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  • [stat.simulation] Hasting-Metropolis Algorithm

    • 问题背景:我们有一些观测数据X,这些数据假设是取值为1,...,m;我们还知道每个数据观测到的频数为:

      但是我们现在无法计算B的大小。(这是一个假设,毕竟计算一串数字的和不是难事)

    • 问题: 我们需要通过仿真产生一串随机变量,并且它们的概率分布函数为:

    • 分析:如果B是可以计算的,那么(j)自然也是可以计算的。然后自然很容易随机生成服从这个概率分布的一串随机数。但是B不能计算。。。我们可以采用一个曲线救国的方案。

      直观上来考虑这个问题,产生随机数时是一个一个地产生随机数,每个随机数取值为1,...,m中某一个。我们可以:

    1)把一个随机数看成一个状态;

    2)一个随机数的产生取决于前一个随机数,那么每个状态取决于前一个状态;

    • 问题等效:对于状态{1,...,m},有某个Markov Chain状态转移矩阵P,,随机选择一个初始状态,根据状态转移矩阵P,,依次产生一个状态序列。但是,重点是我们需要设计这个转移矩阵P,使得最终的产生的状态序列的概率分布为,也就是说这个Markov Chain的最终稳定状态时各个状态的概率分布为
    • Hasting-Metropolis算法描述

      算法引入了一个随机选择的Markov Chain转移矩阵Q,。注意Q不是上面讲的P,而是用来构造P的一个辅助状态转移矩阵。构造的过程:

    1) 根据Q,从当前状态,设为i,转移到状态下一个状态,设为j;

    2)引入另一个概率函数,这个概率决定转移到下一个状态j或者停留在现在的状态i;

    结合上述1,2)可以得到一个新的转移矩阵,并且可以经过精心构造,使得这个矩阵作为解决“等效问题”中的P矩阵,下面来看如何“精心构造”:

    根据1,2)

        根据平稳Markov Chain的“时序可逆”性质:

    or

     

     因为是一个概率值,必须小于1,所以最终的构造为:

    但是是未知的(因为B无法求值),好在上式中是(i)/(j)=b(i)/b(j),那么:

    • Hasting-Metropolis算法流程

    1) 选择一个不可约Markov Chain概率转移矩阵;随机选择初始状态;

    2)  let n=1, X[n]=k;

    3) 生成随机数,生成随机数 U∈(0, 1)

    4) 如果,则选择NS=X;否则选择NS=X[n];

    5) n=n+1, X[n]=NS;

    6) go to 3)

    说明,以上在讨论函数和算法流程中,都没有特别考虑i = j的情况。原因是i=j时“不失一般性”。此时=1,算法步骤4)一定会选择NS=X,而此时X==X[n]。所以,算法步骤3)中如果产生的X==X[n],那么4)定然会保持原来状态从而X[n+1]<-X[n]。

    • 仿真例子

    通过R语言实现用H-M算法采样服从混合高斯分布密度函数。

    主程序:

    source("intgMatrix.R")
    source("sampleByPr.R")
    
    FF = 10000# sample points
    
    br<-rnorm(FF/2, 0, 10)
    br2<-rnorm( FF/2, 60, 10)
    br <- c(br, br2)
    br<-round(br)
    
    tbl <- table(br)
    
    b<-unname(tbl)   # a sequence of number
    
    m <- length(b)
    #generate Q
    r<-c()
    for(i in 1:m)
    {
      r_ <- runif(m, 0, 1)
      r_ <- r_ / sum(r_)  # nomalize
      r<- c(r, r_)
    }
    Q<- t(matrix(r, m, m))
    Qint <- intgMatrix(Q)     # row-based integral
    
    # start to sample sn data
    sn = FF  # #sample
    X <- c()  # sample data (index of b)
    
    # initial step
    k<- round(runif(1, 1, m)) 
    X[1] <- k
    
    # interation steps
    for(n in 1:(sn-1))
    {
      PrX_j <- Qint[X[n], ]  # last sample's index as row-index in Q
      while(TRUE){
        X_tmp <- X[n]
        X_tmp <- sampleByPr(PrX_j) # the index of X[n]
        if(X_tmp != X[n]){
          break
        }
      }
      
      U <- runif(1, 0, 1) 
      # for alph(i, j)
      al_ <- (b[X_tmp] * Q[X_tmp, X[n]]) / (b[X[n]] * Q[X[n], X_tmp])
      if(al_ > 1){al_ <- 1}
      NS <- X[n]
      if(U < al_) {
        NS <- X_tmp
      }
      
      X[n + 1] <- NS
      
    }
    
    # plot
    
    
    bnn<-as.numeric(b)
    plot(1:length(bnn),bnn,col="red")
    Xnn <- as.numeric(table(X))
    lines(1:length(Xnn),Xnn/rt,col="green")
    

     概率积分矩阵,Qi[i,k]=∑j=1,..,kQ[i,j]

    intgMatrix <- function(Q)
    {
      Qi<-matrix(nrow=dim(Q)[1], ncol = dim(Q)[2])
      Qi[, 1] = Q[,1]
      for(i in 1:dim(Q)[1]){
        for(j in 2:dim(Q)[2]){
          Qi[i,j] <- Qi[i, j- 1] + Q[i, j]
        }
      }
      return(Qi)
    }
    

    根据概率积分向量生成采样点。

    概率积分向量pi[i]=∑j=1,..,ip[i],其中p[i]=Pr{X=i}为原始概率分布

    sampleByPr <- function(Pr_vector)
    {
      ru <- runif(1,0,1)
      
      for(i in 1:length(Pr_vector)){
        if(Pr_vector[i] > ru){
          return(i)
        }
      }
    }
    
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  • 原文地址:https://www.cnblogs.com/luweiseu/p/3203757.html
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