因为 Linux 的开发人员实在太多了，如果每个人都使用自己的目录配置方法，那么将可能会带来很多管理问题。所以，后来就有了 Filesystem Hierarchy Standard（FHS，文件系统层次化标准）标准的出炉了，多数Linux版本采用这种文件组织形式，类似于Windows操作系统中c盘的文件目录，FHS采用树形结构组织文件。
根据 FHS 的官方文件指出，其主要目的是希望让用户可以了解到数据通常放置于哪个目录下。也就是说，FHS 的重点在于规范每个特定的目录下应该要放置什么样子的数据。
FHS 依据文件系统使用的频繁与否与是否用户随意改动，而将目录定义成四种交互作用的形态：
可分享的：可以分享给其他系统挂载使用的目录，所以包括执行文件与用户的邮件等数据，是能够分享给网络上其他主机挂载用的目录。
不可分享的：自己机器上面运行的设备文件或者是与程序有关的 socket 文件等，由于仅与自身机器有关，所以不适合分享给其他主机。
不变的：有些数据是不会经常变动的，只会随着系统版本而变动。例如函数库、说明文件、系统管理员所管理的主机服务配置文件等。
可变动的：经常改变的数据，例如登录文件、用户文件等。
根目录（/）
根目录是整个系统最重要的一个目录，因为不但所有的目录都是由根目录衍生出来的，同时根目录也与开机、还原、系统修复等操作有关。
因此 FHS 标准建议：根目录（/）所在分区应该越小越好，且应用程序所安装的软件最好不要与根目录放在同一个分区内，保持根目录越小越好。如此不但性能较好，根目录所在的文件系统也比较不容易发生问题。
执行文件目录（/bin）
系统有很多放置执行文件的目录，但 /bin 比较特殊。因为 /bin 放置的是在单用户维护模式下还能被操作的命令。在 /bin 下面的命令可以被 root 与一般账号所使用，主要有 cat，chmod，chown，date，mv，mkdir，cp，bash 等常用的命令。
开机文件目录（/boot）
这个目录主要放置开机会使用到的文件，包括 Linux 内核文件以及开机菜单与开机所需配置文件等。
驱动设备目录（/dev）
在 Linux 系统上，任何设备与接口设备都是以文件的形式存在于这个目录当中的。你只要通过访问这个目录下面的某个文件，就等于访问某个设备。比较重要的文件有 /dev/null，/dev/zero，/dev/tty 等。
配置文件目录（/etc）
系统主要的配置文件几乎都放置在这个目录内，例如人员的账号密码文件、各种服务的起始文件等。一般来说，这个目录下的各个文件属性是可以让一般用户查阅的，但只有 root 有权利修改。比较重要的文件有 /etc/init.d，/etc/inittab，/etc/sysconfig 等。
用户主文件夹（/home）
这是系统默认的用户主文件夹（home directory）。在你创建一个一般用户账号时，默认的用户主文件夹都会规范到这里来。~ 代表当前用户的主文件夹。
系统函数库（/lib）
系统的函数库非常多，而 /lib 放置的则是在开机时会用到的函数库，以及在 /bin 或 /sbin 下面的命令会调用的函数库而已。
* 你可以把函数库想象成是“外挂”，某些命令必须要有这些“外挂”才能够顺利完成程序的执行之意。
媒体设备暂挂区（/media）
media 是“媒体”的英文，顾名思义，这个 /media 下面放置的就是可删除的设备。包括软盘、光盘、DVD等设备都暂时挂载于此。常见的文件名有 /media/floppy，/media/cdrom 等。
额外设备暂挂区（/mnt）
如果你想要暂时挂载某些额外的设备，一般建议你可以放置到这个目录中。在比较早的时候，这个目录的用途与 /media 相同。只是有了 /media 之后，这个目录就被用来暂时挂载用了。
第三方软件安装目录（/opt）
这个目录是用于安装第三方应用程序的，可以由用户自己指定安装位置。当需要卸载第三方应用程序时，可以直接删除安装目录，而不影响系统其它任何设置。
