1、所有的InnoDB表都设计一个无业务用途的自增列做主键，对于绝大多数场景都是如此，真正纯只读用InnoDB表的并不多，真如此的话还不如用TokuDB来得划算；
2、字段长度满足需求前提下，尽可能选择长度小的。此外，字段属性尽量都加上NOT NULL约束，可一定程度提高性能；
3、尽可能不使用TEXT/BLOB类型，确实需要的话，建议拆分到子表中，不要和主表放在一起，避免SELECT * 的时候读性能太差。
4、读取数据时，只选取所需要的列，不要每次都SELECT *，避免产生严重的随机读问题，尤其是读到一些TEXT/BLOB列；
5、对一个VARCHAR(N)列创建索引时，通常取其50%(甚至更小)左右长度创建前缀索引就足以满足80%以上的查询需求了，没必要创建整列的全长度索引；
6、通常情况下，子查询的性能比较差，建议改造成JOIN写法；
7、多表联接查询时，关联字段类型尽量一致，并且都要有索引；
8、多表连接查询时，把结果集小的表(注意，这里是指过滤后的结果集，不一定是全表数据量小的)作为驱动表；
9、多表联接并且有排序时，排序字段必须是驱动表里的，否则排序列无法用到索引；
10、多用复合索引，少用多个独立索引，尤其是一些基数(Cardinality)太小(比如说，该列的唯一值总数少于255)的列就不要创建独立索引了；
11、类似分页功能的SQL，建议先用主键关联，然后返回结果集，效率会高很多
关于MySQL的管理维护的其他建议有:
1、通常地，单表物理大小不超过10GB，单表行数不超过1亿条，行平均长度不超过8KB，如果机器性能足够，这些数据量MySQL是完全能处理的过来的，不用担心性能问题，这么建议主要是考虑ONLINE DDL的代价较高；
2、不用太担心mysqld进程占用太多内存，只要不发生OOM kill和用到大量的SWAP都还好；
3、在以往，单机上跑多实例的目的是能最大化利用计算资源，如果单实例已经能耗尽大部分计算资源的话，就没必要再跑多实例了；
4、定期使用pt-duplicate-key-checker检查并删除重复的索引。定期使用pt-index-usage工具检查并删除使用频率很低的索引；
5、定期采集slow query log，用pt-query-digest工具进行分析，可结合Anemometer系统进行slow query管理以便分析slow query并进行后续优化工作；
6、可使用pt-kill杀掉超长时间的SQL请求，Percona版本中有个选项 innodb_kill_idle_transaction 也可实现该功能；
7、使用pt-online-schema-change来完成大表的ONLINE DDL需求；
8、定期使用pt-table-checksum、pt-table-sync来检查并修复mysql主从复制的数据差异；
关于最重要的参数选项调整建议:
选择Percona或MariaDB版本的话，强烈建议启用thread pool特性，可使得在高并发的情况下，性能不会发生大幅下降。此外，还有extra_port功能，非常实用， 关键时刻能救命的。还有另外一个重要特色是 QUERY_RESPONSE_TIME 功能，也能使我们对整体的SQL响应时间分布有直观感受；
2、设置default-storage-engine=InnoDB，也就是默认采用InnoDB引擎，强烈建议不要再使用MyISAM引擎了，InnoDB引擎绝对可以满足99%以上的业务场景；
3、调整innodb_buffer_pool_size大小，如果是单实例且绝大多数是InnoDB引擎表的话，可考虑设置为物理内存的50% ~ 70%左右；
4、根据实际需要设置innodb_flush_log_at_trx_commit、sync_binlog的值。如果要求数据不能丢失，那么两个都设为1。如果允许丢失一点数据，则可分别设为2和10。而如果完全不用care数据是否丢失的话(例如在slave上，反正大不了重做一次)，则可都设为0。这三种设置值导致数据库的性能受到影响程度分别是：高、中、低，也就是第一个会另数据库最慢，最后一个则相反；
5、设置innodb_file_per_table = 1，使用独立表空间，我实在是想不出来用共享表空间有什么好处了；
6、设置innodb_data_file_path = ibdata1:1G:autoextend，千万不要用默认的10M，否则在有高并发事务时，会受到不小的影响；
7、设置innodb_log_file_size=256M，设置innodb_log_files_in_group=2，基本可满足90%以上的场景；
8、设置long_query_time = 1，而在5.5版本以上，已经可以设置为小于1了，建议设置为0.05(50毫秒)，记录那些执行较慢的SQL，用于后续的分析排查；
9、根据业务实际需要，适当调整max_connection(最大连接数)、max_connection_error(最大错误数，建议设置为10万以上，而open_files_limit、innodb_open_files、table_open_cache、table_definition_cache这几个参数则可设为约10倍于max_connection的大小；
10、常见的误区是把tmp_table_size和max_heap_table_size设置的比较大，曾经见过设置为1G的，这2个选项是每个连接会话都会分配的，因此不要设置过大，否则容易导致OOM发生；其他的一些连接会话级选项例如：sort_buffer_size、join_buffer_size、read_buffer_size、read_rnd_buffer_size等，也需要注意不能设置过大；
11、由于已经建议不再使用MyISAM引擎了，因此可以把key_buffer_size设置为32M左右，并且强烈建议关闭query cache功能；