有文件被修改后，这部分才会被增量编译进去。
●生成的程序集
新建网站与新建Asp.net Web应用程序的区别，WebSite：生成随机的程序集名，需要通过插件WebDeployment才可以生成单一程序集
WebApplication：可以指定网站项目生成单一程序集，因为是独立的程序集，所以和其他项目一样可以指定应用程序集的名字、版本、输出位置等信息
●可以将网站拆分成多个项目以方便管理
●可以从项目中和源代码管理中排除一个文件
●方便的支持VSTS的Team Build方便每日构建
●更强大的代码检查功能，并且检查策略受源代码控制
●可以对编译前后进行自己规定的处理
●对App_GlobalResources 的Resource强类支持（网上说的，还没有了解过）
●直接升级使用VS2003构建的大型系统
WebSite编程模型的优点：
●动态编译该页面，马上可以看到效果，不用编译整个站点（主要优势）
●同上，可以使错误的部分和使用的部分不相干扰（可以要求只有编译通过才能签入）
●可以每个页面生成一个程序集（一般不会采用这种方式）
●可以把一个目录当做一个Web应用来处理，直接复制文件就可以发布，不需要项目文件（适合小站点）
●可以把页面也编译到程序集中（应该用不到，而且WebApplication也可以通过WebDeployment插件来实现）
两种编程模型的互相转换：
新建网站与新建Asp.net Web应用程序的区别，VS2005 SP1内置了转换程序，可以非常方便的从WebSite转换到WebApplication，只需要复制文件，右键执行“转换为Web应用程序”即可。
新建网站与新建Asp.net Web应用程序的区别，暂时未查到有专门的反向转换工具，但比较后发现如果转换也非常简单，删除所有*.designer.cs，将*.aspx、*.ascx、*.master页面文件中的 Codebehind="******.aspx.cs" 批量替换成CodeFile="******.aspx.cs"，这样就可以转换回来了。
～～～～～～～～～～～～～～整理～～～～～～～～～～～～
web应用程序有重新生成和发布两项；Web网站只有一个发布网站。
web应用程序和一般的winform没有什么区别都有引用的是命名空间等；Web网站在引用后出现一个bin文件夹那里存放dll和pdb文件。
web应用程序可以作为类库被引用；Web网站则不可以作为类库被引用。
web应用程序可以添加ASP.Net文件夹中不包括bin、App_Code；Web网站可以添加ASP.Net文件夹包括bin、App_Code。
web应用程序还可添加组件和类；Web网站则没有。
源文件虽然都是Default.aspx.cs但是web应用程序有命名空间，多了一项System.Collections空间引用。
Web应用程序在修改了页面底层的代码之后需要重新进行编译
网站不需要重新编译
网站可以添加APS文件夹，Web应用程序不可以
Web应用程序的项目会生成Dll文件
网站在发布的时候，会自动生成Dll文件，但是每次的Dll文件名都不一样
Web应用程序会有解决方案和项目文件
web应用程序和一般的winform没有什么区别都有引用的是命名空间等；Web网站在引用后出现一个bin文件夹那里存放dll和pdb文件。
web应用程序可以作为类库被引用；Web网站则不可以作为类库被引用。
web应用程序可以添加ASP.Net文件夹中不包括bin、App_Code；Web网站可以添加ASP.Net文件夹包括bin、App_Code。
web应用程序还可添加组件和类；Web网站则没有。
源文件虽然都是Default.aspx.cs但是web应用程序有命名空间，多了一项System.Collections空间引用。
Web应用程序在修改了页面底层的代码之后需要重新进行编译
网站不需要重新编译
网站可以添加APS文件夹，Web应用程序不可以
Web应用程序的项目会生成Dll文件
网站在发布的时候，会自动生成Dll文件，但是每次的Dll文件名都不一样
Web应用程序会有解决方案和项目文件