管理员主文件夹（/root）
系统管理员（root）的主文件夹。之所以放在这里，是因为如果进入单用户维护模式而仅挂载根目录时，该目录就能够拥有root的主文件夹，所以我们会希望root的主文件夹与根目录放置在同一个分区中。
重要系统执行文件（/sbin）
Linux 有非常多的命令是来设置系统环境的，这些命令只有 root 才能够利用来“设置”系统，其他用户最多只能用来“查询”而已。放在 /sbin 下面的为开机过程中所需的，里面包括了开机、修复、还原系统所需要的命令。
服务数据存放目录（/srv）
srv 可以视为“service”的缩写，是一些网络服务启动之后，这些服务所需要取用的数据目录。常见的服务例如 WWW、FTP 等。举例来说，WWW 服务需要的网页数据就可以放置在 /srv/www/ 里。
临时文件存放目录（/tmp）
这是让一般用户或者是正在执行的程序暂时放置文件的地方。这个目录是任何人都能够访问，所以你需要定期清理一下。当然，重要数据不可放置在此目录，因为系统会不定期将 /tmp 目录下的数据全部删除。
丢失内容修复目录（/lost+found）
这个目录是使用标准的 ext2/ext3 文件系统格式才会产生的一个目录，目的相当于文件系统发生错误时，将一些丢失的片段放置到这个目录下。这个目录通常会在分区的最顶层存在。
虚拟文件系统目录（/proc）
这个目录本身是一个虚拟文件系统（virtual filesystem）。它放置的数据都是在内存当中，例如系统内核、进程、外部设备以及网络状态等。因为这个目录下的数据都是在内存当中的，所以本身并不占任何硬盘空间。
虚拟文件系统目录（/sys）
这个目录其实跟 /proc 非常类似，也是一个虚拟的文件系统，主要也是记录与内核相关的信息。包括目前已加载的内核模块与内核检测到的硬件设备信息等。这个目录同样不占硬盘容量。
系统软件资源目录（/usr）
很多小白都会误以为 /usr 是 user 的缩写，其实 usr 是 Unix Software Resource 的缩写，也就是 “UNIX 操作系统软件资源” 所放置的目录，而不是用户的数据，这点需要注意。
FHS 建议所有软件开发者应该将他们的数据合理地分别放置到这个目录下的子目录，而不要自行新建该软件的独立目录。
/usr/bin/：绝大部分的用户可使用命令都放在这里
/usr/include/：C/C++等程序语言的头文件（header）与包含文件（include）放置处
/usr/lib/：包含各应用软件的函数库、目标文件以及一些不被一般用户惯用的执行文件或脚本
/usr/local/：系统管理员在本机自行安装下载的软件建议安装到此目录
/usr/sbin/：非系统正常运行所需的系统命令
/usr/share/：放置共享文件的地方
/usr/src/：一般源码建议放置到这里
常态可变动文件目录（/var）
该目录主要针对常态性可变动文件，包括缓存（cache）、登录文件（log file）以及某些软件运行所产生的文件，包括程序文件（lock file、run file），或者例如MySQL数据库的文件等。
如果 /usr 是安装时会占用较大硬盘容量的目录，那么 /var 就是在系统运行后才会渐渐占用硬盘容量的目录。
/var/cache/：应用程序本身运行过程中会产生的一些暂存文件
/var/lib/：程序本身执行的过程中，需要使用到的数据文件放置的目录
/var/lock/：目录下的文件资源一次只能被一个应用程序所使用
/var/log/：放置登录文件的目录
/var/mail/：放置个人电子邮件信箱的目录
/var/run/：某些程序或服务启动后的PID目录
/var/spool/：放置排队等待其他应用程程序使用的数据
文件颜色代表含义：
蓝色表示目录；
绿色表示可执行文件；
红色表示压缩文件；
浅蓝色表示链接文件；
白色表示其他文件；
黄色是设备文件，包括block，char，fifo