操作系统的组织结构应包括模块化结构、接口和运行时的组织结构。
模块化结构：描述组成系统的不同功能如何分组和交互；
接口：与系统内部结构密切相关，由操作系统提供给用户、用户程序或上层软件使用；
运行时的组织结构：定义了执行过程中存在的实体类型及调用方式。
在操作系统的设计中，有如下4种设计方法：
一体化结构
特点：操作系统的运行效率高，但这种结构难以理解、难以维护、验证其正确性也十分困难。
模块化结构
优点：系统能作为抽象数据类型或者对象方法来实现，这样有利于操作系统的理解和维护。
缺点：存在潜在的性能退化。
可扩展内核结构
特点：这种体系结构支持操作系统中两个新方向：一是在单一的硬件平台上建立具有不同策略的操作系统；二是微内核操作系统。
层次化结构
对于现代操作系统来说，分层结构的限制过于严格，很少采用这种方法来构造操作系统。然后在设计操作系统是，分层的思想方法是值得借鉴和参考的。